一种与甘肃金鳟生长性状相关的SNP标记及其方法应用技术

一种与甘肃金鳟生长性状相关的SNP标记，其具体方法如下：（1）样本采集；（2）PCR扩增，扩增上游引物：TGGTTGCTGATAATGTACGCC；扩增下游引物：AGGCAGTGTATCGCTATCCA；（3）基因型判定，通过聚丙烯酰胺凝胶电泳SSCP方法来检测甘肃金鳟的基因型，根据凝胶条带的分布，得到5种类型的Ghrelin基因型，分别为AA型、BB型、AB型、AC型和BC型。本发明专利技术的有益效果是本发明专利技术提供的分子遗传标记不受甘肃金鳟年龄的限制，可用于甘肃金鳟早期幼鱼的选育筛选，能够显著加快甘肃金鳟的遗传育种工作。检测甘肃金鳟Ghrelin基因多态性的方法准确可靠，操作简便。同时甘肃金鳟Ghrelin基因SNP位点的检出，为甘肃金鳟生长性状的标记辅助选择提供了科学依据。

SNP marker related to growth traits of Gansu golden trout and its application

【技术实现步骤摘要】
一种与甘肃金鳟生长性状相关的SNP标记及其方法应用
本专利技术属于鱼类分子遗传育种
，具体涉及一种与甘肃金鳟生长性状相关的SNP标记及其方法应用。
技术介绍
Ghrelin是生长激素促分泌受体(GHSR)的内源性配体，可与GHSR结合刺激生长激素的释放。1999年日本科学家小岛首次在小鼠的胃和下丘脑弓状核中发现。近年来，已在鳗鱼、罗非鱼、鲶鱼、大西洋鲑鱼、虹鳟等鱼类中成功克隆出了的Ghrelin基因。根据Ghrelin及其受体在内脏和大脑中的分布，Ghrelin基因可以调节食物摄入和能量平衡，影响激素分泌，协调脊椎动物的GH/IGF-1轴。Shepherd的研究表明，给虹鳟鱼注射小鼠的静脉Ghrelin基因，可在2-5小时内提高其食物摄取量，其原因可能是与虹鳟与小鼠之间的Ghrelin基因序列相似性为39%有关。将含Ghrelin的渗透体的芯片移入罗非鱼体内，结果发现21d后罗非鱼体重较0d明显增加(P<0.05)，可能是由于食物摄入量急剧增加。因此，Ghrelin基因是一种与生长性状相关的潜在候选基因，它能影响饲料的摄入量。通过对本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种与甘肃金鳟生长性状相关的SNP标记，其特征在于具体方法如下：/n（1）样本采集/n采集甘肃金鳟标本的尾鳍组织提取基因组DNA备用；/n（2） PCR扩增/n提取后的DNA进行Ghrelin基因 PCR扩增，扩增上游引物：TGGTTGCTGATAATGTACGCC；扩增下游引物：AGGCAGTGTATCGCTATCCA；/n（3）基因型判定/n通过聚丙烯酰胺凝胶电泳SSCP方法来检测甘肃金鳟的基因型，根据凝胶条带的分布，得到5种类型的Ghrelin基因型，分别为AA型、BB型、AB型、AC型和BC型。/n

【技术特征摘要】
1.一种与甘肃金鳟生长性状相关的SNP标记，其特征在于具体方法如下：
（1）样本采集
采集甘肃金鳟标本的尾鳍组织提取基因组DNA备用；
（2）PCR扩增
提取后的DNA进行Ghrelin基因PCR扩增，扩增上游引物：TGGTTGCTGATAATGTACGCC；扩增下游引物：AGGCAGTGTATCGCTATCCA；
（3）基因型判定
通过聚丙烯酰胺凝胶电泳SSCP方法来检测甘肃金鳟的基因型，根据凝胶条带的分布，得到5种类型的Ghrelin基因型，分别为AA型、BB型、AB型、AC型和BC型。


2.根据权利要求1所述的一种与甘肃金鳟生长性状相关的SNP标记，其特征在于：所述步骤（1）中甘肃金鳟标本尾鳍组织的基因组DNA提取采用天根生化科技(北京)有限公司的血液/细胞/组织基因组DNA提取试剂盒DP304。


3.根据权利要求1或2所述的一种与甘肃金鳟生长性状相关的SNP标记，其特征在于所述步骤（2）中PCR扩增具体如下：
Ghrelin基因的PCR扩增体系为25ul，包括10×PCR缓冲液5.0ul，体积浓度为10mM的引物1.0ul，体积浓度为10mM的dNTPs1.0ul，Taq聚合酶1U，模板DNA3ul；
PCR反应条件为94℃初始变性3min,94℃变性45s,58℃退火45s,72℃延伸45s，共35个循环，最后72℃延伸8min,4℃保存。


4.根据权利要求3所述的一种与甘肃金鳟生长性状相关的SNP标记，其特征在于：所述步骤（1）中甘肃金鳟标本尾鳍组织的基因组DNA提取后在...

【专利技术属性】
技术研发人员：王太，焦文龙，杜岩岩，杨濯羽，卡伟，苏子郡，杨顺文，史小宁，周蓉，李文，
申请(专利权)人：甘肃省水产研究所，
类型：发明
国别省市：甘肃;62