用于检测直肠癌放化疗敏感性的组合物、微阵列和计算机系统技术方案

本发明专利技术公开用于检测直肠癌放化疗敏感性的组合物、微阵列和计算机系统。本发明专利技术的组合物包括特异性结合至选自由ABL1、AR、CDK1、HDAC1、IRF1、JUN、PRKCB、RELA‑3、STAT1‑2、SUMO1‑3、ACTB、CSNK1G2、FARP1、GAPDH和RPLP0组成的组中的基因的部分连续区域的寡核苷酸。利用该组合物可以用于检测各基因的相对表达水平。另外，基于这些表达水平差异，经特定算法获得敏感性指数(RSI)，据此能够有效地判定检测样品的放化疗敏感性。

Composition, microarray and computer system for detecting chemosensitivity of rectal cancer

【技术实现步骤摘要】
用于检测直肠癌放化疗敏感性的组合物、微阵列和计算机系统
本专利技术涉及生物医学领域，具体涉及直肠癌放化疗敏感性的判断，特别是基于微列阵芯片检测相关基因表达进行精准判断直肠癌放化疗敏感性的技术。
技术介绍
术前放化疗目前已成为针对局部晚期直肠癌患者的标准治疗方法，可显著改善疾病控制和患者的生存结果，但是，不同患者对术前放化疗的敏感性存在非常大的个体差异，敏感性范围甚至可以从完全缓解到促进疾病进展。因此，为避免对术前放化疗敏感性差的患者多余地受到放疗辐射或化疗的毒副作用，建立能够预测放化疗敏感性的方法以鉴别可真正从术前放化疗获益的患者在临床上是有迫切需求的。内窥镜检查术、磁共振成像、PET(正电子发射计算机断层显像)、血清癌胚抗原、免疫组化等方法目前常用于临床上对直肠癌术前放化疗选择治疗方案的辅助判断，但基于这些单个特异标记物的方法依然存在预测准确性较差等问题。许多研究已表明，挖掘基于多基因表达水平模式的方法在预测直肠癌放化疗敏感性、生存结果等方面具有比较好的表现，例如Ghadimi等人鉴定出54个基因、Watanabe等人鉴定出3本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于检测直肠癌放化疗敏感性的组合物，其包括特异性结合至选自由ABL1、AR、CDK1、HDAC1、IRF1、JUN、PRKCB、RELA-3、STAT1-2、SUMO1-3、ACTB、CSNK1G2、FARP1、GAPDH和RPLP0组成的组中的基因的部分连续区域的寡核苷酸。/n

【技术特征摘要】
1.一种用于检测直肠癌放化疗敏感性的组合物，其包括特异性结合至选自由ABL1、AR、CDK1、HDAC1、IRF1、JUN、PRKCB、RELA-3、STAT1-2、SUMO1-3、ACTB、CSNK1G2、FARP1、GAPDH和RPLP0组成的组中的基因的部分连续区域的寡核苷酸。


2.根据权利要求1所述的用于检测直肠癌放化疗敏感性的组合物，其中所述部分连续区域为对应基因的保守区域。


3.根据权利要求1所述的用于检测直肠癌放化疗敏感性的组合物，其中所述寡核苷酸被设计为能够将其一末端固定结合至基材，且至少部分序列能够特异性结合至选自由ABL1、AR、CDK1、HDAC1、IRF1、JUN、PRKCB、RELA-3、STAT1-2、SUMO1-3、ACTB、CSNK1G2、FARP1、GAPDH和RPLP0组成的组中的基因的部分连续区域，从而能够在样品中捕获所需的基因。


4.一种用于检测直肠癌放化疗敏感性的微阵列，其包括根据权利要求1-3任一项所述的组合物和基材，所述基材的表面具有多个独立设置的位点。


5.根据权利要求4所述的用于检测直肠癌放化疗敏感性的微阵列，其中各位点分别具有能够与所述寡核苷酸结合的反应性官能团；或者各位点分别结合所述寡核苷酸中的一种。


6.根据权利要求4或5所述的用于检测直肠癌放化疗敏感性的微阵列，其中各位点以相临位点之间的间隔在0.1-20μm范围内的方式规则排列，各位点的面积小于1μm2。


7.根据权利要求4或5所述的用于...

【专利技术属性】
技术研发人员：王锡山，姜争，李春香，刘恒昌，刘正，关旭，陈海鹏，杨明，袁大巍，郎继东，林慧馨，陈祥彬，田埂，
申请(专利权)人：中国医学科学院肿瘤医院，元码基因科技北京股份有限公司，
类型：发明
国别省市：北京;11