【技术实现步骤摘要】
一种鉴别西葫芦品种真伪性的方法
本专利技术属于生物
,具体涉及一种鉴别西葫芦品种真伪性的方法,该方法可应用于生物技术推广服务,为西葫芦种质资源和品种保护提供技术支持。
技术介绍
西葫芦,又名美洲南瓜,是葫芦科南瓜属重要的栽培蔬菜,其营养丰富,且含有一种抗干扰素的诱生剂,能够提高人体免疫力。西葫芦具有生长期短、产量高、耐贮运、适宜间作套种等优点,其已成为栽培面积仅次于黄瓜的瓜类蔬菜。我国西葫芦的种植面积超多500万亩,仅山东寿光每天的西葫芦产量7.5-10万公斤,具有广阔的应用前景和巨大的经济潜力。部分地区将西葫芦纳入非主要农作物登记目录,但是由于各省市之间品种审定相互不协调,市场中的西葫芦品种管理未能有效跟进。西葫芦品种知识产权保护不够完善,导致西葫芦存在假冒种子、套用亲本和F1的现象,这不仅严重打击育种工作者的积极性,也对广大西葫芦种植户带来了巨大的经济损失。例如,2016年4月新疆农林牧司法鉴定中心对“精品瑞丰9号”打籽葫芦种子进行的司法鉴定表明,农户购买的该西葫芦种子批存在严重混杂退化,给农民造成重大损失。如何高效进行西葫芦品种监管,保护育种家和菜农的经济权益已成为当前西葫芦产业发展面临的主要难题之一。根据《非主要农作物品种登记指南》的要求,品种特性说明和品种DUS测试报告中涉及的有关性状如有明确关联基因,可以直接提交DNA检测结果。因此,建立一套基于DNA指纹有效进行西葫芦品种真实性鉴定的标准显得尤为重要。基于分子标记技术进行品种鉴定,具有不受环境因素影响、精确度高等优点。目前,我国尚没有西葫芦 ...
【技术保护点】
1.SNP位点组合,包括西葫芦基因组的48个SNP位点;所述48个SNP位点如下:/nCupoSNP01位点为Chr01染色体上的第2807880位核苷酸;/nCupoSNP02位点为Chr01染色体上的第9791465位核苷酸;/nCupoSNP03位点为Chr01染色体上的第19069993位核苷酸;/nCupoSNP04位点为Chr02染色体上的第1687667位核苷酸;/nCupoSNP05位点为Chr03染色体上的第794938位核苷酸;/nCupoSNP06位点为Chr03染色体上的第799507位核苷酸;/nCupoSNP07位点为Chr04染色体上的第4509600位核苷酸;/nCupoSNP08位点为Chr04染色体上的第7015999位核苷酸;/nCupoSNP09位点为Chr04染色体上的第11177727位核苷酸;/nCupoSNP10位点为Chr05染色体上的第4771908位核苷酸;/nCupoSNP11位点为Chr05染色体上的第9266170位核苷酸;/nCupoSNP12位点为Chr06染色体上的第3551450位核苷酸;/nCupoSNP13位点为C ...
【技术特征摘要】
1.SNP位点组合,包括西葫芦基因组的48个SNP位点;所述48个SNP位点如下:
CupoSNP01位点为Chr01染色体上的第2807880位核苷酸;
CupoSNP02位点为Chr01染色体上的第9791465位核苷酸;
CupoSNP03位点为Chr01染色体上的第19069993位核苷酸;
CupoSNP04位点为Chr02染色体上的第1687667位核苷酸;
CupoSNP05位点为Chr03染色体上的第794938位核苷酸;
CupoSNP06位点为Chr03染色体上的第799507位核苷酸;
CupoSNP07位点为Chr04染色体上的第4509600位核苷酸;
CupoSNP08位点为Chr04染色体上的第7015999位核苷酸;
CupoSNP09位点为Chr04染色体上的第11177727位核苷酸;
CupoSNP10位点为Chr05染色体上的第4771908位核苷酸;
CupoSNP11位点为Chr05染色体上的第9266170位核苷酸;
CupoSNP12位点为Chr06染色体上的第3551450位核苷酸;
CupoSNP13位点为Chr07染色体上的第1076750位核苷酸;
CupoSNP14位点为Chr07染色体上的第7776963位核苷酸;
CupoSNP15位点为Chr07染色体上的第8150946位核苷酸;
CupoSNP16位点为Chr08染色体上的第419732位核苷酸;
CupoSNP17位点为Chr08染色体上的第7173914位核苷酸;
CupoSNP18位点为Chr08染色体上的第8024934位核苷酸;
CupoSNP19位点为Chr09染色体上的第1524784位核苷酸;
CupoSNP20位点为Chr09染色体上的第1823037位核苷酸;
CupoSNP21位点为Chr09染色体上的第2169965位核苷酸;
CupoSNP22位点为Chr10染色体上的第2352404位核苷酸;
CupoSNP23位点为Chr10染色体上的第4943533位核苷酸;
CupoSNP24位点为Chr11染色体上的第7237965位核苷酸;
CupoSNP25位点为Chr11染色体上的第9818902位核苷酸;
CupoSNP26位点为Chr12染色体上的第4936646位核苷酸;
CupoSNP27位点为Chr12染色体上的第6034493位核苷酸;
CupoSNP28位点为Chr12染色体上的第8635520位核苷酸;
CupoSNP29位点为Chr13染色体上的第6704302位核苷酸;
CupoSNP30位点为Chr13染色体上的第6770190位核苷酸;
CupoSNP31位点为Chr13染色体上的第7984331位核苷酸;
CupoSNP32位点为Chr13染色体上的第8283301位核苷酸;
CupoSNP33位点为Chr14染色体上的第5675208位核苷酸;
CupoSNP34位点为Chr14染色体上的第8439875位核苷酸;
CupoSNP35位点为Chr15染色体上的第107674位核苷酸;
CupoSNP36位点为Chr15染色体上的第997997位核苷酸;
