动态测定选择和样本制备装置和方法及其机器可读介质制造方法及图纸

技术编号:23147575 阅读:55 留言:0更新日期:2020-01-18 12:54
公开了用于测定的制备患者样本的自动化的方法。该方法包括:在提取板的多个提取板井中执行多个患者样本的样本处理,以在多个提取板井的至少一些中制备多个洗脱的样本,并且基于包括多个测定区域的电子板图,将多个洗脱的样本之一从多个提取井中的单个提取井转移到测试板的多个测试井中,其中测试板的多个测试井中的每一个被配置成执行不同的测定,并且为不同的测定类型接收不同的主混合。描述被配置成执行该方法的样本制备装置,这是其它方面。

Device and method for dynamic determination selection and sample preparation and its machine readable medium

【技术实现步骤摘要】
动态测定选择和样本制备装置和方法及其机器可读介质本申请是申请日为2014年9月12日,申请号为201480050134.2并且专利技术名称为“动态测定选择和样本制备装置和方法及其机器可读介质”申请的分案申请。相关申请本申请要求2013年9月12日提交的序列号61/876798、题为“开放动态测定选择和样本制备”的美国临时申请的优先权,由此通过引用将该美国临时申请的公开整体并入本文。
本专利技术一般涉及用于制备测试板以用于执行测定(诸如通过使用聚合酶链式反应(PCR)测试)的方法和装置。
技术介绍
各种各样的诊断仪器(例如临床分析仪或免疫测定仪器)用于分析患者标本(生物样本)。这些诊断仪器可使用磁性颗粒、一个或多个试剂、缓冲液、对照(control)或其它添加剂来进行测定(例如免疫测定),以识别患者样本中的一个或多个组分(例如核酸)或患者样本的特征。一些免疫测定系统可使用聚合酶链式反应(PCR),其中使用提供自动化的样本制备和提取技术的样本制备装置。一旦样本由自动化的样本制备系统制备,扩增和检测(AD)设备可用于从生物样本分离和纯化来自处理的洗脱液的DNA和/或RNA。如图1A中所示,在PCR测试中使用的典型的聚合酶链式反应(PCR)微井板100包括提供测试位置(例如8×12=96个潜在测试位置)的多个微井102。在深井提取板上样本制备之后,PCR微井板100从提取板以及主混合(mastermix)和正在进行的测定专用的可能的其它组分接收洗脱的样本,并且在AD设备中经历处理以复制和量化感兴趣的组分(例如核酸)。在这样的PCR测试中,当运行测定时、在PCR板中的任何潜在的测试位置(例如测试井)是未使用时,增加PCR测定材料每次测试、每名患者的成本。另外,当由于高劳动成本组成而使用手动制备代替自动化的制备时,每次测试、每名患者的成本可能增加。如图1B中所示,已经历史性地或者手动制备或者通过在PCR微井板100上使用固定测定选择和固定板布局自动制备在PCR测试板100上的kPCR样本制备(“SP”)。来自多个样本容器(例如101A-101D)的患者样本被转移到提取板103的深井。然后经由顺序添加试剂、磁性颗粒、洗涤缓冲液、洗脱缓冲液和产生患者样本洗脱(纯化的样本)的可能的其它组分而被处理。这些患者样本洗脱液然后被转移到PCR微井板100,并且各自在PCR微井板100上经历相同的测定。手动样本制备对于制备者是非常繁琐的,并且由于实现完整的样本制备所需的非常大量的手动步骤,同时协调添加患者样本、试剂、磁性颗粒、洗涤缓冲液、洗脱缓冲液和测定主混合可能受到高发生的人为制备错误。虽然它可减少人为制备错误,但自动化的样本制备在历史上由于固定的测定选择和固定的板布局而已经不灵活。在如由图1B中所示的一个现有技术系统中,只在PCR微井板100上进行一个测定,因此仅仅为单个测定提供每个患者单个结果。为了提供进一步的灵活性,已经使用分割板测定,其中患者样本被转移到提取板103的多个提取板井,并且然后来自那些多个患者样本的处理的洗脱液被转移到第一和第二测试板104、105,其中在第一测试板104上进行第一测定并且在第二测试板105上进行第二测定。因此,为来自第一测试板104的患者样本产生第一测定结果,并且为来自第二测试板105的患者样本产生第二测定结果。虽然这些现有技术方法如期望地操作,它们往往易于出错(手动)或通常是不灵活的,即每个测试板一个测定。所以,期望改进自动化样本处理(例如PCR处理)的效率和成本效能的方法和装置。
