基因在胃癌诊断中的应用制造技术

本发明专利技术公开了基因在胃癌诊断中的应用，具体涉及基因CLCA1、CLDN3、FAM3D、MMP7。CLCA1、CLDN3、FAM3D、MMP7在胃癌组织和癌旁组织中存在差异表达，ROC曲线显示其具有较高的诊断效能，提示使用CLCA1、CLDN3、FAM3D、MMP7能够实现胃癌的有效判断。

【技术实现步骤摘要】
基因在胃癌诊断中的应用
本专利技术涉及生物医药领域，更具体地，本专利技术涉及基因在胃癌诊断中的应用。
技术介绍
近年来，全世界恶性肿瘤的发病人数和死亡人数逐年增加。目前，恶性肿瘤已经成为我国居民主要死因之一，其死亡率位居世界较高水平。胃癌是我国常见的消化道肿瘤之一，最新胃癌年发病率为29/10万，每年新发胃癌41万例，其中我国男性胃癌发病率在恶性肿瘤中位列第2位，女性胃癌发病率位列第5位，我国男性胃癌病死率在恶性肿瘤中位列第3位，女性胃癌病死率位列第2位，胃癌的高发病率和高死亡率严重影响了社会劳动力和生产力(ChenW,SunK,ZhengR,eta1.CancerincidenceandmortalityinChina,2014[J].ChinJCancerRes,2018,30(1):1-12)。胃癌的临床表现缺乏特异性，大多数患者在发现时已为进展期胃癌(RenW,YuJ,ZhangZM,etal.Misseddiagnosisofearlygastriccancerorhigh-gradeintraepithelialneoplasia[J].WorldJGastroenterol,2013,19(13):2092-2096)。胃癌的高发病率及高死亡率对居民的医疗健康形成了巨大的威胁，因此如何预防胃癌的发生、提高早期胃癌的检出率、改善胃癌患者生存预后等工作急需开展。我国的许多医学工作者多年来致力于研究胃癌的预防和治疗，本研究旨在探究新的有效的胃癌标志物。胃腺癌的发生发展伴随着多种分子遗传学改变的发生和积累。随着基因研究技术的发展，近年来胃腺癌的分子致病机制研究取得了重大进展，研究基因在胃腺癌中的作用，对于胃腺癌的个性化诊断、高危人群筛查以及精准医疗具有重要的意义。
技术实现思路
本专利技术基于基因在胃腺癌的发生发展中的作用，研究与胃腺癌发生发展相关的生物标志物，从而为胃腺癌的诊断和治疗提供新的手段。本专利技术提供了检测样本中生物标志物的试剂在制备诊断胃腺癌的产品中的应用，所述生物标志物包括CLDN3，与FAM3D或CLCA1组合。进一步，所述生物标志物包括CLDN3，与FAM3D、CLCA1、MMP7任意两种的组合。进一步，所述生物标志物包括CLCA1、CLDN3、FAM3D和MMP7。进一步，所述产品包括通过测序技术、核酸杂交技术、核酸扩增技术、蛋白免疫技术检测基因标志物水平的试剂。进一步，所述试剂选自：特异性识别所述生物标志物的探针；或特异性扩增所述生物标志物的引物；或特异性结合所述生物标志物编码的蛋白的结合剂。特异性结合剂的例子是肽、肽模拟物、aptamer、spiegelmer、darpin、锚蛋白重复蛋白、Kunitz型域、抗体、单域抗体和单价抗体片段。作为一种优选实施方式，特异性结合剂为抗体。进一步，所述样本选自组织或血液。本专利技术提供了一种诊断胃腺癌的产品，所述产品包括检测样本中生物标志物的试剂，所述生物标志物包括CLDN3，与FAM3D或CLCA1组合。进一步，所述生物标志物包括CLDN3，与FAM3D、CLCA1、MMP7任意两种的组合。进一步，所述生物标志物包括CLCA1、CLDN3、FAM3D和MMP7。进一步，所述产品包括试剂盒、芯片、试纸。进一步，所述试剂盒包括qPCR试剂盒、免疫印迹检测试剂盒、免疫层析检测试剂盒、流式细胞分析试剂盒、免疫组化检测试剂盒、ELISA试剂盒和电化学发光检测试剂盒。进一步，所述试剂盒还包括评估受试者是否患有或易患胃腺癌的说明书。进一步，所述产品还包括处理样本的试剂。本专利技术提供了生物标志物在构建预测胃腺癌的计算模型或者嵌入了所述计算模型的系统中的应用，所述生物标志物包括CLDN3，与FAM3D或CLCA1组合。进一步，所述生物标志物包括CLDN3，与FAM3D、CLCA1、MMP7任意两种的组合。进一步，所述生物标志物包括CLCA1、CLDN3、FAM3D和MMP7。进一步，所述计算模型以生物标志物的水平作为输入变量，通过生物信息学方法进行运算，输出疾病的风险概率。本专利技术提供了一种诊断胃腺癌的系统，包括：(1)胃腺癌评估装置，其包括控制单元和存储单元，用于评估受试者是否患有胃腺癌；和(2)彼此通信地连接的信息通信终端装置，其提供关于来自受试者的样本中前面所述的生物标志物的水平的数据；其中，所述胃腺癌评估装置的控制单元包括：1)数据接收单元，其接收从所述信息通信终端设备传输的关于所述样本的所述生物标志物的水平的数据；2)判别值计算单元，其基于由所述数据接收单元接收的所述样本中所述生物标志物的水平以及具有存储在所述存储单元中的作为解释变量的所述生物标志物的水平的判别来计算判别值；3)判别值基准评价单元，其基于由所述判别值计算单元计算的判别值，对所述受试者中的胃腺癌的情况进行评价；以及4)评估结果发送单元，其将由所述判别值基准评估单元获得的所述受试者的评估结果发送到所述信息通信终端装置。本专利技术提供了一种用于鉴定和评估药剂和/或手术治疗和/或物理治疗对胃腺癌的效果的方法，所述方法包括：(1)收集患有胃腺癌的受试者提供第一样本；(2)从所述第一样本获得基因表达谱；(3)对所述受试者或在所述受试者上施用一种或多种候选药物和/或进行一种或多种物理或手术治疗；(4)提供来自步骤(3)中的所述受试者的第二样本；(5)从所述第二样本中获得基因表达谱；(6)将步骤(2)和(5)中获得的所述基因表达谱与参考基因表达谱进行比较；以及(7)基于步骤(6)中的所述比较，评估所述一种或多种候选药物和/或治疗是否有效对抗胃腺癌；进一步，步骤(2)和步骤(5)中的基因为前面所述的生物标志物。本专利技术的优点和有益效果：本专利技术的标志物组合与胃腺癌具有极高的关联度，在判断胃腺癌时，不管是在训练集还是验证集中均具有较好的诊断效能，准确性、敏感性以及特异性较高，可用于胃腺癌的早期发现，从而在胃癌早期进行干预治疗，提高患者的生存质量。附图说明图1显示基因在训练集中的ROC曲线图，其中，A：CLCA1；B：CLDN3；C：FAM3D；D：MMP7；E：CLCA1+CLDN3+FAM3D+MMP7；图2显示基因在验证集中的ROC曲线图，其中，A：CLCA1；B：CLDN3；C：FAM3D；D：MMP7；E：CLCA1+CLDN3+FAM3D+MMP7。具体实施方式本专利技术为了筛选可用于胃腺癌诊断的生物标志物，通过收集胃腺癌患者的癌组织样本与癌旁组织样本，综合分析样本的基因表达谱，筛选在训练集中两个群组中水平呈现显著性差异的基因，并进一步分析基因在验证集中的表达情况与诊断效能，从而发现适于胃腺癌诊断和治疗的生物标志物。在本专利技术中，术语“生物标志物”意指化合物，本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.检测样本中生物标志物的试剂在制备诊断胃腺癌的产品中的应用，其特征在于，所述生物标志物包括CLDN3，与FAM3D或CLCA1组合；/n优选地，所述生物标志物包括CLDN3，与FAM3D、CLCA1、MMP7任意两种的组合；/n优选地，所述生物标志物包括CLCA1、CLDN3、FAM3D和MMP7。/n

