一管式筛查肿瘤患者体内ETV6-NTRK3融合基因的引物、探针和方法技术

本发明专利技术公开了一种利用荧光定量PCR技术，一管式筛查肿瘤患者体内ETV6‑NTRK3融合基因的引物、探针和方法，可筛查肿瘤患者体内是否有ETV6‑NTRK3融合基因，对于肿瘤患者及时调整治疗方案、指导拉罗替尼用药、评价治疗效果、预测预后和预防临床复发具有重要意义。

【技术实现步骤摘要】
一管式筛查肿瘤患者体内ETV6-NTRK3融合基因的引物、探针和方法
本专利技术属生物技术检测领域，特别涉及一种筛查融合基因的方法，采用探针Taqman实时荧光PCR技术检测肿瘤患者体内ETV6-NTRK3融合基因的情况。
技术介绍
恶性肿瘤是目前全球疾病死亡的首位原因，已经成为严重威胁人类健康的一类疾病。近年来，随着高通量基因测序技术如二代测序(NGS)技术突飞猛进的发展，以肿瘤驱动基因为靶点的个体化精准医疗彻底改变了恶性肿瘤的治疗格局，越来越多的分子靶向药物不断涌现。拉罗替尼(larotrectinib)是一种由LoxoOncology和拜耳公司共同开发的新型口服小分子、高选择性原肌球蛋白受体激酶(tropomyosinreceptorkinase，TRK)抑制剂。2018年11月26日，获得美国食品与药物监督管理局(FDA)批准，用于治疗无已知耐药突变、广泛转移或局部手术治疗效果不佳的NTRK基因融合的儿童和成人实体瘤患者。这是全球第一个获批上市的与肿瘤类型无关的“广谱”抗癌药。NTRK基因融合在各个癌症类型中均有发现，常本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一管式筛查肿瘤患者体内ETV6-NTRK3融合基因的引物和探针，其特征在于，所使用的扩增ETV6-NTRK3融合基因的引物和探针分别为：/nETV6-ex4-F:TTTCACCATTCTTCCACCCTG/nETV6-ex5-F:GCCTGAAGAGCACGCCAT/nNTRK3-ex14-R:GCAGTGGGCTGGCTGAGTC/nNTRK3-ex15-R:AAAGGCTCCCTCACCCAGTT/nNTRK3-ex14-P:FAM-CTCACCACTGATGACAGCCACGGG-BHQ1/nNTRK3-ex15-P:VIC-TCGCTTCAGCACGATGTCTCTCCTCTTA-...

【技术特征摘要】
1.一管式筛查肿瘤患者体内ETV6-NTRK3融合基因的引物和探针，其特征在于，所使用的扩增ETV6-NTRK3融合基因的引物和探针分别为：
ETV6-ex4-F:TTTCACCATTCTTCCACCCTG
ETV6-ex5-F:GCCTGAAGAGCACGCCAT
NTRK3-ex14-R:GCAGTGGGCTGGCTGAGTC
NTRK3-ex15-R:AAAGGCTCCCTCACCCAGTT
NTRK3-ex14-P:FAM-CTCACCACTGATGACAGCCACGGG-BHQ1
NTRK3-ex15-P:VIC-TCGCTTCAGCACGATGTCTCTCCTCTTA-BHQ1。


2.根据权利要求1所述的一管式筛查肿瘤患者体内ETV6-NTRK3融合基因的引物和探针，其特征在于，还包括扩增Actin内参基因的引物和探针，分别为：
Actin-F:TGAGCGAGGCTACAGCTT
Actin-R:TCCTTGATGTCGCGCACGATTT
Actin-Probe:FAM-ACCACCACGGCCGAGCGG-TAMRA。


3.一管式筛查肿瘤患者体内ETV6-NTRK3融合基因的检测方法，包括以下步骤：
(1)抽提外周血中的总RNA并逆转录为cDNA；
(2)以步骤1中的cDNA为模板，依据所述的特异性扩增引物(ETV6-ex4-F、ETV6-ex5-F、NTRK3-ex14-R、NTRK3-ex15-R)、检测探针(NTRK3-ex14-...

【专利技术属性】
技术研发人员：陈雪青，王淑一，
申请(专利权)人：长沙艾迪康医学检验实验室有限公司，
类型：发明
国别省市：湖南;43