技术实现思路
根据第一方面,提供一种制备样本的方法,用于在具有多个井的测试板上测定。该方法包括:经由用户接口接收指令以运行第一测定类型和第二测定类型,为待测定的多个样本确定样本标识,接收对应于样本标识的测定订单,基于测定订单和样本标识,定义多个井的第一和第二测定区域,其中每个定义的测定区域包括多个井中的至少一个,并创建包括指令的电子板图,以在第一测定区域内包含的样本上运行第一测定类型,并且在第二测定区域内包含的样本上运行第二测定类型。在另一个方面,提供了一种填充具有多个测试板井的测试板的方法。该方法包括:在提取板的多个提取板井中执行多个患者样本的样本处理,以在多个提取板井的至少一些中制备多个洗脱的样本,并且基于包括多个测定区域的电子板图,将多个洗脱的样本之一从多个提取板井中的单个提取板井转移到测试板的多个测试井中,其中测试板的多个测试井中的每一个在多个测定区域的不同的一个中,并且每一个被配置成执行不同的测定类型。根据另一个方面,提供一种制备样本的方法,用于在具有多个PCR板井的PCR板上测定。该方法包括:提供待测定的多个患者样本,患者样本包括样本标识,从LIS系统接收对应于多个患者样本的测定订单,基于测定订单和样本标识,选择测定的数量和类型以在PCR板上执行,为包括处理前的对照和处理后的对照的类型和数量的测定的类型中的每一个动态定义测定数据集,制备多个患者样本和处理前的对照,直到在提取板的提取板井上的患者样本洗脱液和对照样本洗脱液,基于测定的类型,定义将执行的测定的数量和对照的数量、包括含多个PCR板井的多个测定区域的电子板图,其中多个测定区域中的每一个包括多个PCR板井中的至少一个,并将患者样本洗脱液从提取板井分配到多个测定区域中,其中PCR板上的多个测定区域的数量为2个或更多;并且将在多个测定区域的每一个中执行不同的测定。根据另一个方面,提供一种样本制备装置。该样本调制装置包括:提取板;测试板;存储器,其可操作以至少存储患者样本标识;用于每个患者样本的测定订单;以及测定的数量和类型;处理器,其耦合到存储器并且可操作以至少基于患者样本的数量、用于患者样本中每一个的测定订单的数量和类型以及对照的数量来生成包括多个测定区域的电子板图;以及一个或多个机器人,每一个包括被配置成从提取板的提取板井和主混合到多个测定区域的患者样本洗脱液的一个或多个耦合的移液管。根据另一个方面,提供一种具有在其上存储的非瞬时指令的机器可读介质。该机器可读介质包括:动态运行设置模块,其被配置成至少部分地基于将运行的测定的数量和类型以及对照的数量和类型而定义具有期望的运行配置的多个测定数据集;以及工作列表和板图显示模块,其被配置成生成包括空间信息的电子板图,该空间信息关联患者样本洗脱液和对照洗脱液的测试板的多个测定区域以及任选地一个或多个处理后的对照内的位置。通过图示许多示例性实施例和实现方式(包括预期用于实现本专利技术的最佳模式),本专利技术的其它方面、特征和优点可从下面的详细描述中显而易见。本专利技术还可能能够是其它和不同的实施例,并且可在各种方面修改其若干细节,所有都不脱离本专利技术的范围。相应地,附图和描述在本质上将被视为是说明性的,而不是限制性的。附图不一定按比例绘制。本专利技术将涵盖落入专利技术范围内的所有修改、等价物和替代方案。附图说明以下描述的附图仅用于说明的目的,而不一定按比例绘制。附图并不旨在以任何方式限制本公开的范围。图1A图示根据实施例的PCR测试板本文档来自技高网
...

【技术保护点】
1.一种用于在具有多个井的测试板上测定的制备样本的方法,包括:/n经由用户接口接收指令以运行第一测定类型和第二测定类型;/n为待测定的多个样本确定样本标识;/n接收对应于样本标识的测定订单;/n基于测定订单和样本标识,定义多个井的第一和第二测定区域,其中每个定义的测定区域包括多个井中的至少一个并且是多边形形状;以及/n创建包括指令的电子板图,以在第一测定区域内包含的样本上运行第一测定类型,并且在第二测定区域内包含的样本上运行第二测定类型;/n其中所述方法还包括:为正在特定批量中运行的第一测定类型和第二测定类型中的每一个定义测定数据集,并且其中定义的测定数据集包括从在显示器上显示的动态测定运行设置屏幕上的可选择的选项定义的各种组合;所述测定数据集被选择并且从可能的测定运行配置的单独列表填充,并且至少包括测定名称、以及存在处理前的对照、存在处理后的对照。/n

