【技术实现步骤摘要】
空间组学测序、单细胞表观转录组学测序及定位标识方法
本公开涉及基因测序
，具体涉及一种空间组学测序、单细胞表观转录组学测序及定位标识方法。
技术介绍
空间异质性是器官功能的关键特征，细胞的位置信息对细胞调控机制和细胞谱系发生过程的研究十分重要。传统的基因测序在组织样本或细胞群的整体上进行，细胞之间的差异可能因平均化被掩盖，单细胞测试技术可以在单细胞层面揭示每个细胞的基因信息，使不同的细胞类型得以区分。但是仍然缺乏揭示细胞在组织体内原有位置信息的能力。因此，需要一种保留细胞原有空间位置信息的测序方法。
技术实现思路
为了解决相关技术中的问题，本公开实施例提供一种空间组学测序、单细胞表观转录组学测序及定位标识方法。第一方面，本公开实施例中提供了一种空间组学测序方法。具体地，所述空间组学测序方法，包括：预处理样品切片；利用微流控芯片将交叉定位标识添加至所述样品切片，其中，所述交叉定位标识为向微流控芯片的进样孔加入的包括不同barcode的物质所确定的；依序对所述样品切片进行...
【技术保护点】
1.一种空间组学测序方法，其特征在于，包括：/n预处理样品切片；/n利用微流控芯片将交叉定位标识添加至所述样品切片，其中，所述交叉定位标识为向微流控芯片的进样孔加入的包括不同barcode的物质所确定的；/n依序对所述样品切片进行细胞裂解、扩增及建库后，根据所述交叉定位标识进行基因测序。/n
【技术特征摘要】
1.一种空间组学测序方法，其特征在于，包括：
预处理样品切片；
利用微流控芯片将交叉定位标识添加至所述样品切片，其中，所述交叉定位标识为向微流控芯片的进样孔加入的包括不同barcode的物质所确定的；
依序对所述样品切片进行细胞裂解、扩增及建库后，根据所述交叉定位标识进行基因测序。
2.根据权利要求1所述的空间组学测序方法，其特征在于，所述利用微流控芯片将交叉定位标识添加至所述样品切片，包括：
将所述微流控芯片覆盖在样品切片上；
向所述微流控芯片的进样孔分别加入包含不同barcodeA的第一物质，与所述样品切片进行第一反应；
使用缓冲液对所述样品切片进行洗涤；
以预定角度旋转所述微流控芯片，使得所述第一物质流经的所述微流控芯片的微流体通道的方向与旋转后的所述微流体通道的方向形成所述交叉定位标识；
向旋转后的所述微流控芯片的进样孔分别加入包含不同barcodeB的第二物质，与所述样品切片进行第二反应。
3.根据权利要求2所述的空间组学测序方法，其特征在于，还包括：
在进行所述第一反应和/或第二反应的过程中，利用正压充气所述微流控芯片的进样孔和/或负压抽吸所述微流控芯片的出样孔的方式，促使所述第一物质和/或第二物质顺利进入样品标记区域；其中，所述样品标记区域为所述微流控芯片覆盖所述样品切片的区域，该区域具有平行设置的所述微流体通道；和/或利用硬物穿过所述出样孔附近的防回流孔挤压所述微流体通道，防止所述第一反应和/或第二反应的过程中，所述第一物质和/或第二物质从所述微流控芯片的出样孔回流。
4.根据权利要求2或3所述的空间组学测序方法，其特征在于，应用于空间转录组测序或空间蛋白组测序，其中，所述第一反应为反转反应，第二反应为连接反应，以在所述样品切片的mRNA上添加barcodeA和barcodeB。
5.根据权利要求4所述的空间组学测序方法，其特征在于，应用于空间蛋白组测序，其中，在第一反应前，加入偶联了barcodeC的配偶体以结合感兴趣的目标蛋白，之后依次进行所述第一反应、第二反应。
6.根据权利要求2或3所述的空间组学测序方法，其特征在于，应用于空间表观组测序，其中，所述第一物质、第二物质还包括Tn5，所述Tn5打断配偶体结合区的染色质得到目标DNA片段，同时在该DNA片段上添加barcodeA和barcodeB。
7.根据权利要求6所述的空间组学测序方法，其特征在于，应用于空间表观转录组测序，其中，在第一反应前，加入感兴趣蛋白的配偶体以结合感兴趣的蛋白；任选地，在加入配偶体之前还包括使用引物对RNA进行反转处理得到cDNA的步骤。
8.根据权利要求7所述的空间组学测序方法，其特征在于，还包括：
在进行RNA反转处理前，利用消...
【专利技术属性】
技术研发人员：彭广敦，江伏青，瞿芳芳，
申请(专利权)人：生物岛实验室，
类型：发明
国别省市：广东;44
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