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数字测定制造技术

技术编号:23774423 阅读:51 留言:0更新日期:2020-04-12 03:14
本文提供了一种用于分隔流体样本的方法和装置。该装置包含含有微孔的板。该方法包括当板是开放构造时将样本沉积在一个或两个板上,其中该沉积是样本的单个或多个液滴的形式,其中至少五分之一个所述液滴具有占据两个以上微孔的体积,并且将板闭合至闭合构造以将样本分隔在微孔中。

Digital determination

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】数字测定相关申请案的交叉引用本申请要求于2017年2月9日提交的临时申请序列号62/457,009(ESX-040PRV)、于2017年2月16日提交的临时申请序列号62/460,076(ESX-040PRV2)、于2018年1月24日提交的临时申请序列号62/621,475(ESX-040PRV3)、于2017年2月8日提交的临时申请序列号62/456,603(ESX-033PRV)、于2017年2月15日提交的临时申请序列号62/459,337(ESX-033PRV2)、于2017年2月8日提交的临时申请序列号62/456,504(ESX-045PRV)、于2017年2月16日提交的临时申请序列号62/460,062(ESX-045PRV2)和于2017年2月9日提交的临时申请序列号62/457,133(ESX-046PRV)的权益,所有这些申请的全部内容通过引用并入本文。
其中,本专利技术涉及进行生物和化学分析的装置和方法。
技术介绍
其中,本专利技术提供了允许比某些现有技术更准确、更简单和更快地分析样本中的分析物的装置和方法。在某些实施方案中,本专利技术将样本分隔到具有预定几何形状和体积的分离的或几乎分离的微孔中,和将每个孔中的样本与其相邻孔分离或几乎分离的盖板。本专利技术可用于数字PCR(聚合酶链式反应)。
技术实现思路
提供了一种用于执行数字测定的装置,包含:第一板、第二板和微孔,其中:(a)第一板和第二板可相对于彼此移动成不同的构造,并且在其各自的表面上具有用于接触包含分析物的流体样本的样本接触区域;(b)第二板在样本接触区域中具有多个微孔,其中每个微孔具有(i)预定和已知的几何形状,(ii)200μm或更小的孔深度,和(iii)具有基本上小于流体样本的体积,其中,构造之一是开放构造,其中:第一板的内表面与第二板中的微孔的边缘之间的平均间距大于孔的深度,并且样本沉积在一个或两个板上;以及其中构造中的另一个是闭合构造,该闭合构造是在样本沉积到开放构造之后的构造;在闭合构造中,样本的至少一部分在微孔内,并且第一板的内表面和第二板中微孔的边缘之间的平均间距小于1μm或小于微孔深度的1/10(十分之一)。一种用于分隔流体样本的方法,包含:获得如前述权利要求中任一项所述的装置或设备,当板是开放构造时,将样本沉积在一个或两个板上,其中沉积是样本的单个或多个液滴的形式,其中液滴中的至少一个具有占据两个以上微孔的体积;以及将板闭合至闭合构造以将样本分隔在微孔中。附图说明本领域技术人员将理解,下面描述的附图仅用于说明的目的。附图不旨在以任何方式限制本专利技术的范围。附图不是完全按比例绘制的。在给出实验数据点的图中,连接数据点的线仅用于引导观察数据,而没有其他含义。图1(a)两个板的示意图:板1具有平的内表面,而板2在其样本接触表面上具有孔阵列。(b)将样本液体沉积在孔阵列板(板2)的中心,用平板(板1)覆盖并将两个板压在一起。(c)加压后将液体分离进入孔阵列。图2(a)在175μm厚的PMMA基板上制造的微孔板的照片;(b)孔直径为30μm,孔深度为8μm和孔中心到中心距为34μm的六方晶格微孔阵列的显微镜照片;(c)孔直径为20μm,孔深度为8μm和孔中心到中心距为24μm的六方晶格微孔阵列的显微镜照片。图3.将两个板(微孔板和如图1所述的平板)压在一起(用人的手指)之后分离进入孔阵列的液体的(a)放大10倍和(b)放大20倍的显微镜照片。