一种用于胰腺癌预后诊断的基因标记物制造技术

本发明专利技术涉及胰腺癌临床诊断领域，具体涉及一种用于胰腺癌预后诊断的基因标记物，基因标记物为m5C调控基因。本发明专利技术进一步公开了m5C调控基因的表达量在胰腺癌预后诊断中的应用。本发明专利技术检测胰腺癌具有安全无创的优点，即使无症状人群也对该检测接受度高；RNA来源广泛，不存在影像学中的检测盲区；准确性高，对早期胰腺癌有较高的灵敏度和特异性，适合用于胰腺癌的早期筛查；操作方便，容易进行胰腺癌复发和转移的动态监测。本发明专利技术的基因标志物可与其他临床指标相结合，为胰腺癌筛查、诊断、治疗与预后提供更准确的判断。

【技术实现步骤摘要】
一种用于胰腺癌预后诊断的基因标记物
本专利技术涉及胰腺癌临床诊断领域，具体涉及一种用于胰腺癌预后诊断的基因标记物。
技术介绍
胰腺癌是一种消化道常见肿瘤，是预后最差的恶性肿瘤之一。根据最新流行病学调查，胰腺癌位居欧美等发达国家恶性肿瘤死亡率第四位，全球每年约250万人死于胰腺癌。近20年来我国胰腺癌的发病率持续增高，目前胰腺癌位居恶性肿瘤死亡率第五位。胰腺癌（Pancreaticadenocarcinoma，PAAD）是一种恶性程度很高、诊断和治疗都很困难的消化道恶性肿瘤，约90%为起源于腺管上皮的导管腺癌。目前胰腺癌的病因尚不十分清楚，其发生与吸烟、饮酒、高脂肪和高蛋白饮食、过量饮用咖啡、环境污染及遗传因素有关；近年来的调查报告发现糖尿病人群中胰腺癌的发病率明显高于普通人群；也有人注意到慢性胰腺炎病人与胰腺癌的发病存在一定关系，发现慢性胰腺炎病人发生胰腺癌的比例明显增。近年来，胰腺癌的发病率明显升高，30年代以来，美、英、日等国PCA发病率增加了2～4倍。在胰腺癌的治疗中，早期诊断困难，其起病隐匿，缺乏典型临床症状，且预后极差，胰腺癌侵袭性强，恶性度高，外科手术、化疗及放疗等手段的疗效均不尽人意，其术后1年生存率不到20％，5年生存率仅为4％，早期确诊率低和术后转移是胰腺癌死亡率高的主要原因。近年来，随着分子生物学技术的发展，在癌症疾病的相关研究中，越来越多的非编码基因或非编码RNA被报道，如lncRNA、micRNA、假基因等。非编码RNA(ncRNAs)是一类具有重要生物学功能的RNA，参与基因组印记、染色体沉默、染色质修饰、转录激活、转录干扰、核内运输等多种重要的调控过程，在细胞分化和发育、基因转录和翻译、遗传和表观遗传等生命活动中均发挥重要的调控作用。越来越多的权威研究表明lncRNA在肿瘤的发生发展中起着抑制或促进肿瘤的作用。目前己有较多lncRNAs被证实在包括乳腺癌、黑色素瘤、肝癌、结肠癌、膀胱癌等在内的人类多种肿瘤中存在差异表达并执行重要的调控功能。因此，胰腺癌的早期诊断和早期治疗是提高和改善胰腺癌预后的关键，尤其是发现一种特有的、可用于早期诊断和预后的标记物和靶向分子，对于战胜胰腺癌具有重要意义，成为目前国内外肿瘤专家的研究热点。
技术实现思路
（一）解决的技术问题针对现有技术的不足，本专利技术提供了一种用于胰腺癌预后诊断的基因标记物m5C调控基因，利用本专利技术的基因标记物监测胰腺癌预后，不仅精确度大大提高，同时对后续临床研究的开展具有指导意义。（二）技术方案为实现以上目的，本专利技术通过以下技术方案予以实现：一种用于胰腺癌预后诊断的基因标记物，基因标记物为m5C调控基因。优选地，基因标记物为m5C调控基因的DNMT3A基因。上述用于胰腺癌预后诊断的基因标记物的应用，m5C调控基因的表达量在胰腺癌预后诊断中的应用。优选地，预后为监测、疗效评估或复发转移监控。上述用于胰腺癌预后诊断的基因标记物的应用，DNMT3A基因的表达量在胰腺癌预后诊断中的应用。优选地，DNMT3A基因的低表达与受试者的预后相关。优选地，DNMT3A基因的表达与受试者的临床分级呈负相关关系，且DNMT3A基因的表达与受试者预后显著相关。优选地，DNMT3A基因的表达与核糖体的生理过程有关。（三）有益效果（1）本专利技术检测胰腺癌具有安全无创的优点，即使无症状人群也对该检测接受度较高；（2）RNA来源广泛，不存在影像学中的检测盲区；（3）准确性高，对早期胰腺癌有较高的灵敏度和特异性，适合用于胰腺癌的早期筛查；（4）操作方便，用户体验好，容易进行胰腺癌复发和转移的动态监测。