本发明专利技术涉及基因工程技术领域，具体涉及一种影响高山美利奴羊羊毛直径细度离散的SNP分子标记及其应用，所述的影响高山美利奴羊羊毛直径离散的SNP分子标记位于国际绵羊参考基因组Oar_v4.0版本第22号染色体上第15593201个核苷酸位点A/G突变。本发明专利技术还提供用于鉴定上述SNP分子标记的特异性引物对及含有该特异性引物对的试剂盒，可以用于高山美利奴羊早期选择、提高选种准确性、缩短培育周期、加快培育进程，且试剂盒具有操作简单的优点，减少高山美利奴羊羊毛直径离散优良性状的育种时间，降低育种成本，缩短培育周期，加快培育进程，具有很高的应用价值。高的应用价值。高的应用价值。
【技术实现步骤摘要】
一种影响高山美利奴羊羊毛直径离散的SNP分子标记及其应用
[0001]本专利技术涉及基因工程
，具体涉及一种影响高山美利奴羊羊毛直径离散的SNP分子标记及其应用。
技术介绍
[0002]羊毛纤维直径是决定其价值的一个主要方面，它与其经济性状关系非常密切，对羊毛生产、加工、贸易有着重要影响，决定了羊毛的经济价值和纺纱性能。而羊毛纤维细度变异占羊毛总利润的61％,直接影响着毛纱和织物品质。细度离散是反映纤维细度的分布或分散情况，产生原因主要与羊的品种、饲养管理、自然环境以及羊毛的生产、加工，流通等有关。控制羊毛细度离散的措施有选种与选育，羊毛的分级整理，改善环境，制定营养的饲养管理方法等。SNP是1996年由美国麻省理工学院的人类基因组研究中心学者Lander提出的一类分子遗传标记，主要是指基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。SNP表现出的多态性仅涉及到单个碱基的变异，表现是有转换、颠换、插入和缺失等。SNP分子标记具有遗传稳定、突变率低、便于自动化检测等优点。本领域技术人员通过定位和功能基因组技术筛选与细毛羊重要性状相关的分子遗传标记，分析分子遗传标记对候选性状的遗传效应，探讨对候选性状的分子遗传基础；应用SNP标记进行基因组扫描，定位影响羊毛生长发育与细度和生长期变化、抗病性能相关的分子标记，进一步分离具有重要遗传效应的功能基因；建立和优化标记(基因)辅助选择与标记辅助导入聚合育种的方法，通过以上筛选的分子标记，建立各种辅助标记选择模型，并对可能获得的后代进行个体育种值的评分，选择适合性状的标记基因型或单倍型，在育种群体内展开育种选择和杂交导入；建立优良基因从供体高效导入到受体的方法，并进行杂交后代的测定，验证分子标记辅助选择，进而培育具有特定形状的高山美利奴羊。
[0003]针对上述技术问题，本专利技术提供了一种影响高山美利奴羊羊毛直径离散的SNP分子标记及其应用，其主要目的是为了培育符合养殖需求的高山美利奴羊新品种，也为细毛羊分子标记辅助育种提供依据，加强高山美利奴羊早期选择、提高选种准确性、缩短培育周期、加快培育进程。
技术实现思路
[0004]本专利技术的第一目的是提供一种影响高山美利奴羊羊毛直径离散的SNP分子标记，所述的SNP分子标记位于国际绵羊基因组Oar_v4.0版本第22号染色体上第15593201位点的碱基处；突变碱基为A或G。
[0005]本专利技术的第二目的是提供一种影响高山美利奴羊羊毛直径离散的SNP分子标记，含有所述的SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，所述的SNP分子标记位于第47位，突变碱基为A或G。
[0006]本专利技术的第三目的是所述的SNP分子标记在高山美利奴羊育种中的应用。
[0007]优选地，当所述的SNP分子标记碱基为A时，基因型为AA；当所述的SNP分子标记碱基为G时，基因型为AG或GG；
[0008]所述的SNP位点的AA基因型和AG基因型的细毛羊的羊毛纤维直径显著小于GG基因型。
[0009]用于检测所述的SNP分子标记的特异性引物对，所述特异性引物对的核苷酸序列如下所示：
[0010]F：5'-AACTCTGCTCCCAACCAATG-3'；
[0011]R：5'-GACAGGGTCTACAAGAAATG-3'。
[0012]含有所述的特异性引物对的试剂或者试剂盒。
[0013]所述的特异性引物对在检测高山美利奴羊羊毛直径离散程度中的应用。
[0014]利用所述的特异性引物对检测高山美利奴羊羊毛直径离散程度的方法，所述的方法包括如下步骤：
[0015](1)提取待测高山美利奴羊血液基因组DNA；
[0016](2)利用如权利要求5所述的特异性引物对将步骤(1)获得的待测高山美利奴羊血液的基因组DNA进行PCR扩增，获得PCR扩增产物；
[0017](3)对步骤(2)获得的PCR扩增产物进行测序，扩增的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，所述的SNP分子标记位于第47位，突变碱基为A或G；
