与水稻抽穗期基因紧密连锁的InDel分子标记与应用制造技术

本发明专利技术公开了与水稻抽穗期基因紧密连锁的InDel分子标记与应用，所述分子标记IN2的上游引物序列为SEQ ID NO.2，下游引物序列为SEQ ID NO.3；InDel分子标记IN2在水稻抽穗期基因遗传分析和基因精细定位中的应用；所述分子标记IN10的上游引物序列为SEQ ID NO.6，下游引物序列为SEQ ID NO.7；所述InDel分子标记IN10在水稻抽穗期基因遗传分析和基因精细定位中的应用。

Indel molecular marker closely linked to rice heading stage gene and its application

【技术实现步骤摘要】
与水稻抽穗期基因紧密连锁的InDel分子标记与应用
本专利技术涉及与水稻抽穗期基因紧密连锁的InDel分子标记与应用，特别涉及InDel(insertion-deletionpolymorphisms)分子标记及其在水稻抽穗期基因遗传分析和精细定位中的应用，属于DNA分子标记技术和分子生物学

技术介绍
插入/缺失多态性(insertion-deletion,InDel)分子标记是根据不同个体基因组同源序列发生的核苷酸片段插入或缺失开发的分子标记，即相对于其中一个基因型而言，另一个基因型的基因组中有一定数量的核苷酸插入或缺失。InDel标记兼具了简单重复序列(Simplesequencerepeats，SSRs)和单核苷酸多态性(Singlenucleotidepolymorphisms，SNPs)变异的特征，是一类共显性标记。作为结构变异(structurevariants,SVs)的重要组成部分广泛的存在于基因组中，其分布密度仅次于每268bp就有一个的SNPs,平均每953bp就有一个InDel位点，且远高于SSRs。与SNP标记本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.与水稻抽穗期基因紧密连锁的InDel分子标记IN2，其特征在于，所述分子标记IN2的核苷酸序列为SEQ ID NO.1。/n

【技术特征摘要】
1.与水稻抽穗期基因紧密连锁的InDel分子标记IN2，其特征在于，所述分子标记IN2的核苷酸序列为SEQIDNO.1。


2.如权利要求1所述InDel分子标记IN2，其特征在于，所述分子标记IN2位于水稻第六染色体上，为插入片段的核苷酸序列；
优选的，所述分子标记IN2位于水稻品种日本晴的第六染色体上的位置10008107-10008117，为水稻品种日本晴基因组序列上的插入突变。


3.权利要求1所述InDel分子标记IN2的扩增引物对，其特征在于，扩增分子标记IN2的上游引物序列为SEQIDNO.2，下游引物序列为SEQIDNO.3；
优选的，所述分子标记IN2引物对的扩增区域位于水稻品种日本晴第六染色体上的位置10008072-10008239，序列为SEQIDNO.4。


4.权利要求1所述InDel分子标记IN2在水稻抽穗期基因遗传分析和基因精细定位中的应用。


5.权利要求3所述InDel分子标记IN2的扩增引物对在水稻抽穗期基因遗传分析和基因精细定位中的应用。


6.与水稻抽穗期基因紧密连锁的InDel分子标记IN10，其特征在于，所述分子标记IN10的核苷酸序列为SEQIDNO.5。


7.如权利要求...

【专利技术属性】
技术研发人员：宣宁，柳絮，张华，姚方印，赵倩倩，
申请(专利权)人：山东省农业科学院生物技术研究中心，
类型：发明
国别省市：山东;37