CupoSNP37位点为Chr15染色体上的第8052733位核苷酸;
CupoSNP38位点为Chr16染色体上的第441092位核苷酸;
CupoSNP39位点为Chr16染色体上的第4936150位核苷酸;
CupoSNP40位点为Chr16染色体上的第8226807位核苷酸;
CupoSNP41位点为Chr17染色体上的第365539位核苷酸;
CupoSNP42位点为Chr17染色体上的第3071924位核苷酸;
CupoSNP43位点为Chr18染色体上的第5566093位核苷酸;
CupoSNP44位点为Chr19染色体上的第105081位核苷酸;
CupoSNP45位点为Chr19染色体上的第1475103位核苷酸;
CupoSNP46位点为Chr19染色体上的第6337473位核苷酸;
CupoSNP47位点为Chr20染色体上的第1391021位核苷酸;
CupoSNP48位点为Chr20染色体上的第7417753位核苷酸。
2.引物组合,包括
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP01位点的引物组1、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP02位点的引物组2、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP03位点的引物组3、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP04位点的引物组4、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP05位点的引物组5、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP06位点的引物组6、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP07位点的引物组7、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP08位点的引物组8、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP09位点的引物组9、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP10位点的引物组10、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP11位点的引物组11、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP12位点的引物组12、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP13位点的引物组13、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP14位点的引物组14、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP15位点的引物组15、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP16位点的引物组16、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP17位点的引物组17、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP18位点的引物组18、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP19位点的引物组19、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP20位点的引物组20、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP21位点的引物组21、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP22位点的引物组22、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP23位点的引物组23、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP24位点的引物组24、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP25位点的引物组25、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP26位点的引物组26、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP27位点的引物组27、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP28位点的引物组28、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP29位点的引物组29、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP30位点的引物组30、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP31位点的引物组31、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP32位点的引物组32、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP33位点的引物