一种与丝瓜白粉病相关的分子标记及其应用制造技术

本发明专利技术涉及生物分子标记技术领域，公开了一种与丝瓜白粉病相关的分子标记及其应用。该分子标记位于8号染色体52.69Mb和53.49Mb区域内，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，命名为M5349。所述分子标记的多态性为丝瓜基因组中含有SEQ ID NO.1第109～151位或缺失SEQ ID NO.1第109～151位。本发明专利技术首次发现了与丝瓜白粉病相关的分子标记M5349，该分子标记与丝瓜白粉病性状显著相关；可作为丝瓜抗白粉病性状的分子标记，用于鉴定或辅助鉴定丝瓜的抗白粉病性状和/或丝瓜辅助育种中。

【技术实现步骤摘要】
一种与丝瓜白粉病相关的分子标记及其应用
本专利技术属于生物分子标记
，具体涉及一种与丝瓜白粉病相关的分子标记及其应用。
技术介绍
丝瓜是一种重要的多功能蔬菜。丝瓜果实富含维生素、氨基酸、微量元素和抗氧化物质，具有清热消暑、止血消炎的功效，是一种药食兼用的多功能蔬菜。近年来，随着人们对营养健康的重视，丝瓜的播种面积逐年增大，已成为重要的日常消费蔬菜。丝瓜白粉病是一种由病菌引起的的病害，在丝瓜种植的过程中十分常见，这种病主要发生在4月上旬和6月下旬，此时气温较温和，相对湿度大，在通风不良、栽培密度大的田地容易发病。丝瓜白粉病发病初期叶片局部产生圆形小白粉斑，后逐渐扩大为不规则形、边缘不明显的白粉状小霉斑(即病菌的分生孢子梗和分生孢子)。发生严重时，数十个白粉病斑汇集连成一片，最后造成叶片发黄，有时病斑上产生小黑点，严重影响丝瓜产量和品质。因此，深入挖掘、利用丝瓜白粉病相关分子标记，对于丝瓜产业的发展具有重要意义。
技术实现思路
为了克服现有技术所存在的不足，本专利技术的第一方面的目的，在于提供一种与丝瓜白粉病相关的分子标记。本专利技术的第二个方面的目的，在于提供用于扩增上述与丝瓜白粉病相关的分子标记的引物对。本专利技术的第三个方面的目的，在于提供一种用于鉴定或辅助鉴定丝瓜白粉病形状的试剂盒。本专利技术的第四个方面的目的，在于提供上述与丝瓜白粉病相关的分子标记在鉴定或辅助鉴定丝瓜白粉病性状和/或丝瓜育种中的应用。本专利技术的第五方面的目的，在于提供上述用于扩增上述与丝瓜白粉病相关的分子标记的引物对在鉴定或辅助鉴定丝瓜白粉病性状和/或丝瓜育种中的应用。本专利技术的第六方面的目的，在于提供上述用于鉴定或辅助鉴定丝瓜白粉病形状的试剂盒在鉴定或辅助鉴定丝瓜白粉病性状和/或丝瓜育种中的应用。本专利技术的第七方面的目的，在于提供一种鉴定丝瓜白粉病性状的方法。本专利技术的第八方面的目的，在于提供一种丝瓜辅助育种的方法。为了实现上述目的，本专利技术所采取的技术方案是：本专利技术的第一个方面，提供一种与丝瓜白粉病相关的分子标记，位于8号染色体52.69Mb和53.49Mb区域内。优选的，所述分子标记的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示，命名为M5349。所述分子标记的多态性为丝瓜基因组中含有SEQIDNO.1第109～151位或缺失SEQIDNO.1第109～151位。所述分子标记的突变型为缺失第109～151位的SEQIDNO.1，其核苷酸序列如SEQIDNO.2所示。本专利技术的第二个方面，提供用于扩增上述与丝瓜白粉病相关的分子标记的引物对，其中，上游引物设计在SEQIDNO.1的第1bp～108bp处，下游引物设计在152-195bp处。优选的，所述引物对(M5349引物对)的序列如下所示：M5349-F:TTGAGGTATTACTTCCATC(SEQIDNO.3)；M5349-R:GCATCTTGAAATCTAGGT(SEQIDNO.4)。本专利技术的第三个方面，提供一种用于鉴定或辅助鉴定丝瓜白粉病形状的试剂盒，包含用于扩增上述与丝瓜白粉病相关的分子标记的引物对。本专利技术的第四个方面，提供上述与丝瓜白粉病相关的分子标记在鉴定或辅助鉴定丝瓜白粉病性状和/或丝瓜辅助育种中的应用。本专利技术的第五方面，提供上述用于扩增上述与丝瓜白粉病相关的分子标记的引物对在鉴定或辅助鉴定丝瓜白粉病性状和/或丝瓜辅助育种中的应用。本专利技术的第六方面，提供上述用于鉴定或辅助鉴定丝瓜白粉病形状的试剂盒在鉴定或辅助鉴定丝瓜白粉病性状和/或丝瓜辅助育种中的应用。