检测多主棒孢菌的琥珀酸脱氢酶D亚基点突变类型的方法及所用引物组合物技术

技术编号:26495811 阅读:34 留言:0更新日期:2020-11-27 15:21
本发明专利技术公开了一种以MAS‑PCR技术检测多主棒孢菌对SDHI杀菌剂抗药性的方法及其所用引物组合物。所述引物组合物中的特异性引物D95E‑R、H105R‑R、G109V‑R分别为针对抗啶酰菌胺的多主棒孢菌琥珀酸脱氢酶D亚基突变位点D95E、H105R和G109V设计的反向引物,对应的序列在突变位点处,且对3’端碱基进行特殊的设计,提高了引物的特异性。本发明专利技术检测或辅助检测多主棒孢菌对SDHI杀菌剂抗药性的方法可以在一个PCR反应管中同时检测出D95E、H105R和G109V 3种突变类型,相比较其他只能检测单一突变的检测方法,该方法具有省时,省力,快速,高通量的优点,可准确检测大量样品。

【技术实现步骤摘要】
检测多主棒孢菌的琥珀酸脱氢酶D亚基点突变类型的方法及所用引物组合物
本专利技术涉及植物保护和生物
中一种检测多主棒孢菌的琥珀酸脱氢酶D亚基点突变类型的方法及所用引物组合物。
技术介绍
由多主棒孢菌(Corynesporacassiicoa)引起的黄瓜棒孢叶斑病是果蔬上一种非常普遍的病害,且危害十分严重,给果蔬生产造成了巨大的损失。黄瓜棒孢叶斑病一般田间发病率为10%-25%,严重时可达60%-70%,甚至100%。目前防治该病害仍然主要依赖于杀菌剂。琥珀酸脱氢酶抑制剂(SDHI)类杀菌剂是生产上现在使用较多的一类杀菌剂。但由于其大量使用,多主棒孢菌已对其产生了抗药性,而该药的防治效果也随之大幅度下降。对抗性菌株进行研究发现,抗性菌株的琥珀酸脱氢酶B、C、D亚基发生了点突变。研究发现主要的抗性突变类型有:SdhB-H278R/Y,SdhB-I280V,SdhC-S73P,SdhD-G109V,SdhD-H105R,SdhD-D95E,SdhD-S89P,且琥珀酸脱氢酶B、C和D亚基上不同的点突变分别对应不同的抗性水平。其中,本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.检测或辅助检测多主棒孢菌的琥珀酸脱氢酶D亚基点突变类型的引物组合物,其特征在于:所述琥珀酸脱氢酶D亚基点突变类型为SdhD-G109V,SdhD-H105R和SdhD-D95E这三种氨基酸点突变,所述引物组合物由MAS-R、MAS-F、D95E-R、H105R-R和G109V-R组成,所述MAS-F为对应于野生型多主棒孢菌琥珀酸脱氢酶D亚基的MAS-PCR上游引物,所述MAS-R为对应于野生型多主棒孢菌琥珀酸脱氢酶D亚基的一条MAS-PCR下游引物,所述D95E-R为对应于多主棒孢菌琥珀酸脱氢酶D亚基上SdhD-D95E突变的一条MAS-PCR下游引物,所述H105R-R为对应于多主棒孢菌...

【技术特征摘要】
1.检测或辅助检测多主棒孢菌的琥珀酸脱氢酶D亚基点突变类型的引物组合物,其特征在于:所述琥珀酸脱氢酶D亚基点突变类型为SdhD-G109V,SdhD-H105R和SdhD-D95E这三种氨基酸点突变,所述引物组合物由MAS-R、MAS-F、D95E-R、H105R-R和G109V-R组成,所述MAS-F为对应于野生型多主棒孢菌琥珀酸脱氢酶D亚基的MAS-PCR上游引物,所述MAS-R为对应于野生型多主棒孢菌琥珀酸脱氢酶D亚基的一条MAS-PCR下游引物,所述D95E-R为对应于多主棒孢菌琥珀酸脱氢酶D亚基上SdhD-D95E突变的一条MAS-PCR下游引物,所述H105R-R为对应于多主棒孢菌琥珀酸脱氢酶D亚基上SdhD-H105R突变的一条MAS-PCR下游引物,所述G109V-R为对应于多主棒孢菌琥珀酸脱氢酶D亚基上SdhD-G109V突变的一条MAS-PCR下游引物。


2.根据权利要求1所述的引物组合物,其特征在于:所述MAS-F是核苷酸序列为序列表中序列1的单链DNA,所述MAS-R是核苷酸序列为序列表中序列2的单链DNA,所述D95E-R是核苷酸序列为序列表中序列3的单链DNA,所述H105R-R是核苷酸序列为序列表中序列4的单链DNA,所述G109V-R是核苷酸序列为序列表中序列5的单链DNA。


3.检测或辅助检测多主棒孢菌的琥珀酸脱氢酶D亚基点突变类型的的试剂或试剂盒,其特征在于:所述试剂或试剂盒包括权利要求1或2所述的引物组合物;所述琥珀酸脱氢酶D亚基点突变类型为SdhD-G109V,SdhD-H105R和SdhD-D95E这三种氨基酸点突变。


4.权利要求1或2所述的引物组合物在检测或辅助检测多主棒孢菌对SDHI杀菌剂抗药性中的应用或在制备检测或辅助检测多主棒孢菌对SDHI杀菌剂抗药性产品中的应用。


5.权利要求3所述的试剂或试剂盒在检测或辅助检测多主棒孢菌对SDHI杀菌剂抗药性中的应用或在制备检测或辅助检测多主棒孢菌对SDHI杀菌剂抗药性产品中的应用。


6.检测或辅助检测多主棒孢菌的琥珀酸脱氢酶D亚基点突变类型的方法,其特征在于,所述方法包括以待鉴别多主棒孢菌的基因组DNA为模板,用权利要求1或2所述引物组合物进行MAS-PCR扩增得到MAS-PCR产物,检测所述MAS-PCR产物的大小,如果所述MAS-PCR产物为大于400bp至小于500bp的一个DNA片段,则所...

【专利技术属性】
技术研发人员:石延霞李宝聚孙炳学谢学文柴阿丽李磊
申请(专利权)人:中国农业科学院蔬菜花卉研究所
类型:发明
国别省市:北京;11

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