通过细菌宏基因组分析来诊断阿尔茨海默氏症的方法技术

本发明专利技术涉及一种通过细菌宏基因组分析诊断阿尔茨海默氏症的方法，更具体地，涉及通过使用来源于正常人和受试者的样品进行宏基因组分析来分析特定细菌的细胞外囊泡含量的增加或减少来诊断阿尔茨海默氏症和轻度认知障碍的方法。环境中存在的细菌分泌的细胞外囊泡被人体吸收，渗透到脑组织中，从而直接影响诸如阿尔茨海默氏症等认知功能，并且因为阿尔茨海默氏症难以在症状显现之前早期诊断，因此使得有效治疗困难。因此，通过根据本发明专利技术，使用来源于人体的样品，对细菌的细胞外囊泡进行宏基因组分析来预先预测轻度认知障碍和阿尔茨海默氏症发作的风险，可早期诊断和预测阿尔茨海默氏症风险群体以利用适当的治愈延迟该疾病发作的时间或防止该疾病发作，并且在该疾病发作之后，可进行早期诊断，从而降低阿尔茨海默氏症的发生率并提高治疗效果。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】通过细菌宏基因组分析来诊断阿尔茨海默氏症的方法
本专利技术涉及通过细菌宏基因组学分析诊断阿尔茨海默氏症的方法，更具体地，涉及通过使用来源于正常个体的样品和来源于受试者的样品进行细菌宏基因组分析以分析来源于特定细菌的细胞外囊泡的含量的增加或减少来诊断阿尔茨海默氏症的方法等。
技术介绍
痴呆是导致主要脑功能和记忆力逐渐下降的疾病的总称。阿尔茨海默氏症是最常见的痴呆类型，并且75％的痴呆患者患有阿尔茨海默氏症。阿尔茨海默氏症在65岁或以上的人群中占10％，在85岁或以上的人群中占30％至50％。尚不清楚阿尔茨海默氏症的病因，但根据其病理机制，阿尔茨海默氏症被定义为一种退行性神经系统疾病，其具有神经病理学症状，例如神经元外部β-淀粉样蛋白斑块的过多沉积和神经元中的磷酸化tau蛋白的过度产生，导致由于神经元功能受损(例如神经可塑性丧失和神经元死亡)而引起的渐进的认知功能障碍。阿尔茨海默氏症症的原因分为遗传原因和环境原因。作为遗传原因，已知淀粉样蛋白前体蛋白(APP)、早老素1(PS1)和早老素2(PS2)基因的变体，并且尽管它们通常会诱发早发性痴本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种提供用于诊断阿尔茨海默氏症的信息的方法，该方法包括：/n(a)从分离自正常个体的样品和受试者的样品的细胞外囊泡中提取DNA；/n(b)使用具有SEQ ID NO：1和SEQ ID NO：2的成对的引物对所述提取的DNA进行聚合酶链式反应(PCR)；以及/n(c)通过对所述PCR的产物进行测序，与来源于正常个体的样品的来源于细菌的细胞外囊泡的含量比较并确定来源于所述受试者样品的来源于细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。/n

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20171013 KR 10-2017-0133372;20180528 KR 10-2018-001.一种提供用于诊断阿尔茨海默氏症的信息的方法，该方法包括：
(a)从分离自正常个体的样品和受试者的样品的细胞外囊泡中提取DNA；
(b)使用具有SEQIDNO：1和SEQIDNO：2的成对的引物对所述提取的DNA进行聚合酶链式反应(PCR)；以及
(c)通过对所述PCR的产物进行测序，与来源于正常个体的样品的来源于细菌的细胞外囊泡的含量比较并确定来源于所述受试者样品的来源于细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。


2.根据权利要求1所述的方法，其中所述正常个体样品和受试者样品是血液，并且
其中过程(c)包括比较并确定：
来源于选自由脱铁杆菌门(Deferribacteres)、SR1门、互养菌门(Synergistetes)、栖热菌门(Thermi)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少；
来源于选自由α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)、黄小杆菌纲(Flavobacteriia)、脱铁杆菌门(Deferribacteres)和恐球菌纲(Deinococci)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少；
来源于选自立克次体目(Rickettsiales)的细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少；
来源于选自由鞘脂单胞菌科(Sphingomonadaceae)、脱铁杆菌科(Deferribacteraceae)、周蝶菌科(Weeksellaceae)、消化球菌科(Peptococcaceae)、红杆菌科(Rhodobacteraceae)、诺卡氏菌科(Nocardiaceae)、奈瑟菌科(Neisseriaceae)、组织菌科(Tissierellaceae)、黄杆菌科(Flavobacteriaceae)、帕拉普氏菌科(Paraprevotellaceae)、草酸杆菌科(Oxalobacteraceae)、孪生菌科(Gemellaceae)、气球菌科(Aerococcaceae)、纤毛菌科(Leptotrichiaceae)、红环菌科(Rhodocyclaceae)、威廉土氏菌科(Williamsiaceae)和异常球菌科(Deinococcaceae)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少；或者
来源于选自由鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)、黏液螺旋菌属(Mucispirillum)、克劳斯氏菌属(Cloacibacterium)、rc4-4属、柯林斯氏菌属(Collinsella)、罗氏菌属(Rothia)、脱氯单胞菌属(Dechloromonas)、红球菌属(Rhodococcus)、奈瑟菌属(Neisseria)、副球菌属(Paracoccus)、柠檬酸杆菌属(Citrobacter)、紫单胞菌属(Porphyromonas)、厌氧球菌属(Anaerococcus)、普雷沃菌属(Prevotella)、台湾温单胞菌属(Tepidimonas)、纤毛菌属(Leptotrichia)、噬二氧化碳细胞菌属(Capnocytophaga)、安德克氏菌属(Adlercreutzia)、威廉土氏菌属(Williamsia)和异常球菌属(Deinococcus)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。