在该装置中,板1(平板)是厚度为50μm的平坦PET膜,而板2(微孔板)是厚度为175μm的PMMA板,并且表面上的微阵列具有30μm的孔直径,8μm的孔深度和34μm的孔中心到中心距。液体是2μL体积的磷酸盐缓冲盐水(PBS)。注意,在沉积液体样本并使板处于闭合构造之后,一些微孔被填充而一些微孔是空的。我们的测量显示,在板的闭合构造中,在板1的内表面和所述板的所述孔边缘之间存在薄的液体残余层(-0.5μm厚或更薄)。图4是像素化测定QMAX装置(Q:量化;M:扩增;A:加入试剂;X:加速;也称为可用于像素化测定的压缩调节开放流(CROF)装置。在图4中,所述QMAX装置是开放构造。(a)一种装置,其包含第一板、第二板和第二板上的微孔。(b)第二板上微孔的顶视图,具有(i)正方形点阵圆形,(ii)具有正方形点阵的矩形,(iii)具有六边形点阵的三角形,(iv)非周期性圆形。图5是示出使用QMAX装置进行像素化测定的示例性过程中的基本步骤的示例性流程图。图6示出了在0.25mm厚的丙烯酸基板上制造的QMAX第一板上的隔离孔阵列的显微示例,具有(a)20μm×20μm的正方形孔,100μm的间隔,30μm的深度;(b)20μm×20μm的正方形孔,200μm的间隔,30μm的深度;(c)10μm直径的圆孔,200μm的间隔,20μm的深度。图7示出了用于执行像素化测定QMAX的示例性实施方案的结合位点板(第一板)和存储板(第二板)的制备的示意图。图8示出了用于孵育过程的闭合构造中的像素化测定QMAX装置的示例性实施方案的示意图。图9示出了用于扩增过程的闭合构造中的像素化测定QMAX装置的示例性实施方案的示意图。图10示出了具有分离孔的像素化测定的代表性测量图。(a)通过在捕获步骤中计数加样的孔来估计样本体积。(b)通过在扩增步骤之后用信号计数孔数目来估计样本中的分子数目。通过将分子数除以样本体积反算样本中分析物的最终浓度。图11示出了用于像素化测定QMAX的示例性实施方案的结合位点板(第一板)和储存板(第二板)的制备示意图。实验过程遵循图5的流程图。图12示出了用于捕获过程的闭合构造中的像素化测定QMAX装置的示例性实施方案的示意图图13示出了用于扩增过程的闭合构造中的像素化测定QMAX装置的示例性实施方案的示意图。图14示出了用于数字核酸扩增测定的开放构造的像素化测定QMAX装置的示例性实施方案的示意图。图15示出了在用于数字核酸扩增测定的样本引入之后处于闭合构造的像素化测定QMAX装置的示例性实施方案的示意图图16示出了在数字核酸扩增过程中处于闭合构造的像素化测定QMAX装置的示例性实施方案的示意图。具体实施方式以下详细描述通过示例而非限制的方式示出了本专利技术的一些实施例。本文使用的章节标题和任何副标题仅用于组织目的,而不应被解释为以任何方式限制所描述的主题。章节标题和/或副标题下的目录不限于章节标题和/或副标题,而是适用于本专利技术的整个描述。任何出版物的引用是针对其在申请日之前的公开,并且不应当被解释为承认本权利要求由于在先专利技术而不能先于这种出版物。此外,所提供的公开日期可以不同于可能需要被独立地确认的实际的公开日期。A.微孔阵列像素化测定(MAPA)原理。GD1如图4所示,称为MAPA或“微孔阵列像素化测定”的使用微孔阵列的像素化测本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于执行数字测定的装置,包含:/n第一板、第二板和微孔,其中:/n(g)所述第一板和所述第二板可相对于彼此移动成不同的构造,并且在其各自的表面上具有用于接触包含分析物的流体样本的样本接触区域;/n(h)所述第二板在所述样本接触区域中具有多个微孔,其中每个微孔具有(i)预定和已知的几何形状,(ii)200μm或更小的孔深度,和(iii)具有基本上小于所述流体样本的体积,/n其中所述构造之一是开放构造,其中:所述第一板的内表面与所述第二板中的所述微孔的边缘之间的平均间距大于所述孔的深度,并且所述样本沉积在所述一个或两个板上;以及/n其中所述构造中的另一个是闭合构造,所述闭合构造是在所述样本沉积在所述开放构造中之后的构造;在所述闭合构造中,所述样本的至少一部分在所述微孔内,并且所述第一板的内表面和所述第二板中微孔的边缘之间的平均间距小于1μm或小于所述微孔深度的1/10(十分之一)。/n

