一种肿瘤基因检测解读报告方法及系统技术方案

本发明专利技术涉及数字医疗技术领域，具体涉及一种肿瘤基因检测解读报告方法及系统，本发明专利技术的一种肿瘤基因检测解读报告方法及系统，通过主控模块和与所述主控模块连接的知识库模块、模板管理模块、项目管理模块、样本管理模块、报告管理模块以及数据统计模块和权限管理模块，实现了系统的数据采集的快捷性、丰富性、准确性和可配置性，同时在审核机制和权限管理确保系统数据的安全，最后提供数据统计，便于展示。

A report method and system of tumor gene detection and interpretation

【技术实现步骤摘要】
一种肿瘤基因检测解读报告方法及系统
本专利技术涉及数字医疗
，具体是一种肿瘤基因检测解读报告方法及系统。
技术介绍
随着基因检测技术在医疗健康领域，尤其是在肿瘤的精准诊疗领域的普及推广，越来越多的肿瘤患者、临床医生都认可了这项技术，伴随着检测技术通量的不断增加，每天都有大量的临床肿瘤样本被检测出来，随之而来的就是大量的基因检测结果需要解读，需要出具解读报告。现阶段提供这类基因检测结果解读的服务都存在有一定的局限性，具体表现在以下几个方面：首先，数据解读必须要有一个强大的知识库作为支撑，这个知识库需要有最新最全的肿瘤精准诊疗的知识，如此才能在最大程度上保证每一份样本检测结果都能得到最完善最准确地解读。但是很遗憾，很多的机构目前还是通过手工的方式搜集、整理与管理这些知识数据，这些数据大多以Excel或者Word文档的形式存在于各个遗传咨询人员的个人电脑或工作电脑中，非常不便于团队内部数据的交流与整合，经常出现重复造轮子的情况；其次，不同的公司、不同的项目甚至不同的样本其对解读报告的结构或内容要求可能都是不一样的，甚至是同一个样本根据检测结果的不同也会需要设计不同形式的报告模板，在出报告时往往需要不断调整模板结构，不仅浪费时间，而且可能会出现同类型的模板在不同的遗传咨询人员手中变成不同的样式，造成最终到每一个临床医生或患者手中的报告都不一样，千奇百怪，没有统一的风格；再次，肿瘤基因检测结果的解读是一个十分严谨的工作，不仅要求每一位遗传咨询人员拥有足够丰富的知识背景，如分子生物学、肿瘤学、生理学、药学、免疫学等领域的知识，而且还要求其能充分理解解读报告的逻辑，同时还要求其必须足够的细心，不能遗漏任何一条有益的信息，同时也不能多加任何一条没用甚至有害的信息，这对每一位遗传咨询人员都是一个极大的考验；而且，肿瘤基因检测结果的解读不仅要求严谨，更是一个费时费力的活，一般情况下，一个专业的遗传咨询人员一天最多也就能出具2-3份左右的报告，这对于有海量样本待出的基因检测机构来说简直是不能忍的，要确保报告的严谨性就只能不断招新的专业解读人员，这对于机构的运行成本也是一个极大的考验；另外，无论是样本信息、知识数据，还是解读出来的解读报告，以单个文件的形式存放于个人电脑以及在不同的遗传咨询人员之间传递交流，非常容易造成信息泄露，引起数据安全隐患，这对于肿瘤基因检测行业来说更是不能忍的。
技术实现思路
有鉴于此，本专利技术的目的是提供一种肿瘤基因检测解读报告方法及系统，以解决上述问题。本专利技术的一种肿瘤基因检测解读报告方法及系统，包括主控模块和与所述主控模块连接的知识库模块、模板管理模块、项目管理模块、样本管理模块、报告管理模块以及数据统计模块和权限管理模块；所述知识库模块用于存储与管理相关知识数据，包括NLP数据挖掘子模块、数据整合子模块、增删改查基础功能子模块和数据审核子模块；所述模板管理模块包括框架定义子模块和模板配置子模块，所述框架定义子模块即定义所有模板的基础框架，所述模板配置子模块则是基于框架，配置同类报告需要的版块和基础信息；所述项目管理模块是配置各检测机构对应的实际检测项目信息，包括检测平台、检测内容、检测基因/检测位点、参考文献等等，同时配置该项目对应的各种在所所述模板管理模块中提前配置好的报告模板；所述样本管理模块包括样本信息管理子模块、癌种标准化子模块和检测结果管理子模块，所述样本信息管理子模块可以管理样本基本信息，所述癌种标准化子模块用于处理所述样本信息管理子模块中癌种名称不标准的问题，所述检测结果管理子模块提供样本变异检测结果的上传、筛选与分类；所述报告管理模块包含报告创建子模块、报告审核子模块、报告发送子模块以及报告存档子模块；所述数据统计模块能够对所述知识库模块以及所述模板管理模块、所述项目管理模块、所述样本管理模块、所述报告管理模块中的各类信息进行多方面统计，在系统页面中用统计图表的形式进行展示；所述权限管理模块对系统的所有用户进行权限管理，确保所有的功能和数据只有拥有相应权限的用户才能使用或访问。