一种基于lncRNA评分体系在预测肿瘤免疫治疗效果中的应用制造技术

本发明专利技术提供了一组预测肿瘤免疫治疗疗效或预后的lncRNA，共包括29个于lncRNA，以及基于lncRNA的评分公式。本发明专利技术还提供了一种预测肿瘤免疫治疗疗效或预后的方法，该方法通过lncRNA评分公式将lncRNA分为高分组和低分组，然后对接受免疫治疗的肿瘤患者的疗效和预测进行评估。本发明专利技术的lncRNA评分体系较传统的指标具有更好的敏感性和准确性。

Application of lncrna scoring system in predicting the effect of tumor immunotherapy

【技术实现步骤摘要】
一种基于lncRNA评分体系在预测肿瘤免疫治疗效果中的应用
本专利技术属于生物医药领域，具体涉及一种基于lncRNA评分体系及其在预测肿瘤免疫治疗效果中的应用。
技术介绍
免疫治疗迅速发展，免疫检查点抑制剂尤其是PD-1/PD-L1抑制剂、CTLA-4抑制剂已经改变了包括肺癌、乳腺癌、膀胱癌、黑色素瘤等许多实体肿瘤的治疗情况，并且在一些难治性肿瘤中表现出持久的应答率，成为目前抗实体肿瘤治疗的研究热点。然而在部分接受治疗的患者中，免疫治疗表现出无反应及严重免疫相关副作用。为了优化免疫疗法的使用，精准预测性生物标志物的发现或精准疗效与预后预测体系的建立具有重要的意义。自免疫治疗发展以来，作为最广泛采用的疗效预测因子，PD-L1表达已在许多临床试验中进行了研究。目前，普遍以1％的PD-L1表达量作为临界值将患者分为PD-L1阳性(≥1％)患者和PD-L1阴性(＜1％)患者。在包括Keynote-052、Checkmate024等多个研究中显示，免疫治疗临床疗效在PD-L1阳性中优于PD-L1阴性患者。同时，免疫细胞上PD-L1表达更能普遍反映本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一组预测肿瘤免疫治疗疗效或预后的lncRNA，其特征在于，其包括：DLGAP1-AS1、RAMP2-AS1、BVES-AS1、LIPE-AS1、LINC01118、FGD5-AS1、AL513365.2、EMC1-AS1、FTX、SNHG15、TMEM147-AS1、TTN-AS1、FLG-AS1、CDKN2B-AS1、USP2-AS1、SBF2-AS1、AC113382.1、NOP14-AS、AC012636.1、LINC01605、PCAT1、BRWD1-AS2、USP3-AS1、VPS9D1-AS1、AC093249.6、SNHG8、FUT8-AS1、NKILA、SLFNL1-AS1...

【技术特征摘要】
1.一组预测肿瘤免疫治疗疗效或预后的lncRNA，其特征在于，其包括：DLGAP1-AS1、RAMP2-AS1、BVES-AS1、LIPE-AS1、LINC01118、FGD5-AS1、AL513365.2、EMC1-AS1、FTX、SNHG15、TMEM147-AS1、TTN-AS1、FLG-AS1、CDKN2B-AS1、USP2-AS1、SBF2-AS1、AC113382.1、NOP14-AS、AC012636.1、LINC01605、PCAT1、BRWD1-AS2、USP3-AS1、VPS9D1-AS1、AC093249.6、SNHG8、FUT8-AS1、NKILA、SLFNL1-AS1。


2.一种预测肿瘤免疫治疗疗效或预后的评分体系，其特征在于，所述体系包括如权利要求1所述的lncRNA。


3.如权利要求2所述的评分体系，其特征在于，所述体系包括以下计算公式：
LncRNA得分＝–(DLGAP1-AS1×0.0388404669)–(RAMP2-AS1×0.1155662963)–(BVES-AS1×0.0553720312)–(LIPE-AS1×0.1033882346)+(LINC01118×0.0796557151)–(FGD5-AS1×0.0289597115)–(AL513365.2×0.20586808)–(EMC1-AS1×0.0694844742)+(FTX×0.0852566063)+(SNHG15×0.1004314629)–(TMEM147-AS1×0.0720185014)+(TTN-AS1×0.0540188921)+(FLG-AS1×0.0526396975)–(CDKN2B-AS1×0.0064524961)+(USP2-AS1×0.0747066713)–(SBF2-AS1×0.1293691962)–(AC113382.1×0.2179618875)+(NOP14-AS1×0.0644565543)+(AC012636.1×0.1939511817)–(LINC01605×0.0168478032)+(PCAT1×0.1453946597)+(BRWD1-AS2×0.0298250867)–(USP3-AS1×0.0691270103)+(VPS9D1-AS1×0.0003103997)–(AC093249.6×0.0139283015)–(SNHG8×0.0014401603)–(FUT8-AS1×0.0852427371)+(NKILA×0.1318600645)–(SLFNL1-AS1×0.0472823654)。


4.一种预测肿瘤免疫治疗预后的方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)收集肿瘤患者数据；
(2)筛选与接受免疫治疗患者的生存具有显著相关性的长链非编码RNA(lncRNA)；
(3)建立lncRNA评分公式；
(4)获得lncRNA评分，根据获得的评分将lncRNA分为高评分组和低评分组；
(5)通过lncRNA评分高低预测临床肿瘤免疫治疗疗效或预后，lncRNA评分高判定肿瘤免疫治疗疗效和预后较好；lncRNA评分低则判定肿瘤免疫治疗疗效和预后较差。


5.如权利要求4所述的方法，其特征在于，所述步骤(1)中的数据包括肿瘤患者的所有l...

【专利技术属性】
技术研发人员：姚和瑞，宋尔卫，余运芳，区绮云，李岸霖，张文达，
申请(专利权)人：中山大学孙逸仙纪念医院，
类型：发明
国别省市：广东;44