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】20170208 US 62/456,504;20170208 US 62/456,603;20171.一种用于执行数字测定的装置,包含:
第一板、第二板和微孔,其中:
(g)所述第一板和所述第二板可相对于彼此移动成不同的构造,并且在其各自的表面上具有用于接触包含分析物的流体样本的样本接触区域;
(h)所述第二板在所述样本接触区域中具有多个微孔,其中每个微孔具有(i)预定和已知的几何形状,(ii)200μm或更小的孔深度,和(iii)具有基本上小于所述流体样本的体积,
其中所述构造之一是开放构造,其中:所述第一板的内表面与所述第二板中的所述微孔的边缘之间的平均间距大于所述孔的深度,并且所述样本沉积在所述一个或两个板上;以及
其中所述构造中的另一个是闭合构造,所述闭合构造是在所述样本沉积在所述开放构造中之后的构造;在所述闭合构造中,所述样本的至少一部分在所述微孔内,并且所述第一板的内表面和所述第二板中微孔的边缘之间的平均间距小于1μm或小于所述微孔深度的1/10(十分之一)。


2.一种设备,包含热循环仪和如权利要求1所述的装置。


3.一种设备,包含热循环仪、如权利要求1所述的装置和用于实时PCR的读取器。


4.一种用于分隔流体样本的方法,包含:
获得如前述任一权利要求所述的装置或设备,
当所述板是开放构造时,将所述样本沉积在所述一个或两个板上,其中所述沉积是所述样本的单个或多个液滴的形式,其中所述液滴中的至少一个具有占据两个以上微孔的体积;以及
将所述板闭合至所述闭合构造以将所述样本分隔在所述微孔中。


5.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,其中所述分析物是蛋白质、肽、核酸、病毒、细菌、细胞、纳米颗粒、分子、合成化合物或无机化合物。


6.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,进一步包含间隔件,所述间隔件经构造以调节所述第一板和所述第二板之间的间隔。


7.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,进一步包含位于所述一个或两个板的内表面上的结合位点,其中所述结合位点包含固定在所述位点处的捕获剂,且所述捕获剂经构造以特异性捕获所述样本中的分析物。


8.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,进一步包含表面扩增层,所述表面扩增层位于所述一个或两个板的所述内表面上,其中所述表面扩增层包含固定在所述位点处的捕获剂,且所述捕获剂被构造成特异性地捕获所述样本中的分析物,其中所述表面扩增层扩增来自所述分析物或附着于所述分析物的标记的光信号,当它们在所述表面扩增层附近时比在微米或更远外时扩增得更强。


9.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,其中调整所述表面扩增层的所述扩增因子以使得来自直接或间接结合到所述捕获剂的单个标记的所述光学信号可见。


10.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,其中调整所述表面扩增层的所述扩增因子以使得来自直接或间接结合到所述捕获剂的单个标记的所述光学信号可见。


