一种构建人源TCRβ的CDR3区高通量测序文库的引物组及其应用制造技术

技术编号:26885733 阅读:124 留言:0更新日期:2020-12-29 15:43
本发明专利技术属于生物技术领域,具体涉及一种构建人源TCRβ的CDR3区高通量测序文库的引物组及其应用,尤其涉及一种构建人TCRβ的CDR3区高通量测序文库的所需的引物组与文库制备方法。本发明专利技术提供的引物组可以用于全面、高效、便捷、高灵敏度的TCR检测和分析方法中,具有以下特点:对各类样本的高度兼容性、实验操作流程高度标准化和自动化、简便快捷的分析流程。

【技术实现步骤摘要】
一种构建人源TCRβ的CDR3区高通量测序文库的引物组及其应用
本专利技术属于生物
,具体涉及一种构建人源TCRβ的CDR3区高通量测序文库的引物组及其应用,尤其涉及一种构建人TCRβ的CDR3区高通量测序文库所需的引物组以及该文库的制备方法。
技术介绍
淋巴细胞通过其表面抗体识别特异性抗原来发挥免疫功能。其对抗原识别的特异性体现在克隆水平,即同一克隆的淋巴细胞能识别具有相同的抗原受体,识别同一抗原表位。T细胞抗原受体(TCR)是T细胞特异识别和结合抗原肽-MHC分子的结构,T细胞受体是异源二聚体,由两个不同的亚基所构成。95%的T细胞的受体由α亚基和β亚基构成,另外5%的受体由γ亚基和δ亚基构成,其比例会因为个体发育或疾病而变化。TRB是编码TCRβ的基因座,其包含可变段(V)、多变段(D)、连接段(J)和恒定区(C)4个基因片段,而V、D、J、C又分为若干等位基因,T细胞发育过程中TRB基因座内发生基因重组,为TCRβ的多样性提供了分子基础,另外通过在基因重组位点附近的碱基的随机插入和缺失等机制,最终产生了多样性的TC本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种构建人源TCRβ的CDR3区高通量测序文库的引物组,其特征在于,所述引物组的上游引物包括TRBV10-1-F、TRBV10-2/3-F、TRBV11-1/2/3-F、TRBV12-3.1/4/5.1-F、TRBV12-3.2/5.2-F、TRBV13-F、TRBV14-F、TRBV15-F、TRBV16-F、TRBV18-F、TRBV19-F、TRBV20-F、TRBV24-F、TRBV25-F、TRBV27-F、TRBV28-F、TRBV29-F、TRBV2-F、TRBV3-F、TRBV30-F、TRBV4-1-F、TRBV4-2/3-F、TRBV5-1-F、TRBV5-4/5/6/...

【技术特征摘要】
1.一种构建人源TCRβ的CDR3区高通量测序文库的引物组,其特征在于,所述引物组的上游引物包括TRBV10-1-F、TRBV10-2/3-F、TRBV11-1/2/3-F、TRBV12-3.1/4/5.1-F、TRBV12-3.2/5.2-F、TRBV13-F、TRBV14-F、TRBV15-F、TRBV16-F、TRBV18-F、TRBV19-F、TRBV20-F、TRBV24-F、TRBV25-F、TRBV27-F、TRBV28-F、TRBV29-F、TRBV2-F、TRBV3-F、TRBV30-F、TRBV4-1-F、TRBV4-2/3-F、TRBV5-1-F、TRBV5-4/5/6/8-F、TRBV6-1-F、TRBV6-2/3-F、TRBV6-4.1-F、TRBV6-4.2-F、TRBV6-1.2/5/8-F、TRBV6-1.1/6/7/9-F、TRBV7-1-F、TRBV7-2/4/6/7/8-F、TRBV7-3-F、TRBV7-9-F和TRBV9-F;
其中,TRBV10-1-F的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示;TRBV10-2/3-F的核苷酸序列如SEQIDNO.2所示;TRBV11-1/2/3-F的核苷酸序列如SEQIDNO.3所示;TRBV12-3.1/4/5.1-F的核苷酸序列如SEQIDNO.4所示;TRBV12-3.2/5.2-F的核苷酸序列如SEQIDNO.5所示;TRBV13-F的核苷酸序列如SEQIDNO.6所示;TRBV14-F的核苷酸序列如SEQIDNO.7所示;TRBV15-F的核苷酸序列如SEQIDNO.8所示;TRBV16-F的核苷酸序列如SEQIDNO.9所示;TRBV18-F的核苷酸序列如SEQIDNO.10所示;TRBV19-F的核苷酸序列如SEQIDNO.11所示;TRBV20-F的核苷酸序列如SEQIDNO.12所示;TRBV24-F的核苷酸序列如SEQIDNO.13所示;TRBV25-F的核苷酸序列如SEQIDNO.14所示;TRBV27-F的核苷酸序列如SEQIDNO.15所示;TRBV28-F的核苷酸序列如SEQIDNO.16所示;TRBV29-F的核苷酸序列如SEQIDNO.17所示;TRBV2-F的核苷酸序列如SEQIDNO.18所示;TRBV3-F的核苷酸序列如SEQIDNO.19所示;TRBV30-F的核苷酸序列如SEQIDNO.20所示;TRBV4-1-F的核苷酸序列如SEQIDNO.21所示;TRBV4-2/3-F的核苷酸序列如SEQIDNO.22所示;TRBV5-1-F的核苷酸序列如SEQIDNO.23所示;TRBV5-4/5/6/8-F的核苷酸序列如SEQIDNO.24所示;TRBV6-1-F的核苷酸序列如SEQIDNO.25所示;TRBV6-2/3-F的核苷酸序列如SEQIDNO.26所示;TRBV6-4.1-F的核苷酸序列如SEQIDNO.27所示;TRBV6-4.2-F的核苷酸序列如SEQIDNO.28所示;TRBV6-1.2/5/8-F的核苷酸序列如SEQIDNO.29所示;TRBV6-1.1/6/7/9-F的核苷酸序列如SEQIDNO.30所示;TRBV7-1-F的核苷酸序列如SEQIDNO.31所示;TRBV7-2/4/6/7/8-F的核苷酸序列如SEQIDNO.32所示;TRBV7-3-F的核苷酸序列如SEQIDNO.33所示;TRBV7-9-F的核苷酸序列如SEQIDNO.34所示和TRBV9-F的核苷酸序列如SEQIDNO.35所示;
所述引物组的下游引物包括TRBJ1-1-R、TRBJ1-2-...

【专利技术属性】
技术研发人员:宋瑾郭静雅任树成张恒辉沈宁孔雅娴
申请(专利权)人:北京臻知医学科技有限责任公司
类型:发明
国别省市:北京;11

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