一种用于评估幼年型粒单核细胞白血病预后的全基因组DNA甲基化检测方法技术

本发明专利技术公开了一种用于评估幼年型粒单核细胞白血病预后的全基因组DNA甲基化检测方法，包括以下步骤：a.文库构建；b.生物信息分析；c.构建全基因组DNA甲基化图谱。本发明专利技术通过检测DNA甲基化水平预测JMML预后，JMML患者异常高甲基化水平提示预后不良,本发明专利技术建立JMML DNA甲基化检测方法对于JMML预后评估具有重要的意义，去甲基化药物也有望成为高甲基化水平JMML患者治疗的重要药物之一。本发明专利技术为JMML预后评估及药物疗效预测奠定了理论基础和试验基础，具有广阔的应用前景。

【技术实现步骤摘要】
一种用于评估幼年型粒单核细胞白血病预后的全基因组DNA甲基化检测方法
本专利技术属于生物
，具体涉及一种用于评估幼年型粒单核细胞白血病预后的全基因组DNA甲基化检测方法。
技术介绍
幼年型粒单核细胞白血病(Juvenilemyelomonocyticleukemia,JMML)是一类发病年龄小，预后差异显著的疾病。明确预后对于疾病治疗选择至关重要。目前此类疾病预后指标有限，JMML突变基因对于预后一定的指示意义，但是同种基因预后差异明显，如NRAS基因突变患者部分疾病进展迅速，病情凶险，只有通过造血干细胞移植(Hematopoieticstemcelltransplantation,HSCT)方有治愈可能；部分患者病情平稳，可获得自发缓解。近年来研究表明表观遗传学在肿瘤发病机制及预后评估中起着举足轻重的地位。DNA甲基化是一种被广泛研究的表观遗传修饰方式,与组蛋白修饰等方式一起,在调控基因表达和染色质构象等方面发挥了重要作用。通常地,甲基化DNA指5-甲基胞嘧啶(5mC)，它是在DNA甲基转移酶(DNMT)的作用下将甲基基本文档来自技高网...

【技术保护点】
1. 一种用于评估幼年型粒单核细胞白血病预后的全基因组DNA甲基化检测方法，其特征在于：包括以下步骤：/na.文库构建/nⅰ.DNA提取：使用基因组DNA提取试剂盒对样本DNA进行核酸提取；/nⅱ.基因组文库构建/nⅰ）样品打断：样品打断方法是Covaris打断法，均可将样品DNA打碎至100-300 bp范围的片段；/nⅱ) DNA片段末端修复、3’端加 A 碱基，连接测序接头；/nⅲ)采用 ZYMO EZ DNA Methylation-Gold kit 进行 Bisulfite 处理；/nⅳ)处理后切胶回收，并进行文库片段大小选择；/nⅴ)合格的文库用于上机测序；/nb.生物信息分析/n...

【技术特征摘要】
1.一种用于评估幼年型粒单核细胞白血病预后的全基因组DNA甲基化检测方法，其特征在于：包括以下步骤：
a.文库构建
ⅰ.DNA提取：使用基因组DNA提取试剂盒对样本DNA进行核酸提取；
ⅱ.基因组文库构建
ⅰ）样品打断：样品打断方法是Covaris打断法，均可将样品DNA打碎至100-300bp范围的片段；
ⅱ)DNA片段末端修复、3’端加A碱基，连接测序接头；
ⅲ)采用ZYMOEZDNAMethylation-Goldkit进行Bisulfite处理；
ⅳ)处理后切胶回收，并进行文库片段大小选择；
ⅴ)合格的文库用于上机测序；
b.生物信息分析
ⅰ.标准信息分析；
ⅱ.数据统计与质控；
ⅲ.C碱基的甲基化水平分析；
ⅳ.全基因组甲基化水平...

【专利技术属性】
技术研发人员：杨文钰，张英驰，竺晓凡，
申请(专利权)人：中国医学科学院血液病医院中国医学科学院血液学研究所，
类型：发明
国别省市：天津;12