肺癌诊疗用lncRNA标志物制造技术

本发明专利技术公开了诊疗用lncRNA标志物，所述lncRNA标志物为RP11‑284F21.10。本发明专利技术首次发现了RP11‑284F21.10在肺腺癌中表达显著上调，并通过大样本QPCR实验进一步证明了可将RP11‑284F21.10作为潜在的分子靶标应用于肺腺癌的临床诊断。本发明专利技术同时通过CCK8实验证明了RP11‑284F21.10影响肺腺癌细胞的增殖。

LncRNA markers for diagnosis and treatment of lung cancer

【技术实现步骤摘要】
肺癌诊疗用lncRNA标志物
本专利技术属于生物医药领域，涉及肺癌诊疗用lncRNA标志物，具体的标志物为RP11-284F21.10。
技术介绍
肺癌是世界上发病率和致死率最高的癌症(FERLAYJ,SOERJOMATARAMI,DIKSHITR,etal.Cancerincidenceandmortalityworldwide:sources,methodsandmajorpatternsinGLOBOCAN2012[J].IntJCancer.2015,136(5):E359-386.)。肺癌包含了四种主要亚型，以及多种次要或者极为稀少的亚型(BRAMBILLAE,TRAVISWD,COLBYTV,etal.ThenewWorldHealthOrganizationclassificationoflungtumours[J].EurRespirJ.2001,18(6):1059-1068.)，每一种亚型具备特定的生物学和临床上的特征。通过临床病理学特征它们可被分为小细胞癌(Smallcelllungcancer,SCLC)和非小细胞癌(Non-smallcelllungcancer,NSCLC)(SUNS,SCHILLERJH,GAZDARAF.Lungcancerinneversmokers--adifferentdisease[J].NatRevCancer.2007,7(10):778-790.)。其中，非小细胞癌是肺癌中最常见的一种类型，占据肺癌的80％以上。在非小细胞癌中，可被分为三种亚型，肺腺癌、肺鳞癌和大细胞癌。而肺腺癌和肺鳞癌又是非小细胞癌中最常见的类型(YILDIZO,BUYUKTASD,EKIZE,etal.FacialNervePalsy:AnUnusualPresentingFeatureofSmallCellLungCancer[J].CaseReportsinOncology.2011,4(1):35-38.)，它们具有不同的发病机理和诊断方式。两者相比之下，肺腺癌更易发生在肺的外周且在从不抽烟的人中更常见，而肺鳞癌则更易发生在肺的中心且与病人的吸烟史高度相关。肺癌曾经被认为是独属于吸烟者的疾病。然而，对全球的统计分析发现，男性中15％的肺癌患者以及女性中53％的肺癌患者与烟草无关(PARKINDM,BRAYF,FERLAYJ,etal.Globalcancerstatistics,2002[J].CACancerJClin.2005,55(2):74-108.)。有研究发现，在非吸烟人群中，肺癌是第七大常见癌症，排在子宫癌，胰腺癌以及前列腺癌之前。目前的肺癌患者中，只有少于16％的患者在肺癌的最初阶段就被诊断出来，极大的提高了治疗的难度和成本。因此，寻找在肺癌早期就能被识别和诊断的生物标志物十分必要。这可以大大提高治疗的效率，降低治疗的社会成本。长链非编码RNA(longnon-codingRNAs,1ncRNAs)随着cDNA芯片技术的发展被发现，它们的保守性差，表达量低，因此曾经被认为是转录噪音，基因组的漏洞转录(LIUJ.ControlofproteinsynthesisandmRNAdegradationbymicroRNAs[J].CurrOpinCellBiol.2008,20(2):214-221.)。随着测序技术的发展，它们逐渐被人们所认知，并成为一代明星RNA。目前，lncRNA在肺腺癌早期诊断及预后预测中的应用研究还比较少，更多的肺癌相关1ncRNAs还有待进一步的发掘。
技术实现思路