[0018](4)根据步骤(3)获得的测序结果，确定待测高山美利奴羊血液的所述SNP分子标记的基因型；
[0019](5)依据步骤(4)获得的SNP分子标记的基因型判定高山美利奴羊羊毛直径离散程度。
[0020]优选地，所述的步骤(2)中的PCR扩增体系25μL：金牌Mix(green)22μL，上、下游引物各1μL，模板1μL；PCR扩增程序：98℃2min；94℃10s，56℃10s，72℃10s，共30个循环；72℃延伸1min。
[0021]本专利技术的有益效果是：本专利技术提供了一种影响高山美利奴羊羊毛直径离散的SNP分子标记，所述的SNP分子标记位于国际绵羊参考基因组Oar_v4.0版本第22号染色体上第15593201个碱基处；变异类型为A/G，存在三个基因型，当所述的第22号染色体上第15593201个碱基为A时，基因型为AA；当所述的第22号染色体上第15593201个碱基为G时，基因型为AG或GG；通过不同基因型与羊毛直径离散的关联分析，发现所述AA和AG基因型的高山美利奴羊羊毛直径离散显著小于GG基因型个体，P<0.05；AA和AG基因型个体间未表现出显著差异，P>0.05。通过检测高山美利奴羊第22号染色体上第15593201个核苷酸位点的碱基，能够判断高山美利奴羊羊毛直径离散，为高山美利奴羊羊毛直径离散的分子标记辅助育种提供依据，可以加强高山美利奴羊早期选择、提高选种准确性、缩短培育周期、加快培育进程。通过所述的特异性引物对，可建立高效准确的分子标记辅助育种技术，通过优选该SNP分子标记的优势等位基因，能够增加高山美利奴羊羊毛直径离散的遗传进展，采用与羊毛直径离散相关的分子标记进行羊毛性状甄选时，具有操作简单的优点，可以辅助筛选羊毛直径离散低的高山美利奴羊，提高品种甄选的精确度，减少高山美利奴羊羊毛直径离散优良性状的育种时间，降低育种成本，增加核心竞争。
附图说明
[0022]图1高山美利奴羊第22号染色体上第15593201个核苷酸位点PCR电泳检测
[0023]图2高山美利奴羊第22号染色体上第15593201个核苷酸位点的测序结果
[0024]A为AA基因型，B为AG基因型，C为GG基因型
具体实施方式
[0025]下面结合实施例对本专利技术的技术方案进行详细说明。需要指出的是以下实施例的给出仅是为了起到说明的目的，并不是用于对本专利技术的范围进行限制。本领域的技术人员在不背离本专利技术的宗旨和精神的情况下，可以对本专利技术进行各种修改和替换。
[0026]下述实施例中所有试验的实验方法如无特殊说明，均为常规方法。
[0027]本专利技术所述的SNP是单核苷酸多态性的简称，指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。
[0028]本专利技术以下实施例中所述的多态信息含量：polymorphism informa本文档来自技高网...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种影响高山美利奴羊羊毛直径离散的SNP分子标记，其特征在于，所述的SNP分子标记位于国际绵羊基因组Oar_v4.0版本第22号染色体上第15593201位点的碱基处；突变碱基为A或G。2.一种影响高山美利奴羊羊毛直径离散的SNP分子标记，其特征在于，含有所述的SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，所述的SNP分子标记位于第47位，突变碱基为A或G。3.一种如权利要求1或2所述的SNP分子标记在高山美利奴羊育种中的应用。4.如权利要求3所述的应用，其特征在于，当所述的SNP分子标记碱基为A时，基因型为AA；当所述的SNP分子标记碱基为G时，基因型为AG或GG；所述的SNP位点的AA基因型和AG基因型的细毛羊的羊毛纤维直径显著小于GG基因型。5.用于检测权利要求1或2所述的SNP分子标记的特异性引物对，其特征在于，所述特异性引物对的核苷酸序列如下所示：F：5'-AACTCTGCTCCCAACCAATG-3'；R：5'-GACAGGGTCTACAAGAAATG-3'。6.含有如权利要求5所述的特异性引物对的试剂或者试剂盒。...
【专利技术属性】
技术研发人员：袁超，郭婷婷，岳耀敬，卢曾奎，牛春娥，刘建斌，杨博辉，
申请(专利权)人：中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所，
类型：发明
国别省市：
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