进一步，所述NLP数据挖掘子模块用于自动从相关资料中挖掘出肿瘤精准用药相关的证据信息以及临床试验；所述数据整合子模块提供对从所述NLP数据挖掘子模块中挖掘得到的数据的整理与整合功能；所述增删改查基础功能子模块能够实现对全部肿瘤精准用药解读相关知识数据的增删改查等基本操作；所述数据审核子模块能够对从所述数据整合子模块以及所述增删改查基础功能子模块中得到的新增或更新后的数据进行审核操作。进一步，所述框架定义子模块用于定义所有模板的基础框架，便于在此基础上配置不同类型的模板，以生成不同样式的报告；模板配置子模块则是基于框架，配置同类报告需要的版块和基础信息，以便报告生成时的调用。进一步，所述样本信息管理子模块提供接口，用于从实验室信息管理系统(LIMS)中导入样本信息，并且通过上传文档或单条添加的形式添加样本信息；所述癌种标准化子模块用于处理所述样本信息管理子模块中癌种名称不标准的问题，确保每个样本能够匹配上所述知识库模块中管理的标准化的癌种名称；所述检测结果管理子模块提供样本变异检测结果的上传与自动过滤和分类，同时也提供网页界面供遗传咨询专家进行变异位点的手动分类与过滤筛选，确保得到与项目及样本信息相匹配的合理位点。进一步，所述报告创建子模块用于选择样本、选择项目及对应报告模板，生成肿瘤基因检测解读报告；报告审核子模块提供对报告的审核功能，确保解读报告的内容准确性和样式美观性；报告发送子模块能够在线将通过所述报告审核子模块终审的报告发送到终端用户手中；报告存档子模块能够对已经发送的终审报告进行存档管理。本专利技术的有益效果是：本专利技术的一种肿瘤基因检测解读报告方法及系统，通过主控模块和与所述主控模块连接的知识库模块、模板管理模块、项目管理模块、样本管理模块、报告管理模块以及数据统计模块和权限管理模块，实现了系统的数据采集的快捷性、丰富性、准确性和可配置性，同时在审核机制和权限管理确保系统数据的安全，最后提供数据统计，便于展示。附图说明下面结合附图和实施例对本专利技术作进一步描述：图1为本专利技术的结构框图。具体实施方式如图1所示：本实施例的一种肿瘤基因检测解读报告方法及系统，包括主控模块和与主控模块连接的知识库模块、模板管理模块、项目管理模块、样本管理模块、报告管理模块以及数据统计模块和权限管理模块；知识库模块用于存储与管理相关知识数据，包括NLP数据挖掘子模块、数据整合子模块、增删改查基础功能子模块和数据审核子模块；模板管理模块包括框架定义子模块和模板配置子模块，框架定义子模块即定义所有模板的基础框架，模板配置子模块则是基于框架，配置同类报告需要的版块和基础信息；项目管理模块是配置各检测机构对应的实际检测项目信息，包括检测平台、检测内容、检测基因/检测位点、参考文献等等，同时配置该项目对应的各种在所模板管理模块中提前配置本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种肿瘤基因检测解读报告方法及系统，其特征在于：包括主控模块和与所述主控模块连接的知识库模块、模板管理模块、项目管理模块、样本管理模块、报告管理模块以及数据统计模块和权限管理模块；/n所述知识库模块用于存储与管理相关知识数据，包括NLP数据挖掘子模块、数据整合子模块、增删改查基础功能子模块和数据审核子模块；/n所述模板管理模块包括框架定义子模块和模板配置子模块，所述框架定义子模块即定义所有模板的基础框架，所述模板配置子模块则是基于框架，配置同类报告需要的版块和基础信息；/n所述项目管理模块是配置各检测机构对应的实际检测项目信息，包括检测平台、检测内容、检测基因/检测位点、参考文献等等，同时配置该项目对应的各种在所所述模板管理模块中提前配置好的报告模板；/n所述样本管理模块包括样本信息管理子模块、癌种标准化子模块和检测结果管理子模块，所述样本信息管理子模块可以管理样本基本信息，所述癌种标准化子模块用于处理所述样本信息管理子模块中癌种名称不标准的问题，所述检测结果管理子模块提供样本变异检测结果的上传、筛选与分类；/n所述报告管理模块包含报告创建子模块、报告审核子模块、报告发送子模块以及报告存档子模块；/n所述数据统计模块能够对所述知识库模块以及所述模板管理模块、所述项目管理模块、所述样本管理模块、所述报告管理模块中的各类信息进行多方面统计，在系统页面中用统计图表的形式进行展示；/n所述权限管理模块对系统的所有用户进行权限管理，确保所有的功能和数据只有拥有相应权限的用户才能使用或访问。/n...