为了弥补现有技术的不足，本专利技术的目的之一在于提供一种与肺腺癌发生发展相关的lncRNA生物标志物及其在肺腺癌诊断和治疗中的应用。本专利技术的目的之二在于提供一种筛选治疗肺腺癌的候选药物的方法。为了实现上述目的，本专利技术采用如下技术方案：本专利技术的第一方面提供了一种检测试剂，所述试剂可以检测RP11-284F21.10的水平。进一步，所述试剂选自：特异性识别RP11-284F21.10的探针；或特异性扩增RP11-284F21.10的引物。进一步，所述特异性扩增RP11-284F21.10的引物序列如SEQIDNO.1～2所示。本专利技术的第二方面提供了一种产品，所述产品包括本专利技术第一方面所述的试剂。进一步，所述产品包括试剂盒、芯片、核酸膜条。本专利技术的第三方面提供了一种组合物，所述组合物包括有效量的RP11-284F21.10的抑制剂。所述抑制剂选自：以RP11-284F21.10或其转录本为靶序列、且能够抑制RP11-284F21.10基因表达或基因转录的干扰分子，包括：shRNA(小发夹RNA)、小干扰RNA(siRNA)、dsRNA、微小RNA、反义核酸，或能表达或形成所述shRNA、小干扰RNA、dsRNA、微小RNA、反义核酸的构建物。进一步，所述抑制剂为siRNA。进一步，所述siRNA的序列如SEQIDNO.7～12所示。优选的，所述siRNA的序列如SEQIDNO.7～8所示。本专利技术的第四方面提供了一种筛选治疗肺腺癌的候选药物的方法，所述方法包括：用待筛选物质处理表达或含有RP11-284F21.10基因的体系；和检测所述体系中RP11-284F21.10基因的表达；其中，若所述待筛选的物质可以降低RP11-284F21.10基因的水平，则表明该待筛选物质是治疗肺腺癌的候选药物。所述体系选自：细胞体系、亚细胞体系、溶液体系、组织体系、器官体系或动物体系。所述候选物质包括(但不限于)：针对RP11-284F21.10基因或其上游或下游基因设计的干扰分子、核酸抑制物、小分子化合物等。本专利技术的第五方面提供了如下任一项应用：a.本专利技术第一方面所述的试剂在制备诊断肺腺癌的工具中的应用；b.本专利技术第二方面所述的产品在制备诊断肺腺癌的工具中的应用；c.RP11-284F21.10在构建诊断肺腺癌的计算模型中的应用；d.RP11-284F21.10在制备治疗肺腺癌的药物中的应用；e.本专利技术第三方面所述的组合物在制备治疗肺腺癌的药物中的应用；f.RP11-284F21.10在筛选治疗肺腺癌的候选药物中的应用。附图说明图1是利用QPCR检测RP11-284F21.10基因在肺腺癌组织中的表达情况图；图2是检测siRNA对RP11-284F21.10的沉默效果图；图3是CCK8法检测RP11-284F21.10对肺腺癌细胞增殖的影响图。具体的实施方式本专利技术经过广泛而深入的研究，通过高通量测序以及生物信息学分析方法，检测肺腺癌标本中lncRNA在肿瘤组织和癌旁组织的表达，发现其中具有明显表达差异的lncRNA，探讨其与肺腺癌的发生发展之间的关系，从而为肺腺癌的诊断及靶向治疗寻找更好的途径和方法。通过筛选，本专利技术首次发现了肺腺癌中RP11-284F21.10显著性上调，同时根据RP11-284F21.10与肺腺癌之间的关系，通过设计针对RP11-284F21.10的siRNA来确定其与肺腺癌增殖之间的相关性。为肺腺癌的早期诊断及治疗提供了新的肿瘤标志物和治疗靶点。术语“表达的水平”或“表达水平”一般指生物学样品中生物标志物的量。“表达”一般指信息转化成细胞中存在并运行的结构的过程。本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种检测试剂，其特征在于，所述试剂可以检测RP11‑284F21.10的水平。

【技术特征摘要】
1.一种检测试剂，其特征在于，所述试剂可以检测RP11-284F21.10的水平。2.根据权利要求1所述的试剂，其特征在于，所述试剂选自：特异性识别RP11-284F21.10的探针；或特异性扩增RP11-284F21.10的引物。3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述特异性扩增RP11-284F21.10的引物序列如SEQIDNO.1～2所示。4.一种产品，其特征在于，所述产品包括权利要求1-3任一项所述的试剂。5.根据权利要求4所述的产品，其特征在于，所述产品包括试剂盒、芯片、核酸膜条。6.一种组合物，其特征在于，所述组合物包括有效量的RP11-284F21.10的抑制剂。7.根据权利要求6所述的组合物，其特征在于，所述抑制剂为siRNA。8.根据权利要求7所述的组合物，其特征在于，siRNA的序列如SEQIDN...

【专利技术属性】
技术研发人员：杨承刚，高舒欣，
申请(专利权)人：北京泱深生物信息技术有限公司，
类型：发明
国别省市：北京,11