一种检测诊断先天性甲状腺疾病致病基因的DNA文库及其应用制造技术

本发明专利技术涉及一种通过靶向高通量测序技术检测诊断先天性甲状腺疾病致病基因的DNA文库及其应用，该文库包括362个先天性甲状腺疾病的致病基因。本发明专利技术优选362个先天性甲状腺疾病致病基因，设计探针池，建立针对362个先天性甲状腺疾病致病基因的目标区域文库，文库利用高通量测序技术进行测序，寻找致病突变，为临床诊断提供遗传学和分子生物学依据。本发明专利技术具有准确、快速、灵活、低成本的特点，本发明专利技术涉及的362个基因针对甲状腺形态异常(发育不良、易位、缺如)、甲状腺功能异常、家族性甲状腺肿瘤等几乎全部先天性甲状腺疾病的致病基因，对先天性甲状腺疾病的诊断、鉴别诊断和个体化治疗有着重要的意义和临床价值。有着重要的意义和临床价值。有着重要的意义和临床价值。

【技术实现步骤摘要】
一种检测诊断先天性甲状腺疾病致病基因的DNA文库及其应用


[0001]本专利技术属于生物医药
，具体涉及一种通过靶向高通量测序技术检测诊断先天性甲状腺疾病致病基因的DNA文库及其应用。

技术介绍

[0002]甲状腺是脊椎动物非常重要的腺体，属于内分泌器官。在哺乳动物位于颈部甲状软骨下方，气管两旁。人类的甲状腺形似蝴蝶，犹如盾甲，故名。甲状腺控制能量代谢速度、制造蛋白质、调节身体对其他激素的敏感性。甲状腺借由制造甲状腺素来调控代谢、生长发育、调节身体各器官系统。甲状腺也生产降钙素，调节体内钙的平衡。
[0003]甲状腺的正常发育和功能受多种基因的调控，这些基因的功能异常可导致甲状腺形态异常(发育不良、易位、缺如)、功能异常(减低、亢进)、家族性甲状腺肿瘤等，这些甲状腺疾病的发病要显著早于非遗传性甲状腺疾病，甚至在出生前或出生后不久发病，因此统称为先天性甲状腺疾病，与之相关的基因被称为先天性甲状腺疾病致病基因。
[0004]以先天性甲状腺疾病中的先天性肾上腺皮质增生症为例，先天性肾上腺皮质增生症是全球最常见的可预防的呆小症原因之一，由甲状腺激素分泌不足所致，发病率为1:4000
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1:3000。先天性肾上腺皮质增生症患儿若早期得不到及时的甲状腺激素治疗，会造成永久性的身材矮小和智力障碍，即呆小症。已发现有20种基因与先天性肾上腺皮质增生症有关，患儿如在出生后3个月内及时发现致病基因并进行针对性的个体化治疗，身体发育和智力可以基本接近正常人，因此，发现先天性甲状腺疾病的致病基因，早期诊断早治疗，可有效减轻国家和家庭负担。
[0005]已知先天性甲状腺疾病的发病机制多种多样，一种致病基因甚至可以导致完全相反的临床表现，例如TSHR基因致病变异可同时导致甲状腺功能亢进、甲状腺功能减退、甲状腺肿瘤。因此准确诊断这些先天性甲状腺疾病只能利用基因检测。目前，临床实验室检测基因突变大多采用传统的Sanger测序法，而如果对先天性甲状腺疾病的众多致病基因同时检测，不仅工作量巨大，而且导致检测效率低，更重要的是浪费珍贵的DNA样本、明显增加基因诊断的检测成本，严重制约了其在临床分子诊断中的大规模应用。因此，有必要寻求一种新的检测先天性甲状腺疾病致病基因突变的方法，提高诊断准确率，降低成本和劳动强度并提高时效性。

