【技术实现步骤摘要】
基于焦磷酸测序技术的GATA3基因甲基化检测试剂盒及检测方法
本专利技术属于核酸体外扩增及甲基化的定位、定量检测领域，具体涉及一种基于焦磷酸测序技术的GATA3基因CpG岛甲基化定量检测引物、试剂盒及检测方法。
技术介绍
世界卫生组织(WHO)统计，全世界女性乳腺癌(Breastcancer)发病率为150万人/年，死亡率57万人/年，乳腺癌正成为危害女性健康、影响女性生活质量的最大威胁。由于乳腺癌的复杂性和异质性，致使临床分期、病理分级甚至分子分型相同的患者对同一治疗方案获益率差异极大，甚至引发毒副作用。由此表明癌细胞的特性并不完全由其DNA序列决定，表观遗传信息(包括组蛋白的乙酰化修饰、DNA甲基化、染色质重塑以及非编码RNA)也参与其中，并逐渐成为肿瘤分子病理研究新的热点。DNA甲基化主要是在CpG甲基化结合蛋白(MBDs)和DNA甲基转移酶(DNMTs)的作用下，将甲基从S-腺苷甲硫氨酸转移到胞嘧啶(C)的5’端，形成5-甲基胞嘧啶(5-mC)。正常人类基因组中约有5000万个5-mC，其中1-2％的...
【技术保护点】
1.一种基于焦磷酸测序技术检测GATA3基因甲基化的引物，其特征在于：包括GATA3基因甲基化测序引物GATA3-mS1和/或GATA3-mS2，该测序引物与GATA3基因测序片段相匹配，测序引物的序列如下所示：/nGATA3-mS1：5’-GATTGGTTTTTTTAGGTTT-3’/nGATA3-mS2：5’-CGTTTYGGGGTGTTTATTG-3’。/n
【技术特征摘要】
1.一种基于焦磷酸测序技术检测GATA3基因甲基化的引物，其特征在于：包括GATA3基因甲基化测序引物GATA3-mS1和/或GATA3-mS2，该测序引物与GATA3基因测序片段相匹配，测序引物的序列如下所示：
GATA3-mS1：5’-GATTGGTTTTTTTAGGTTT-3’
GATA3-mS2：5’-CGTTTYGGGGTGTTTATTG-3’。
2.根据权利要求1所述一种基于焦磷酸测序技术检测GATA3基因甲基化的引物，其特征在于：所述测序引物GATA3-mS1对应的测序程序编辑为：
5’-YGTTTTYGTTYGTTTYGTTTTTTTYGTTGGGGYGTTTYGGAGTYGYGTGTTTTTYGTTTYGGGGT-3’。
3.根据权利要求1所述一种基于焦磷酸测序技术检测GATA3基因甲基化的引物，其特征在于：所述测序引物GATA3-mS2对应的测序程序编辑为：5’-YGTAGAGYGTGGTTTGGAGATTYGYGAGTYGGGGAAGGTYGTYGTGGAGTTTYGATTAGAGGTYGGGGTT-3’。
4.根据权利要求1所述一种基于焦磷酸测序技术检测GATA3基因甲基化的引物，其特征在于：所述GATA3基因测序片段采用GATA3基因特异性扩增引物GATA3-mF和GATA3-mR扩增得到，扩增引物的序列如下所示：
GATA3-mF：5’-TAGGGGATGTAGTGGTTTAAAG-3’
GATA3-mR：5’-CAGTCAAAAAAACCAACCCT-3’。
5.一种基于焦磷酸测序技术检测GATA3基因甲基化的试剂盒，其特征在于：该试剂盒包括GATA3基因特异性扩增引物及GATA3基因甲基化测序引物；
所述扩增引物的序列如下所示：
GATA3-mF：5’-TAGGGGATGTAGTGGTTTAAAG-3’
GATA3-mR：5’-CAGTCAAAAAAACCAACCCT-3’
所述测序引物的序列如下所示：
GATA3-mS1：5’-GATTGGTTTTTTTAGGTTT-3’
GATA3-mS2：5’-CGTTTYGGGGTGTTTATTG-3’。
6.根据权利要求5所述...
【专利技术属性】
技术研发人员：王婷，任娟，贺钰婷，乔晓宾，问宇昕，
申请(专利权)人：陕西科技大学，
类型：发明
国别省市：陕西;61
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