LINC02159在肺腺癌诊疗中的应用制造技术

本发明专利技术公开了LINC02159在肺腺癌诊疗中的应用。本发明专利技术通过高通量测序以及生物信息学分析，首次发现了LINC02159在肺腺癌患者中表达上调，并通过QPCR进行大样本验证了LINC02159作为分子标志物应用于肺腺癌诊断的可行性，为肺腺癌的精准化诊断和个性化治疗提供了新的手段。

Application of LINC02159 in diagnosis and treatment of lung adenocarcinoma

【技术实现步骤摘要】
LINC02159在肺腺癌诊疗中的应用
本专利技术属于生物医药领域，涉及LINC02159在肺腺癌诊疗中的应用。
技术介绍
肺癌是世界性的健康问题，在中国，肺癌的发病率和死亡率长年都居于第一，对中国人群的健康和生命造成了巨大的威胁，造成了巨大的社会经济负担。非小细胞肺癌约占肺癌总数的85％左右，在非小细胞肺癌个性化治疗方面，目前对于非小细胞肺癌的研究已深入到基因水平，相关的分子标志物比如表皮生长因子受体、肿瘤蛋白p53等的表达水平可能直接影响临床医生对于治疗方案的选择，随着非小细胞肺癌治疗方案的细化以及分子靶向治疗的不断开展，非小细胞肺癌诊断和预后相关的新型肿瘤分子标志物仍需不断更新，以满足临床评估非小细胞肺癌的诊断和预后的需要。长链非编码RNA(longnon-codingRNA，lncRNA)大小超过200nt，缺乏蛋白质编码能力。目前已经确定了14,880个人类lncRNAs，LncRNAs是聚合物II(polII)的产物，绝大多数均被封闭，聚腺苷酸化和频繁剪接。转录谱分析研究逐渐揭示了lncRNAs在人类的各类疾病中的作用。在癌症领域，与相应的正常组织相比，lncRNA表达在肿瘤细胞和组织中出现了显著的失调，并广泛参与了肿瘤细胞的恶性转化、谱系特异性改变、基因拷贝数变化和表观遗传修饰等生物学过程。研究发现其对肿瘤细胞株的增殖和凋亡，以及细胞周期和细胞代谢，细胞侵袭转移等一系列行为产生调控。随着癌症中某些长链非编码RNA的异常表达的发现，研究者们对其在癌症发生发展中作用的愈发关注，而目前对于肿瘤新型分子标志物的发现和探索又十分迫切，使得1ncRNA在肿瘤领域的作用一跃成为研究热点。目前，lncRNA在肺腺癌早期诊断及预后预测中的应用研究还比较少。虽然lncRNA在肺腺癌发生发展过程中具有重要作用，并且部分lncRNA可以作为肺腺癌诊断及预后预测指标，但是仍然有大量lncRNA未被发现，仍然需要进一步研究lncRNA在肺腺癌表达及其调控肿瘤发生发展中的机制。
技术实现思路
为了弥补现有技术的不足，本专利技术的目的在于提供一种与肺腺癌相关的lncRNA生物标志物，通过检测该生物标志物的水平可以判断受试者是否患有肺腺癌，从而为肺腺癌的早期诊断和治疗提供一种新手段。为了实现上述目的，本专利技术采用如下技术方案：本专利技术的第一方面提供了一种检测试剂，所述试剂为检测LINC02159水平的试剂。进一步，所述试剂选自：特异性识别LINC02159的探针；或特异性扩增LINC02159的引物。进一步，所述特异性扩增LINC02159的引物序列如SEQIDNO.1～2所示。本专利技术的第二方面提供了一种产品，所述产品检测LINC02159水平的试剂。进一步，所述试剂选自：特异性识别LINC02159的探针；或特异性扩增LINC02159的引物。进一步，所述特异性扩增LINC02159的引物序列如SEQIDNO.1～2所示。进一步，本专利技术第二方面所述的产品包括试剂盒、芯片、核酸膜条。本专利技术的第三方面提供了一种组合物，所述组合物包括有效量的LINC02159的抑制剂。所述抑制剂选自：以LINC02159或其转录本为靶序列、且能够抑制LINC02159基因表达或基因转录的干扰分子，包括：shRNA(小发夹RNA)、小干扰RNA(siRNA)、dsRNA、微小RNA、反义核酸，或能表达或形成所述shRNA、小干扰RNA、dsRNA、微小RNA、反义核酸的构建物。进一步，所述抑制剂为siRNA。本专利技术的第四方面提供了一种预测肺腺癌的计算模型，所述计算模型包括LINC02159的计算分析模块。本专利技术的第五方面提供了一种筛选治疗肺腺癌的候选药物的方法，所述方法包括：用待筛选物质处理表达或含有LINC02159基因的体系；和检测所述体系中LINC02159基因的表达；其中，若所述待筛选的物质可以抑制LINC02159基因的水平，则表明该待筛选物质是治疗肺腺癌的候选药物。