【技术特征摘要】
1.检测样本中生物标志物的试剂在制备诊断胃腺癌的产品中的应用，其特征在于，所述生物标志物包括CLDN3，与FAM3D或CLCA1组合；
优选地，所述生物标志物包括CLDN3，与FAM3D、CLCA1、MMP7任意两种的组合；
优选地，所述生物标志物包括CLCA1、CLDN3、FAM3D和MMP7。


2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述产品包括通过测序技术、核酸杂交技术、核酸扩增技术、蛋白免疫技术检测基因标志物水平的试剂。


3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述试剂选自：
特异性识别所述生物标志物的探针；或
特异性扩增所述生物标志物的引物；或
特异性结合所述生物标志物编码的蛋白的结合剂。


4.根据权利要求1-3任一项所述的应用，其特征在于，所述样本选自组织、血液。


5.一种诊断胃腺癌的产品，其特征在于，所述产品包括检测样本中生物标志物的试剂，所述生物标志物包括CLDN3，与FAM3D或CLCA1组合；
优选地，所述生物标志物包括CLDN3，与FAM3D、CLCA1、MMP7任意两种的组合；
优选地，所述生物标志物包括CLCA1、CLDN3、FAM3D和MMP7。


6.根据权利要求5所述的产品，其特征在于，所述产品包括试剂盒、芯片、试纸；
优选地，所述试剂盒包括qPCR试剂盒、免疫印迹检测试剂盒、免疫层析检测试剂盒、流式细胞分析试剂盒、免疫组化检测试剂盒、ELISA试剂盒和电化学发光检测试剂盒；
优选地，所述试剂盒还包括评估受试者是否患有或易患胃腺癌的说明书。


7.根据权利要求5或6所述的产品，其特征在于，所述产品还包括处理样本的试剂。


8.生物标志物在构建预测胃腺癌的计算模型或者嵌入了所述计算模型的系统中的应用，其特征在于，所述生物标志物包括CLDN3，与FAM3D或CLCA1组合；
优选地，所述生物...

【专利技术属性】
技术研发人员：杨承刚，宋宏涛，
申请(专利权)人：北京泱深生物信息技术有限公司，
类型：发明
国别省市：北京;11