一种山羊PPP3CA基因InDel标记的检测方法及其应用技术

本发明专利技术公开了一种山羊PPP3CA基因InDel标记的检测方法及其应用。以待测山羊全基因组DNA为模板，通过PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳，鉴定山羊PPP3CA基因NC_030813.1:g.16472‑16491位InDel位点的基因型。根据PPP3CA基因InDel位点的不同基因型与陕北白绒山羊产仔数的关联分析结果，确定了PPP3CA基因InDel位点的基因型可作为提高山羊产仔数的DNA标记。本发明专利技术通过快速、精准的检测与山羊产仔数密切相关的InDel标记，可快速建立山羊优势遗传资源群体，从而加快山羊繁殖性状的标记辅助选择育种进程。

【技术实现步骤摘要】
一种山羊PPP3CA基因InDel标记的检测方法及其应用
本专利技术属于生物技术与家畜育种领域，涉及基因插入/缺失多态性(InDel)的检测，特别涉及快速、精准的检测与山羊产仔数相关的PPP3CA基因InDel标记。
技术介绍
动物育种技术主要包括以表型和表型值为基础的常规育种技术以及以DNA多态为基础的分子育种技术。作为分子育种技术体系的重要组成部分，标记辅助选择(marker-assistedselection，MAS)育种技术根据与遗传性状显著相关的DNA标记进行性状选择，通过在DNA水平上分析个体的遗传组成，实现对基因型的直接选择，提高育种目标的定向性，在早期选择、无损害性状评价和选择及提高回交育种效率等方面具有优越性。寻找重要功能基因、筛查重要基因遗传变异位点，并分析重要功能基因遗传变异位点与性状的相关性，是标记辅助选择技术应用的前提和关键。插入/缺失多态性(insertion/deletion,InDel)是指DNA序列上核苷酸片段的插入或缺失而引起的DNA序列的改变，插入或缺失片段的长度在1-50bp之间。从DNA水平上对本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种山羊PPP3CA基因插入/缺失多态性的检测方法，其特征在于：包括以下步骤：/n以山羊基因组DNA为模板，通过PCR扩增PPP3CA基因部分片段，对扩增的片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定PPP3CA基因插入/缺失多态性位点的基因型，所述插入/缺失多态性位点位于PPP3CA基因NC_030813.1:g.16472-16491位。/n

【技术特征摘要】
1.一种山羊PPP3CA基因插入/缺失多态性的检测方法，其特征在于：包括以下步骤：
以山羊基因组DNA为模板，通过PCR扩增PPP3CA基因部分片段，对扩增的片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定PPP3CA基因插入/缺失多态性位点的基因型，所述插入/缺失多态性位点位于PPP3CA基因NC_030813.1:g.16472-16491位。


2.根据权利要求1所述一种山羊PPP3CA基因插入/缺失多态性的检测方法，其特征在于：所述PCR的扩增引物对为：
上游引物：5’-TGTTAAAAGTGTCAGAGGAATTAGC-3’；
下游引物：5’-CGCACTTCATTCTGAGTAGCTG-3’。


3.根据权利要求1所述一种山羊PPP3CA基因插入/缺失多态性的检测方法，其特征在于：所述PCR的反应程序为：95℃预变性5min；94℃变性30s，68℃退火30s，72℃延伸20s，18个循环，每循环后退火温度减1℃；50℃退火30s，72℃延伸20s，30个循环；72℃延伸10min。


4.根据权利要求1所述一种山羊PPP3CA基因插入/缺失多态性的检测方法，其特征在于：所述琼脂糖凝胶电泳采用质量浓度为3.0％的琼脂糖凝胶。


5.根据权利要求1所述一种山羊PPP3CA基因插入/缺失...

【专利技术属性】
技术研发人员：白洋洋，王新雨，蓝贤勇，潘传英，陈宏，雷初朝，黄永震，朱海鲸，董书伟，屈雷，
申请(专利权)人：西北农林科技大学，
类型：发明
国别省市：陕西;61