所述体系选自：细胞体系、亚细胞体系、溶液体系、组织体系、器官体系或动物体系。所述候选物质包括(但不限于)：针对LINC02159基因或其上游或下游基因设计的干扰分子、核酸抑制物、小分子化合物等。本专利技术的第六方面提供了如下任一项应用：a.本专利技术第一方面所述的试剂在制备诊断肺腺癌的工具中的应用；b.本专利技术第二方面所述的产品在制备诊断肺腺癌的工具中的应用；c.LINC02159在构建诊断肺腺癌的计算模型中的应用；d.LINC02159在制备治疗肺腺癌的药物中的应用；e.LINC02159在筛选治疗肺腺癌的候选药物中的应用；f.本专利技术第三方面所述的组合物在制备治疗肺腺癌的药物中的应用。附图说明图1是利用QPCR检测LINC02159基因在肺腺癌组织中的表达情况图。具体的实施方式本专利技术通过高通量测序以及生物信息学分析方法，检测肺腺癌样本中lncRNA在肿瘤组织和癌旁组织中的表达，发现其中具有明显表达差异的lncRNA，探讨其与肺腺癌的发生发展之间的关系，从而为肺腺癌的诊断及靶向治疗寻找更好的途径和方法。通过筛选，本专利技术首次发现了肺腺癌中LINC02159显著性上调，并通过实验证明了LINC02159与肺腺癌的发生发展相关，为肺腺癌的早期诊断及治疗提供了新的肿瘤标志物和治疗靶点。LINC02159转录LINC02159的基因是位于人5号染长臂3区4带上，本专利技术中的LINC02159包括野生型、突变型或其片段。本领域技术人员知道，在进行测序分析时，会将原始测序结果比对到人的参考基因组上，因此筛选结果中的LINC02159可能会包含不同的转录本，只要可以比对到参考基因组上的LINC02159(基因ID：285629)即可。在genebank中，目前LINC02159存在两个转录本，序列分别如NR_027111.1、NR_151858.1所示。本专利技术技术人员应当理解，可以利用本领域内已知的任何方法来测定基因的表达水平，包括但不限于核酸测序技术、核酸杂交技术、核酸扩增技术，测定基因表达的手段不是本专利技术的重要方面。试剂盒、芯片、核酸膜条本专利技术提供了一种试剂盒，所述试剂盒包括检测LINC02159的试剂，选自下组的一种或多种物质：容器、使用说明书、阳性对照物、阴性对照物、缓冲剂、助剂或溶剂。本专利技术的试剂盒中还可附有试剂盒的使用说明书，其中记载了如何采用试剂盒进行检测，和如何利用检测结果对肿瘤发展进行判断、对治疗方案进行选择。本专利技术中的芯片包括：固相载体；以及有序固定在所述固相载体上的寡核苷酸探针，所述的寡核苷酸探针特异性地对应于LINC02159所示的部分或全部序列。本专利技术中所述固相载体可采用基因芯片领域的各种常用材料，例如包括但不限于尼龙膜，经活性基团(如醛基、氨基等)修饰的玻片或硅片、未修饰的玻片、塑料片等。所述的LINC02159芯片的制备可采用本领域已知的生物芯片的常规制造方法。例如，如果固相载体采用的是修饰玻片或硅片，探针的5’端含有氨基修饰的聚dT串，可将寡核苷酸探针配制成溶液，然后采用点样仪将其点在修饰玻片或硅片上，排列成预定的序列或阵列，然后通过放置过夜来固定，就可得到本专利技术的lncRNA芯片。在本专利技术中，核酸膜条包括基底和固定于所述基底上的特异性识别LINC02159寡核苷酸探本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种检测试剂，其特征在于，所述试剂为检测LINC02159水平的试剂。

【技术特征摘要】
1.一种检测试剂，其特征在于，所述试剂为检测LINC02159水平的试剂。2.根据权利要求1所述的试剂，其特征在于，所述试剂选自：特异性识别LINC02159的探针；或特异性扩增LINC02159的引物。3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述特异性扩增LINC02159的引物序列如SEQIDNO.1～2所示。4.一种产品，其特征在于，所述产品包括权利要求1-3任一项所述的试剂。5.根据权利要求4所述的产品，其特征在于，所述产品包括试剂盒、芯片、核酸膜条。6.一种组合物，其特征在于，所述组合物包括有效量的LINC02159的抑制剂。7.根据权利要求6所述的组合物，其特征在于，所述抑制剂为siRNA。8.一种预测肺腺癌的计算模型，其特征在于，所述计算模型包括LINC...

【专利技术属性】
技术研发人员：徐红玉，张涛，李华，李东，高辉，苏晓妹，程朋，张伶，
申请(专利权)人：中国人民解放军西部战区总医院，
类型：发明
国别省市：四川,51