【技术特征摘要】
1.一种肿瘤基因检测解读报告方法及系统，其特征在于：包括主控模块和与所述主控模块连接的知识库模块、模板管理模块、项目管理模块、样本管理模块、报告管理模块以及数据统计模块和权限管理模块；
所述知识库模块用于存储与管理相关知识数据，包括NLP数据挖掘子模块、数据整合子模块、增删改查基础功能子模块和数据审核子模块；
所述模板管理模块包括框架定义子模块和模板配置子模块，所述框架定义子模块即定义所有模板的基础框架，所述模板配置子模块则是基于框架，配置同类报告需要的版块和基础信息；
所述项目管理模块是配置各检测机构对应的实际检测项目信息，包括检测平台、检测内容、检测基因/检测位点、参考文献等等，同时配置该项目对应的各种在所所述模板管理模块中提前配置好的报告模板；
所述样本管理模块包括样本信息管理子模块、癌种标准化子模块和检测结果管理子模块，所述样本信息管理子模块可以管理样本基本信息，所述癌种标准化子模块用于处理所述样本信息管理子模块中癌种名称不标准的问题，所述检测结果管理子模块提供样本变异检测结果的上传、筛选与分类；
所述报告管理模块包含报告创建子模块、报告审核子模块、报告发送子模块以及报告存档子模块；
所述数据统计模块能够对所述知识库模块以及所述模板管理模块、所述项目管理模块、所述样本管理模块、所述报告管理模块中的各类信息进行多方面统计，在系统页面中用统计图表的形式进行展示；
所述权限管理模块对系统的所有用户进行权限管理，确保所有的功能和数据只有拥有相应权限的用户才能使用或访问。


2.根据权利要求1所述的一种肿瘤基因检测解读报告方法及系统，其特征在于：所述NLP数据挖掘子模块用于自...

【专利技术属性】
技术研发人员：徐全，顾丽清，王仙云，王宁，周启明，
申请(专利权)人：求臻医学科技北京有限公司，
类型：发明
国别省市：北京;11