一种用于检测水稻香味基因的KASP分子标记和检测方法技术

本发明专利技术涉及一种检测水稻香味基因的KASP分子标记，包括：正向引物1：5'‑TGGCCCGGACGGCGCC‑3'；正向引物2：5'‑GGCCCGGACGGCGCG‑3'，和通用反向引物：5'‑CGGGAGGCGCTGAAGAGGAA‑3'。本发明专利技术还公开一种用上述分子标记检测水稻香味基因的方法，相较于常规分子标记方法，该方法省去PCR后的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳步骤，可以快速、准确的检测出香味基因，具有简单、准确、高效和低成本的优点，极大地促进了水稻香味基因的分子标记辅助选择技术应用，对优质香稻新品种的选育具有重要意义。

【技术实现步骤摘要】
一种用于检测水稻香味基因的KASP分子标记和检测方法
本专利技术涉及一种快速检测大量群体水稻香味基因的KASP分子标记及其方法，属于农业分子生物

技术介绍
随着当前城乡居民稻米消费水平的提高，高端优质大米市场开发的经济价值和市场前景日益受到关注。而香味作为评价优质米的一项重要指标，由于其在大米储藏和米饭蒸煮过程中散发出怡人香气，一直受到消费者的青睐。市场上的高档大米也大多为香米，长期以来优质香味米品种的选育受到广泛重视。研究发现，香稻含有多种挥发性化合物，而直接与水稻香味相关的挥发性物质为2-乙酰-1-吡咯啉(2-acetyl-1-pyrroline，2AP)。国内外学者对水稻香味性状的遗传学研究结果表明，由于甜菜碱醛脱氢酶基因Badh2功能的缺失会导致2AP前体物质的增加，从而积累2AP使稻米产生香味。Bradbury等首先发现水稻第8染色体Badh2基因第7外显子8bp缺失及3bp突变产生无功能蛋白导致水稻香味，Chen等还发现了Badh2中的另外一个等位基因可以导致水稻香味的产生，即第2外显子7bp的缺失。到目前为止该基本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于检测水稻香味基因的KASP分子标记Badh2-E2-KASP，其特征在于，所述分子标记包括：/n正向引物1：5'-TGGCCCGGACGGCGCC-3'；/n正向引物2：5'-GGCCCGGACGGCGCG-3'，和/n通用反向引物：5'-CGGGAGGCGCTGAAGAGGAA-3'。/n

【技术特征摘要】
1.一种用于检测水稻香味基因的KASP分子标记Badh2-E2-KASP，其特征在于，所述分子标记包括：
正向引物1：5'-TGGCCCGGACGGCGCC-3'；
正向引物2：5'-GGCCCGGACGGCGCG-3'，和
通用反向引物：5'-CGGGAGGCGCTGAAGAGGAA-3'。


2.根据权利要求1所述的分子标记，其特征在于，所述Badh2基因第2外显子处发生了7bp的碱基缺失，该位置位于基因转录起始密码子下游304bp到310bp之间，缺失序列为GGCGCCG。


3.根据权利要求1所述的分子标记，其特征在于，正向引物1的5'端带有FAM荧光信号标签，序列为：5'-GAAGGTGACCAAGTTCATGCT-3'。


4.根据权利要求1所述的分子标记，其特征在于，正向引物2的5'端带有HEX荧光信号标签，序列为：5'-GAAGGTCGGAGTCAACGGATT-3'。


5.权利要求1-4中任一项所述分子标记在快速检测水稻香味基因Badh2-E2中的应用。


6.一种快速检测水稻香味基因Badh2-E2的方法，其特征在于，该方法包括以下步骤：
(1)提取水稻植株基因组DNA；
(2)...

【专利技术属性】
技术研发人员：闫影，吴书俊，张丽霞，王凯，胡泽军，
申请(专利权)人：上海市农业科学院，
类型：发明
国别省市：上海;31