组33、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP34位点的引物组34、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP35位点的引物组35、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP36位点的引物组36、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP37位点的引物组37、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP38位点的引物组38、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP39位点的引物组39、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP40位点的引物组40、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP41位点的引物组41、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP42位点的引物组42、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP43位点的引物组43、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP44位点的引物组44、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP45位点的引物组45、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP46位点的引物组46、
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP47位点的引物组47和
用于扩增权利要求1中所述CupoSNP48位点的引物组48。
3.如权利要求2所述的引物组合,其特征在于:
所述引物组1由SEQIDNO:1所示的正向引物01F1、SEQIDNO:2所示的正向引物01F2和SEQIDNO:3所示的反向引物01R组成;
所述引物组2由SEQIDNO:4所示的正向引物02F1、SEQIDNO:5所示的正向引物02F2和SEQIDNO:6所示的反向引物02R组成;
所述引物组3由SEQIDNO:7所示的正向引物03F1、SEQIDNO:8所示的正向引物03F2和SEQIDNO:9所示的反向引物03R组成;
所述引物组4由SEQIDNO:10所示的正向引物04F1、SEQIDNO:11所示的正向引物04F2和SEQIDNO:12所示的反向引物04R组成;
所述引物组5由SEQIDNO:13所示的正向引物05F1、SEQIDNO:14所示的正向引物05F2和SEQIDNO:15所示的反向引物05R组成;
所述引物组6由SEQIDNO:16所示的正向引物06F1、SEQIDNO:17所示的正向引物06F2和SEQIDNO:18所示的反向引物06R组成;
所述引物组7由SEQIDNO:19所示的正向引物07F1、SEQIDNO:20所示的正向引物07F2和SEQIDNO:21所示的反向引物07R组成;
所述引物组8由SEQIDNO:22所示的正向引物08F1、SEQIDNO:23所示的正向引物08F2和SEQIDNO:24所示的反向引物08R组成;
所述引物组9由SEQIDNO:25所示的正向引物09F1、SEQIDNO:26所示的正向引物09F2和SEQIDNO:27所示的反向引物09R组成;
所述引物组10由SEQIDNO:28所示的正向引物10F1、SEQIDNO:29所示的正向引物10F2和SEQIDNO:30所示的反向引物10R组成;
所述引物组11由SEQIDNO:31所示的正向引物11F1、SEQIDNO:32所示的正向引物11F2和SEQIDNO:33所示的反向引物11R组成;
所述引物组12由SEQIDNO:34所示的正向引物12F1、SEQIDNO:35所示的正向引物12F2和SEQIDNO:36所示的反向引物12R组成;
所述引物组13由SEQIDNO:37所示的正向引物13F1、SEQIDNO:38所示的正向引物13F2和SEQIDNO:39所示的反向引物13R组成;
所述引物组14由SEQIDNO:40所示的正向引物14F1、SEQIDNO:41所示的正向引物14F2和SEQIDNO:42所示的反向引物14R组成;
所述引物组15由SEQIDNO:43所示的正向引物15F1、SEQIDNO:44所示的正向引物15F2和SEQIDNO:45所示的反向引物15R组成;
所述引物组16由SEQIDNO:46所示的正向引物16F1、SEQIDNO:47所示的正向引物16F2和SEQIDNO:48所示的反向引物16R组成;
所述引物组17由SEQIDNO:49所示的正向引物17F1、SEQIDNO:50所示的正向引物17F2和SEQIDNO:51所示的反向引物17R组成;
所述引物组18由SEQIDNO:52所示的正向引物18F1、SEQIDNO:53所示的正向引物18F2和SEQIDNO:54所示的反向引物18R组成;
所述引物组19由SEQIDNO:55所示的正向引物19F1、SEQIDNO:56所示的正向引物19F2和SEQIDNO:57所示的反向引物19R组成;
所述引物组20由SEQIDNO:58所示的正向引物20F1、SEQIDNO:59所示的正向引物20F2和SEQIDNO:60所示的反向引物20R组成;
所述引物组21由SEQIDNO:61所示的正向引物21F1、SEQIDNO:62所示的正向引物21F2和SEQIDNO:63所示的反向引物21R组成;