技术实现思路

[0006]本专利技术的目的之一在于提供一种能够提高诊断准确率、降低成本和劳动强度的通过靶向高通量测序技术检测诊断先天性甲状腺疾病致病基因的DNA文库。
[0007]本专利技术的目的之二在于提供所述DNA文库的应用。
[0008]本专利技术的目的通过如下技术方案实现：一种基于高通量测序技术诊断先天性甲状腺疾病的DNA文库，该文库包括362个先天性甲状腺疾病致病基因，其中，所述362个先天性
甲状腺疾病致病基因如下：
[0009]ABCC6、ACP5、ADA、ADAMTSL1、ADAR、ADAT3、ADNP、AFF4、AIP、AIRE、AKT1、ALG8、ALMS1、ALX4、APC、APOE、ARL6IP6、ARNT2、ARVCF、ATRX、B3GLCT、BAZ1B、BCL10、BCOR、BIRC3、BMP4、BMPR1A、BRAF、BTNL2、BUB1、BUB1B、BUB3、C1QBP、C1S、CACNA1C、CACNA1S、CASP10、CASR、CCBE1、CDC73、CDH23、CDKN1A、CDKN1B、CDKN2B、CDKN2C、CDON、CEP128、CEP57、CHD7、CLCNKB、CLIP2、CLPB、COL7A1、COMT、CP、CTLA4、CTNNB1、CTNS、DACT1、DCAF17、DCLRE1C、DDOST、DEAF1、DICER1、DIO1、DIO2、DISP1、DLL1、DMXL2、DNAH1、DNAJC19、DNM1L、DUOX1、DUOX2、DUOXA1、DUOXA2、ECE1、EDN3、EDNRB、EFEMP2、EIF2AK3、ELN、ENPP1、EPCAM、ERCC1、EXOSC2、EXT2、EYA1、FAN1、FANCI、FAS、FASLG、FBLN5、FDX2、FGF8、FGFR1、FLCN、FLII、FMR1、FOXA2、FOXD3、FOXE1、FOXH1、FOXI1、FOXP1、FOXP3、FUCA1、FUT8、GABRA3、GABRD、GAS1、GATA1、GATA6、GCH1、GCM2、GDNF、GLI2、GLI3、GLIS3、GNAS、GNB1、GNE、GP1BB、GPC1、GPR161、GPR35、GREM1、GTF2I、GTF2IRD1、HABP2、HBB、HESX1、HHEX、HIRA、HNF1B、HNF4A、HPD、HR、HSD17B3、IDH1、IDH2、IFIH1、IFNG、IGSF1、IL12A、IL12RB1、IL2RA、IL2RG、IL7R、INSR、IQSEC2、IRF5、ITCH、IYD、JAG1、JMJD1C、KAT6B、KCNAB2、KCNJ10、KCNJ18、KDM6A、KEAP1、KIAA0556、KISS1R、KLLN、KMT2D、KRAS、LEP、LEPR、LHX3、LHX4、LIFR、LIG4、LIMK1、LMNA、LRBA、LRP4、MALT1、MARS、MC2R、MCM8、MEN1、MINPP1、MLH1、MLH3、MLXIPL、MMEL1、MMP14、MMP2、MRAP、MSH2、MSH3、MSH6、MST1、MSTO1、NF2、NIN、NKX2
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1、NKX2
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5、NLRP1、NNT、NODAL、NPHS1、NR1D1、NRAS、NRTN、NSDHL、OPA1、OTX2、PAX8、PCSK1、PDE4D、PDGFB、PDGFRB、PHF21A、PIEZO1、PIK3C2A、PIK3CA、PLAA、PLCG2、PLVAP、PMM2、PMS1、PMS2、POGZ、POLG、POLG2、POLR1C、POLR1D、POLR3A、POMC、POU1F1、POU2AF1、POU3F4、PPP1R15B、PRDM16、PRKAR1A、PRKCD、PROKR2、PROP1、PTCH1、PTEN、PTGS1、PTGS2、PTH2、PTPN22、PTRH2、RAG1、RAG2、RAI1、RASGRP1、RBM28、RCBTB1、RERE、RET、RFC2、RMRP、RNASEH2A、RNASEH2B、RNASEH2C、RNF4、ROBO1、RPS20、RREB1、RRM2B、SAA1、SALL1、SAMHD1、SASH1、SCN4A、SDHB、SDHC、SDHD、SEC23B、SEC24C、SECISBP2、SEMA3C、SEMA3D、SEMA3E、SEMA4A、SETBP1、SGPL1、SHH、SIX1、SIX3、SKI、SKIV2L、SLA、SLC12A3、SLC16A2、SLC25A4、SLC26A4、SLC35A2、SLC5A5、SLC6A1本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种基于高通量测序技术诊断先天性甲状腺疾病的DNA文库，其特征在于，该文库包括362个先天性甲状腺疾病的致病基因，其中所述362个先天性甲状腺疾病的致病基因如下：ABCC6、ACP5、ADA、ADAMTSL1、ADAR、ADAT3、ADNP、AFF4、AIP、AIRE、AKT1、ALG8、ALMS1、ALX4、APC、APOE、ARL6IP6、ARNT2、ARVCF、ATRX、B3GLCT、BAZ1B、BCL10、BCOR、BIRC3、BMP4、BMPR1A、BRAF、BTNL2、BUB1、BUB1B、BUB3、C1QBP、C1S、CACNA1C、CACNA1S、CASP10、CASR、CCBE1、CDC73、CDH23、CDKN1A、CDKN1B、CDKN2B、CDKN2C、CDON、CEP128、CEP57、CHD7、CLCNKB、CLIP2、CLPB、COL7A1、COMT、CP、CTLA4、CTNNB1、CTNS、DACT1、DCAF17、DCLRE1C、DDOST、DEAF1、DICER1、DIO1、DIO2、DISP1、DLL1、DMXL2、DNAH1、DNAJC19、DNM1L、DUOX1、DUOX2、DUOXA1、DUOXA2、ECE1、EDN3、EDNRB、EFEMP2、EIF2AK3、ELN、ENPP1、EPCAM、ERCC1、EXOSC2、EXT2、EYA1、FAN1、FANCI、FAS、FASLG、FBLN5、FDX2、FGF8、FGFR1、FLCN、FLII、FMR1、FOXA2、FOXD3、FOXE1、FOXH1、FOXI1、FOXP1、FOXP3、FUCA1、FUT8、GABRA3、GABRD、GAS1、GATA1、GATA6、GCH1、GCM2、GDNF、GLI2、GLI3、GLIS3、GNAS、GNB1、GNE、GP1BB、GPC1、GPR161、GPR35、GREM1、GTF2I、GTF2IRD1、HABP2、HBB、HESX1、HHEX、HIRA、HNF1B、HNF4A、HPD、HR、HSD17B3、IDH1、IDH2、IFIH1、IFNG、IGSF1、IL12A、IL12RB1、IL2RA、IL2RG、IL7R、INSR、IQSEC2、IRF5、ITCH、IYD、JAG1、JMJD1C、KAT6B、KCNAB2、KCNJ10、KCNJ18、KDM6A、KEAP1、KIAA0556、KISS1R、KLLN、KMT2D、KRAS、LEP、LEPR、LHX3、LHX4、LIFR、LIG4、LIMK1、LMNA、LRBA、LRP4、MALT1、MARS、MC2R、MCM8、MEN1、MINPP1、MLH1、MLH3、MLXIPL、MMEL1、MMP14、MMP2、MRAP、MSH2、MSH3、MSH6、MST1、MSTO1、NF2、NIN、NKX2
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【专利技术属性】
技术研发人员：赵家军，徐潮，
申请(专利权)人：山东第一医科大学附属省立医院山东省立医院，
类型：发明
国别省市：