3.根据权利要求2所述的方法，其中过程(c)，与来源于正常个体的样品相比，将下述的细胞外囊泡的含量增加诊断为阿尔茨海默氏症：
来源于脱铁杆菌门(Deferribacteres)的细菌的细胞外囊泡；
来源于选自由α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)和脱铁杆菌纲(Deferribacteres)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡；
来源于选自由鞘脂单胞菌科(Sphingomonadaceae)、脱铁杆菌科(Deferribacteraceae)、消化球菌科(Peptococcaceae)、红杆菌科(Rhodobacteraceae)、帕拉普氏菌科(Paraprevotellaceae)、孪生菌科(Gemellaceae)、纤毛菌科(Leptotrichiaceae)和威廉土氏菌科(Williamsiaceae)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡；或者
来源于选自由鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)、黏液螺旋菌属(Mucispirillum)、rc4-4属、副球菌属(Paracoccus)、紫单胞菌属(Porphyromonas)、普雷沃菌属(Prevotella)、台湾温单胞菌属(Tepidimonas)、纤毛菌属(Leptotrichia)、安德克氏菌属(Adlercreutzia)、威廉土氏菌科(Williamsia)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡。


4.根据权利要求2所述的方法，其中过程(c)，与来源于正常个体的样品相比，将下述的细胞外囊泡的含量减少诊断为阿尔茨海默氏症：
来源于选自由SR1门、互养菌门(Synergistetes)和栖热菌门(Thermi)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡；
来源于选自由黄小杆菌纲(Flavobacteriia)和恐球菌纲(Deinococci)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡；
来源于立克次体目(Rickettsiales)的细菌的细胞外囊泡；
来源于选自由周蝶菌科(Weeksellaceae)、诺卡氏菌科(Nocardiaceae)、奈瑟菌科(Neisseriaceae)、组织菌科(Tissierellaceae)、黄杆菌科(Flavobacteriaceae)、草酸杆菌科(Oxalobacteraceae)、气球菌科(Aerococcaceae)、红环菌科(Rhodocyclaceae)、异常球菌科(Deinococcaceae)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡；或者
来源于选自由克劳斯氏菌属(Cloacibacterium)、柯林斯氏菌属(Collinsella)、罗氏菌属(Rothia)、脱氯单胞菌属(Dechloromonas)、红球菌属(Rhodococcus)、奈瑟菌属(Neisseria)、柠檬酸杆菌属(Citrobacter)、厌氧球菌属(Anaerococcus)、噬二氧化碳细胞菌属(Capnocytophaga)、异常球菌属(Deinococcus)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡。


5.根据权利要求2所述的方法，其中，所述血液是全血、血清、血浆或血液单核细胞。


6.一种诊断阿尔茨海默氏症的方法，该方法包括：
(a)从分离自正常个体的样品和受试者的样品的细胞外囊泡中提取DNA；
(b)使用具有SEQIDNO：1和SEQIDNO：2的成对的引物对所述提取的DNA进行聚合酶链式反应(PCR)；以及
(c)通过对所述PCR的产物进行测序，与来源于正常个体的样品的来源于细菌的细胞外囊泡的含量比较并确定来源于所述受试者样品的来源于细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。


7.一种提供用于诊断轻度认知障碍的信息的方法，该方法包括：
(a)从分离自正常个体的样品和受试者的样品的细胞外囊泡中提取DNA；
(b)使用具有SEQIDNO：1和SEQIDNO：2的成对的引物对所述提取的DNA进行聚合酶链式反应(PCR)；以及
(c)通过对所述PCR的产物进行测序，与来源于正常个体的样品的来源于细菌的细胞外囊泡的含量比较并确定所述来源于受试者样品的来源于细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少。


8.根据权利要求7所述的方法，其中所述正常个体样品和受试者样品是血液，并且
其中过程(c)包括比较并确定：
来源于选自由梭杆菌门(Fusobacteria)、蓝细菌门(Cyanobacteria)、SR1门、TM7门、栖热菌门(Thermi)、绿弯菌门(Chloroflexi)和装甲菌门(Armatimonadetes)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少；
来源于选自由变形菌纲(Betaproteobacteria)、梭杆菌纲(Fusobacteriia)、叶绿体纲(Chloroplast)、TM7-3纲、恐球菌纲(Deinococci)和菌毛单胞菌纲(Fimbriimonadia)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少；
来源于选自由木霉菌目(Streptophyta)和立克次体目(Rickettsiales)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少；
来源于选自由周蝶菌科(Weeksellaceae)、梭杆菌科(Fusobacteriaceae)、黄色单胞菌科(Xanthomonadaceae)、红环菌科(Rhodocyclaceae)、臭杆菌科(Odoribacteraceae)、红杆菌科(Rhodobacteraceae)、诺卡氏菌科(Nocardiaceae)、草酸杆菌科(Oxalobacteraceae)、微杆菌科(Microbacteriaceae)、异常球菌科(Deinococcaceae)、类芽孢杆菌科(Paenibacillaceae)、根瘤菌科(Rhizobiaceae)和菌毛单胞菌科(Fimbriimonadaceae)组成的群组中的一种或多种细菌的细胞外囊泡的含量增加或减少；或者
来源于选自由克劳斯氏菌属(Cloacibacterium)、梭杆菌属(Fusobacterium)、乳球...

【专利技术属性】
技术研发人员：金润根，韩平林，朴珍英，
申请(专利权)人：MD保健株式会社，梨花女子大学校产学协力团，
类型：发明
国别省市：韩国;KR