本专利技术的基因标志物可与其他临床指标相结合，为胰腺癌筛查、诊断、治疗与预后提供更准确的判断。附图说明图1为PAAD病例中m5C调控基因的突变频率统计图；图2为DNMT3A的突变位点图；图3为PAAD样本中m5C调控基因的CNV统计图；图4为m5C调控基因的CNV与表达水平的关系图；图5为不同临床分级与病人的预后关系图；图6为m5C调控基因与不同Stage病例的聚类热图；图7为DNMT3A表达量在不同临床分级病例中的表达比较图；图8为多因素COX回归的Survival曲线和AUC曲线图；图9为DNMT3A的表达与患者预后的关系图；图10为DNMT3A不同表达量与风险分析图；具体实施方式为使本专利技术实施例的目的、技术方案和优点更加清楚，下面将结合本专利技术实施例，对本专利技术实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述，显然，所描述的实施例是本专利技术一部分实施例，而不是全部的实施例。基于本专利技术中的实施例，本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例，都属于本专利技术保护的范围。胰腺癌基因标志物的筛选（1）m5C调控基因的因子Writers：甲基化酶，RNA甲基化修饰过程，目前已知的成分有NSUN1，NSUN2，NSUN3，NSUN4，NSUN5，NSUN6，NSUN7，DNMT1，DNMT2，DNMT3A和DNMT3B；Erasers：去甲基化酶，有TET2；Readers：m5C结合蛋白，识别并结合mRNA上的m5C位点，有ALYREF。（2）临床信息筛选所有PAAD临床数据、CNV、突变和mRNA表达数据均由TCGA-assembler从TCGA网站中检索并于2019年9月下载；用于验证结果的验证数据集来自ICGC的胰腺癌数据集（https://dcc.icgc.org/）；具体为ICGC_PACA_CA。对于转录组数据，选取177例肿瘤样本，下载数据为TPM和FPKM；对于SNV数据，选取175个肿瘤样本的数据，下载数据为muTect处理后的level3数据；对于CNV数据，共有183例肿瘤样本；对于临床信息数据，共有185例临床信息；将数据整合后，剔除临床信息不完整以及生存时间不足90天的样本后，对151例独立样本进行生存分析。（3）结果与分析1）m5C调控基因的突变和CNV在363例PAAD患者测序数据中，m5C调控基因在35例独立样本中出现突变。TET2因子发生突变的频率较高，在15例样本中被检测到；与“Eraser”和“Reader”基因相比，“Writer”基因突变频率具有更大的波动（如图1所示，图1中count的单位是例）。表1PAAD样本中m5C调控基因错义突变统计表表2PAAD样本中m5C调控基因的功能注释统计表注：表1和表2中total的单位均为例。由表1可知，7例样本发生了可注释m5C调控基因SNV的功能性改变。由表2可知，在m5C调控基因的13个因子中，有7个因子（NSUN2、NSUN4、NSUN5、NSUN7、DNMT3A、DNMT3B和TET2）注释到了功能性改变，且本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于胰腺癌预后诊断的基因标记物，其特征在于：基因标记物为m5C调控基因。/n

【技术特征摘要】
1.一种用于胰腺癌预后诊断的基因标记物，其特征在于：基因标记物为m5C调控基因。


2.根据权利要求1所述的用于胰腺癌预后诊断的基因标记物，其特征在于：所述基因标记物为m5C调控基因的DNMT3A基因。


3.根据权利要求1或2所述的用于胰腺癌预后诊断的基因标记物的应用，其特征在于：所述m5C调控基因的表达量在胰腺癌预后诊断中的应用。


4.根据权利要求3所述的用于胰腺癌预后诊断的基因标记物的应用，其特征在于：所述预后为监测、疗效评估或复发转移监控。


5.根据权利要求2所述的用于胰腺癌预后诊断...

【专利技术属性】
技术研发人员：于潇，何玉婷，张起尧，郑清元，郭文治，
申请(专利权)人：郑州大学第一附属医院，
类型：发明
国别省市：河南;41