本专利技术的第七个方面，提供一种鉴定丝瓜白粉病性状的方法，采用M5349引物对丝瓜样品基因组进行PCR扩增得到PCR产物，根据PCR产物的序列或片段大小鉴定丝瓜白粉病性状，具体如下：1)采用M5349引物对丝瓜样品基因组进行PCR扩增得到PCR产物；2)如M2)或N2):M2):检测步骤1)得到的PCR产物的序列，如果PCR产物含有SEQIDNO.1所示序列、不含有SEQIDNO.2所示序列，则该样品为感白粉病；如果PCR产物含有SEQIDNO.2所示序列、不含有SEQIDNO.1所示序列，则该样品为抗白粉病；如果PCR产物含有SEQIDNO.1所示序列和SEQIDNO.2所示序列，则该样品为感白粉病；N2):检测步骤1)得到的PCR产物的大小，如果PCR产物仅含有195bp的DNA片段，则该样品为感白粉病；如果PCR产物仅含有151bp的DNA片段，则该样品为抗白粉病；如果PCR产物含有195bp的DNA片段和151bp的DNA片段，则该样品为感白粉病。本专利技术的第八方面，在于提供一种丝瓜辅助育种方法，包括检测与丝瓜白粉病相关的分子标记或者通过用于扩增上述与丝瓜白粉病相关的分子标记的引物对/用于鉴定或辅助鉴定丝瓜白粉病形状的试剂盒进行分子标记检测的步骤。本专利技术的有益效果是：本专利技术首次发现了与丝瓜白粉病相关的分子标记M5349，其核苷酸序列如SEQIDNO.1所示，该分子标记与丝瓜白粉病性状显著相关：利用M5349标记检测F2群体，发现90.9％(30/33)抗白粉病系扩增出的条带为151bp；87.5％(42/48)感白粉病系扩增出的条带为195bp，或者是195bp和151bp；可作为丝瓜抗白粉病性状的分子标记，用于鉴定或辅助鉴定丝瓜的抗白粉病性状和/或丝瓜辅助育种中。附图说明图1是抗白粉病丝瓜93075和感白粉病丝瓜S1174的外观图。图2是白粉病基因定位图：其中，上半部分为BSA-Seq定位结果；下半部分为分子标记精细定位结果。图3是用M5349引物对扩增实施例1中抗白粉病丝瓜93075、感白粉病丝瓜S1174、F1、以及部分F2的电泳图：其中，第1泳道为Marker，2-14泳道为F2，15泳道为93075，16泳道为S1174，17泳道为F1；其中，第2、3、5、6、9、10、14、15、17为感白粉病，第4、7、8、11-13、16为抗白粉病。具体实施方式以下结合具体的实施例及附图对本专利技术的内容作进一步详细的说明。应理解，这些实施例仅用于说明本专利技术而不用于限制本专利技术的范围。下列实施例中未注明具体条件的实验方法，通常按照常规条件，例如Sambrook等人，分子克隆：实验室手册(NewYork:ColdSpringHarborLaboratoryPress，1989)中所述的条件，或按照制造厂商所建议的条件。实施例中所用到的各种常用化学试剂，均为市售产品。实施例1与丝瓜白粉病性状相关基因的定位1、实验材料抗白粉病丝瓜93075来源于：广东省农业科学院蔬菜研究所选育的丝瓜自交系。感白粉病丝瓜S1174来源于：广东省农业科学院蔬菜研究所选育的丝瓜自交系。上述抗白粉病丝瓜93075和感白粉病丝瓜S1174的白粉病本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种与丝瓜白粉病相关的分子标记，其特征在于：所述分子标记位于8号染色体的52.69Mb和53.49Mb区域内。/n

【技术特征摘要】
1.一种与丝瓜白粉病相关的分子标记，其特征在于：所述分子标记位于8号染色体的52.69Mb和53.49Mb区域内。


2.根据权利要求1所述的分子标记，其特征在于：所述分子标记的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示。


3.根据权利要求2所述的分子标记，其特征在于：所述分子标记的多态性为丝瓜基因组中含有SEQIDNO.1第109～151位或缺失SEQIDNO.1第109～151位。


4.用于扩增权利要求1～3中任一项所述与丝瓜白粉病相关的分子标记的引物对，其特征在于，所述引物对的序列如下所示：
M5349-F:TTGAGGTATTACTTCCATC(SEQIDNO.3)；
M5349-R:GCATCTTGAAATCTAGGT(SEQIDNO.4)。


5.一种用于鉴定或辅助鉴定丝瓜白粉病...

【专利技术属性】
技术研发人员：吴海滨，赵钢军，罗剑宁，龚浩，李俊星，郑晓明，刘小茜，
申请(专利权)人：广东省农业科学院蔬菜研究所，
类型：发明
国别省市：广东;44