【技术特征摘要】
20130912 US 61/8767981.一种用于在具有多个井的测试板上测定的制备样本的方法,包括:
经由用户接口接收指令以运行第一测定类型和第二测定类型;
为待测定的多个样本确定样本标识;
接收对应于样本标识的测定订单;
基于测定订单和样本标识,定义多个井的第一和第二测定区域,其中每个定义的测定区域包括多个井中的至少一个并且是多边形形状;以及
创建包括指令的电子板图,以在第一测定区域内包含的样本上运行第一测定类型,并且在第二测定区域内包含的样本上运行第二测定类型;
其中所述方法还包括:为正在特定批量中运行的第一测定类型和第二测定类型中的每一个定义测定数据集,并且其中定义的测定数据集包括从在显示器上显示的动态测定运行设置屏幕上的可选择的选项定义的各种组合;所述测定数据集被选择并且从可能的测定运行配置的单独列表填充,并且至少包括测定名称、以及存在处理前的对照、存在处理后的对照。


2.根据权利要求1所述的方法,包括:显示指示第一测定区域和第二测定区域的测试板的图形表示。


3.根据权利要求1所述的方法,包括三个或更多个测定区域,并且其中在三个或更多个测定区域的每一个中制备不同的测定类型。


4.根据权利要求3所述的方法,包括:显示指示三个或更多个测定区域的测试板的图形表示。


5.根据权利要求1所述的方法,其中所述方法允许使用一个或多个处理前的对照样本洗脱液以及一个或多个处理后的对照样本洗脱液二者。


6.根据权利要求1所述的方法,包括:显示至少一些库存需求的图形表示,至少一些库存需求用于制备将在包括第一测定区域和第二测定区域的测试板上运行的测定。


7.根据权利要求1所述的方法,包括:基于测定订单、样本标识和对照定义第一和第二测定区域。


8.根据权利要求1所述的方法,包括:在测试板上同时包括一个或多个处理前的对照样本和一个或多个处理后的对照样本。


9.根据权利要求1所述的方法,包括:提供用于处理第一和第二测定以及样本的至少一些库存需求的列表。


10.根据权利要求1所述的方法,包括:基于电子板图,生成库存图像文件。


11.根据权利要求1所述的方法,进一步包括:将电子板图转移到扩增和检测设备。


12.根据权利要求11所述的方法,其中电子板图包括指令,以在第一测定区域内包含的洗脱的患者样本和第一主混合上运行第一测定类型,并且在第二测定区域内包含的洗脱的患者样本和第二主混合上运行第二测定类型。


13.一种填充具有多个测试板井的测试板的方法,包括:
在提取板的多个提取板井中执行多个患者样本的样本处理,以在多个提取板井的至少一些中制备多个洗脱的样本;以及
基于包括多个测定区域的电子板图,将多个洗脱的样本之一从多个提取板井中的单个提取板井转移到测试板的多个测试井中,其中每个测定区域包括多个井中的至少一个并且是多边形形状,其中测试板的多个测试井中的每一个在多个测定区域的不同的一个中,并且每一个被配置成执行不同的测定类型;
其中所述电子板图被用于在多个测定区域的第一测定区域内包含的样本上运行第一测定类型,并且在多个测定区域的第二测定区域内包含的样本上运行第二测定类型;
其中所述方法还包括:为正在特定批量中运行的第一测定类型和第二测定类型中的每一个定义测定数据集,并且其中定义的测定数据集包括从在显示器上显示的动态测定运行设置屏幕上的可选择的选项定义的各种组合;所述测定数据集被选择并且从可能的测定运行配置的单独列表填充,并且至少包括测定名称、以及存在处理前的对照、存在处理后的对照。


14.根据权利要求13所述的方法,其中来自多个井的单个提取井的多个洗脱的样本之一被转移到测试板的多个测试井的三个或更多个,其中多个测试井的三个或更多个中的每一个在不同的板区域中。


15.根据权利要求13所述的方法,其中多个洗...

【专利技术属性】
技术研发人员:A纳塔勒I菲格罗亚
申请(专利权)人:西门子医疗保健诊断公司
类型:发明
国别省市:美国;US

网友询问留言 已有0条评论
  • 还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。

1