【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于组织样品中生物标志物的计算机-辅助评价的方法、系统和计算机程序专利
本专利技术属于生物技术和生物医学领域。特别地，本专利技术涉及考虑相关组织的灌注状态的用于组织样品中的生物标志物的计算机-辅助评价的方法，以及相应的系统和计算机程序产品。专利技术背景已经发现，在对生物标志物进行有意义的评价中，相应组织的氧合可为至关重要的。例如，在Menegakis等人，ResidualDNAdouble-strandbreaksinperfusedbutnotinunperfusedareasdeterminedifferentradiosensitivityoftumors，RadiotherapyandOncology100(2011)137-144中，显示了尽管生物标志物γH2AX通常可用于检测放射后残余的DNA损害并因此可用于预测放射处理响应，残余γH2AX病灶的剂量-响应高度依赖于灌注良好区域中的肿瘤细胞氧合。显示了，只有在灌注的肿瘤区域进行γH2AX评价才能区分两种不同肿瘤模型的不同放射敏感性。因此，对于这些类型的...
【技术保护点】
1.用于组织样品中的生物标志物的计算机-辅助评价的方法，其包括以下步骤：/n提供表示了所述组织的细胞核以及生物标志物的组织样品图像，/n自动确定所述图像内的多个位置或区域的血管概率，其表示所述图像在相应的位置或区域处表示血管的概率，所述自动确定基于至少两种血管概率指标的组合，/n-其中所述至少两种血管概率指标的至少一种基于与所述图像内的所述位置或区域相关的一个或多个核的至少一种性质的自动评估，所述核性质选自：与如所述图像中表示的相应位置或区域相关的所述一个或多个核的形状、质地、尺寸、强度，和在所述位置或区域处不存在核，和/n-其中所述自动确定基于算法，所述算法基于所述至少两...
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20170920 EP 17192123.2;20180202 EP 18154858.71.用于组织样品中的生物标志物的计算机-辅助评价的方法，其包括以下步骤：
提供表示了所述组织的细胞核以及生物标志物的组织样品图像，
自动确定所述图像内的多个位置或区域的血管概率，其表示所述图像在相应的位置或区域处表示血管的概率，所述自动确定基于至少两种血管概率指标的组合，
-其中所述至少两种血管概率指标的至少一种基于与所述图像内的所述位置或区域相关的一个或多个核的至少一种性质的自动评估，所述核性质选自：与如所述图像中表示的相应位置或区域相关的所述一个或多个核的形状、质地、尺寸、强度，和在所述位置或区域处不存在核，和
-其中所述自动确定基于算法，所述算法基于所述至少两种血管概率指标计算所述血管概率，
基于就所述图像内的所述位置或区域而言的血管概率分布，自动确定所述图像内的假定血管位置，
自动选择所述图像中在所述假定血管位置之外但在距所述假定血管位置的阈值距离之内的位置处表示的生物标志物，和
自动评价选择的生物标志物。
2.如权利要求1所述的方法，其中所述图像包括对应于不同的颜色通道的一组共注册图像。
3.如权利要求1或2所述的方法，其中所述图像由多个图像单元组成，其中所述图像单元的一些或所有对应于所述图像的所述区域，或其中所述图像由多个像素点组成，其中所述像素点的一些或所有对应于所述图像内的所述位置。
4.如前述权利要求中的一项所述的方法，其中在所述图像内的所述假定血管位置的所述自动确定中，具有超过预定阈值的血管概率的位置或区域被指定为所述假定血管位置。
5.如前述权利要求中的一项所述的方法，其中所述核性质是所述核的形状，其中核形状的所述自动评估包括圆形形状的核和长形形状的核之间的区分，和其中所述算法在以这样的方式确定血管概率中，考虑核的圆形或长形形状的存在，使得圆形核形状的存在导致更低的血管概率和长形核形状的存在导致更高的血管概率。
6.如权利要求5所述的方法，其中圆形形状的核和长形形状的核之间的所述区分包括在所述组织样品图像中确定相应核的最大直径和最小直径，或核边界的最大曲率半径和最小曲率半径，并将其进行比较。
7.如前述权利要求中的一项所述的方法，其中所述核性质是在所述区域或位置处不存在核，其中所述算法在以这样的方式确定血管概率中，考虑所述区域或位置处不存在核，使得不存在核导致更高的血管概率。
8.如前述权利要求中的一项所述的方法，其中所述核性质是在所述区域或位置处的所述一个或多个核的尺寸，其中所述算法以这样的方式考虑所述区域或位置处所述一个核/多个核的尺寸，使得位于预定尺寸范围内的所述一个核/多个核的尺寸导致增加的血管概率，而在所述范围之外的尺寸导致减小的血管概率。
9.如前述权利要求中的一项所述的方法，其中所述血管概率指标中的一种基于所述图像中表示的残余血的存在，其中所述算法以这样的方式考虑残余血的存在，使得检测到残余血的存在导致在相应的区域或位置处更高的血管概率。
10.如前述权利要求中的一项所述的方法，其还包括至少就核的表示而言分割所述图像的步骤，使得每个像素点或图像单元与相应的核或背景相关。
11.如权利要求10所述的方法，其中所述分割步骤包括局部自适应阈值化，其中如果像素点或图像单元的强度超过与所述像素点或图像单元相关的局部自适应阈值，则所述像素点或图像单元与核相关，其中基于相应像素点或图像单元的局部近邻中的强度，适配所述局部自适应阈值。
12.如前述权利要求中的一项所述...
【专利技术属性】
技术研发人员：克莱尔·冯诺贝克，里科·希曼，亚历克塞·艾利波特，
申请(专利权)人：德国癌症研究公共权益基金会，科特布斯森夫滕贝格勃兰登堡工业大学，GA通用检测有限责任公司，
类型：发明
国别省市：德国;DE
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