11.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,其中所述装置进一步包含处于所述板的闭合构造中的所述微孔中的试剂,其中当所述分析物与检测剂之间存在结合时,所述试剂将在所述孔中产生多个发光组分,而所述检测剂特异性地结合到所述分析物。


12.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,其中在所述闭合构造中所述第一板与所述第二板之间的所述间隔经构造以使得所述目标分析物与所述捕获剂的饱和结合时间为300秒或更短。


13.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,其中在所述闭合构造中所述第一板与所述第二板之间的所述间隔经构造以使得所述目标分析物与所述捕获剂的饱和结合时间为60秒或更短。


14.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,其中调整所述表面扩增层的所述扩增因子以使来自单个标记的所述光信号可见。


15.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,其中所述捕获剂是核酸。


16.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,其中所述捕获剂是蛋白质。


17.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,其中所述捕获剂是抗体。


18.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,其中所述捕获剂是适体。


19.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,其中所述捕获剂是适体。


20.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,进一步包含存储位置,所述存储位置位于所述一个或两个板的所述内表面上,其中所述存储位置包含可溶于液体中的试剂。


21.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,其中所述试剂用于扩增所述样本中的分析物。


22.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,其中所述试剂通过聚合酶链式反应(PCR)扩增所述分析物。


23.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,其中所述试剂是检测剂。


24.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,其中针对预期目标分析物浓度构造每一孔的体积,使得在填充有所述样本的每一孔中的目标分析物的分布遵循泊松分布。


25.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,其中针对预期目标分析物浓度构造每一孔的体积,使得在填充有所述样本的每一孔中的目标分析物的分布平均为每2个孔、3个孔、5个孔、10个孔、20个孔、0个孔、50个孔、75个孔、100个孔、150个孔、200个孔、300个孔、500个孔、1000个孔、2000个孔、10000个孔、100,000个孔,或在任何两个值的范围内一个目标分析物。


26.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,其中优选针对预期目标分析物浓度来构造每一孔的体积,使得填充有所述样本的每一孔中的目标分析物的分布平均为每10个孔、20个孔、0个孔、50个孔、75个孔、100个孔,或在任何两个值的范围内一个目标分析物。


27.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,其中在所述闭合构造中,所述第一板的内表面与所述第二板中的微孔的边缘之间的平均间距小于微孔深度的1/11(十一分之一)、1/20、1/30、1/40、1/50、1/100、1/300、1/500,或在任何两个值的范围内。


28.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,其中在所述闭合构造中,所述第一板的内表面与所述第二板中的微孔的边缘显著接触。


29.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,其中在所述闭合构造中,两个相邻孔之间的平均间隔小于5nm、10nm、30nm、50nm、100nm、200nm、500nm、1μm、2μm、5μm、10μm、20μm、50μm、100μm,或在任何两个值的范围内。


30.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,其中所述微孔具有选自圆形、矩形、六边形和/或具有正方形、六边形和/或任何其他网格的任何其他多面体的形状。


31.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,其中所述第一板上的所述孔具有至少1nm、10nm、100nm、500nm、1μm、5μm、50μm、500μm、1mm或所述值中的任两者之间的范围;以及10nm至100nm、100nm至500nm、500nm至1μm、1μm至10μm或10μm至50μm的优选范围的间隔(平均孔到孔中心距离)。


32.如前述任一权利要求所述的装置、设备或方法,其中所述第一板上的孔具有1nm、10nm、100nm、500nm、1μm、5μm、50μm、500μm、1mm,或所述值中的任两者之间的范围;以及10nm至100nm、100nm至500nm、500nm至1μm、1μm至10μm或10μm至50μm的优选范围的孔尺寸(平均长度或直径)。


33.如前述任一权利要求...

【专利技术属性】
技术研发人员:斯蒂芬·Y·周丁惟张玙璠
申请(专利权)人:ESSENLIX公司
类型:发明
国别省市:美国;US

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