所述引物组22由SEQIDNO:64所示的正向引物22F1、SEQIDNO:65所示的正向引物22F2和SEQIDNO:66所示的反向引物22R组成;
所述引物组23由SEQIDNO:67所示的正向引物23F1、SEQIDNO:68所示的正向引物23F2和SEQIDNO:69所示的反向引物23R组成;
所述引物组24由SEQIDNO:70所示的正向引物24F1、SEQIDNO:71所示的正向引物24F2和SEQIDNO:72所示的反向引物24R组成;
所述引物组25由SEQIDNO:73所示的正向引物25F1、SEQIDNO:74所示的正向引物25F2和SEQIDNO:75所示的反向引物25R组成;
所述引物组26由SEQIDNO:76所示的正向引物26F1、SEQIDNO:77所示的正向引物26F2和SEQIDNO:78所示的反向引物26R组成;
所述引物组27由SEQIDNO:79所示的正向引物27F1、SEQIDNO:80所示的正向引物27F2和SEQIDNO:81所示的反向引物27R组成;
所述引物组28由SEQIDNO:82所示的正向引物28F1、SEQIDNO:83所示的正向引物28F2和SEQIDNO:84所示的反向引物28R组成;
所述引物组29由SEQIDNO:85所示的正向引物29F1、SEQIDNO:86所示的正向引物29F2和SEQIDNO:87所示的反向引物29R组成;
所述引物组30由SEQIDNO:88所示的正向引物30F1、SEQIDNO:89所示的正向引物30F2和SEQIDNO:90所示的反向引物30R组成;
所述引物组31由SEQIDNO:91所示的正向引物31F1、SEQIDNO:92所示的正向引物31F2和SEQIDNO:93所示的反向引物31R组成;
所述引物组32由SEQIDNO:94所示的正向引物32F1、SEQIDNO:95所示的正向引物32F2和SEQIDNO:96所示的反向引物32R组成;
所述引物组33由SEQIDNO:97所示的正向引物33F1、SEQIDNO:98所示的正向引物33F2和SEQIDNO:99所示的反向引物33R组成;
所述引物组34由SEQIDNO:100所示的正向引物34F1、SEQIDNO:101所示的正向引物34F2和SEQIDNO:102所示的反向引物34R组成;
所述引物组35由SEQIDNO:103所示的正向引物35F1、SEQIDNO:104所示的正向引物35F2和SEQIDNO:105所示的反向引物35R组成;
所述引物组36由SEQIDNO:106所示的正向引物36F1、SEQIDNO:107所示的正向引物36F2和SEQIDNO:108所示的反向引物36R组成;
所述引物组37由SEQIDNO:109所示的正向引物37F1、SEQIDNO:110所示的正向引物37F2和SEQIDNO:111所示的反向引物37R组成;
所述引物组38由SEQIDNO:112所示的正向引物38F1、SEQIDNO:113所示的正向引物38F2和SEQIDNO:114所示的反向引物38R组成;
所述引物组39由SEQIDNO:115所示的正向引物39F1、SEQIDNO:116所示的正向引物39F2和SEQIDNO:117所示的反向引物39R组成;
所述引物组40由SEQIDNO:118所示的正向引物40F1、SEQIDNO:119所示的正向引物40F2和SEQIDNO:120所示的反向引物40R组成;
所述引物组41由SEQIDNO:121所示的正向引物41F1、SEQIDNO:122所示的正向引物41F2和SEQIDNO:123所示的反向引物41R组成;
所述引物组42由SEQIDNO:124所示的正向引物42F1、SEQIDNO:125所示的正向引物42F2和SEQIDNO:126所示的反向引物42R组成;
所述引物组43由SEQIDNO:127所示的正向引物43F1、SEQIDNO:128所示的正向引物43F2和SEQIDNO:129所示的反向引物43R组成;
所述引物组44由SEQIDNO:130所示的正向引物44F1、SEQIDNO:131所示的正向引物44F2和SEQIDNO:132所示的反向引物44R组成;
所述引物组45由SEQIDNO:133所示的正向引物45F1、SEQIDNO:134所示的正向引物45F2和SEQIDNO:135所示的反向引物45R组成;
所述引物组46由SEQIDNO:136所示的正向引物46F1、SEQIDNO:137所示的正向引物46F2和SEQIDNO:138所示的反向引物46R组成;
所述引物组47由SEQIDNO:139所示的正向引物47F1、SEQIDNO:140所示的正向引物47F2和SEQIDNO:141所示的反向引物47R组成;
所述引物组48由SEQIDNO:142所示的正向引物48F1、SEQIDNO:143所示的正向引物48F2和SEQIDNO:144所示的反向引物48R组成。
4.如权利要求2所述的引物组合,其特征在于:
所述引物组1由SEQIDNO:1自5’末端起第22至46位所示的正向引物01F1、SEQIDNO:2自5’末端起第22至46位所示的正向引物01F2和SEQIDNO:3所示的反向引物01R组成;
所述引物组2由SEQIDNO:4自5’末端起第22至45位所示的正向引物02F1、SEQIDNO:5自5’末端起第22至46位所示的正向引物02F2和SEQIDNO:6所示的反向引物02R组成;
所述引物组3由SEQIDNO:7自5’末端起第22至45位所示的正向引物03F1、SEQIDNO:8自5’末端起第22至43位所示的正向引物03F2和SEQIDNO:9所示的反向引物03R组成;
所述引物...
【专利技术属性】
技术研发人员:温常龙,李海真,张建,杨静静,罗江,张晓飞,李向晶,赵泓,
申请(专利权)人:北京市农林科学院,
类型:发明
国别省市:北京;11
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