一种整合多组学知识库的交互式生物信息云分析平台制造技术

本发明专利技术公开了一种整合多组学知识库的交互式生物信息云分析平台，所述交互式生物信息云分析平台包括：生物信息知识共享平台和生物信息在线分析交互平台；生物信息知识共享平台包括：云平台模块、在线课堂模块和论坛模块；云平台模块，用于提供生物信息分析所需的作图软件；在线课堂模块，用于提供各项组学技术的课堂和工具软件的实操教程；论坛模块，用于提供在线经验交流的服务。通过本发明专利技术的整合多组学知识库的交互式生物信息云分析平台能够实现：便捷地进入能够提供丰富多组学知识的集课堂、论坛、分析于一体的知识共享平台，方便学习专业知识和解决相关操作问题。

An Interactive Bioinformatics Cloud Analysis Platform Integrating Multigroup Knowledge Base

【技术实现步骤摘要】
一种整合多组学知识库的交互式生物信息云分析平台
本专利技术涉及生物信息分析
，尤其涉及一种整合多组学知识库的交互式生物信息云分析平台。
技术介绍
随着测序技术的飞速发展，利用新一代测序技术进行基因测序能够大大降低测序成本和时间。因此，高通量测序技术在各个行业得到了广泛的应用，例如，应用于医疗、环境、农业、医药、健康等领域。目前，基因检测涵盖了DNA水平、RNA水平、蛋白水平、微生物水平和表观水平等多条业务线。然而，基因测序所生成的原始数据并不能反映任何有价值的信息，必须通过专业人员进行分析和解读，如何从海量测序数据中挖掘出有价值的核心信息，才是目前科研人员面临的关键问题。因此，大部分科研人员都是将研究样本和研究目的提供给生物信息分析公司，将基因检测和数据分析进行外包。项目分析结束后，生物信息分析公司将分析结果以word或PDF文档和大量的原始数据进行交付。考虑到用户对分析结果不满意或想修改时，无法对静态的word或PDF文档进行修改。目前，很多公司开发了生物云平台，由用户来上传原始数据等，来进一步满足用户需求。中国专利技术专利CN104331640A公开了基于生物云平台的项目结题报告分析系统和方法，报告系统包括结题报告解析报告模块、用户界面模块、结题报告呈现模块和综合分析模块。CN105550536A公布了一种基于生物云平台的外显子测序数据分析方法及系统，对外显子测序数据进行个性化分析。CN107368700A公开了一种基于计算机云平台的微生物多样性交互分析系统及方法，该系统包括了项目管理模块、基础分析任务提交模块和交互式结果分析模块，实现了针对微生物多样性的一键化生物信息分析，呈现出可视化结果和交互式报告。现在公司的业务种类繁多，涵盖DNA水平、RNA水平、微生物水平、表观水平及蛋白水平等多种业务。需要开发出一种整合多组学知识库且能够涵盖公司所有业务线的生物信息云分析平台，来实现一站式个性化生物信息分析，同时也能为客户提供交互式的动态结题报告。申请内容为了解决上述技术问题，本专利技术提供了一种整合多组学知识库的交互式生物信息云分析平台，对于一些没有生物信息经验或经验不足的用户来说，当在操作过程中有任何知识欠缺时，可以便捷地进入能够提供丰富多组学知识的集课堂、论坛、分析于一体的知识共享平台，方便学习专业知识和解决相关操作问题。为了达到本专利技术目的，本专利技术提供了一种整合多组学知识库的交互式生物信息云分析平台，所述交互式生物信息云分析平台包括：生物信息知识共享平台和生物信息在线分析交互平台；生物信息知识共享平台包括：云平台模块、在线课堂模块和论坛模块；云平台模块，用于提供生物信息分析所需的作图软件；在线课堂模块，用于提供各项组学技术的课堂和工具软件的实操教程；论坛模块，用于提供在线经验交流的服务。可选地，生物信息在线分析交互平台包括：项目模块、任务模块和分析平台模块。可选地，项目模块包括：项目数据列表单元和项目搜索框单元；项目数据列表单元，用于展示用户所要分析的所有的项目信息；项目搜索框单元，用于对流程名称的关键字进行项目信息的查询。可选地，任务模块包括任务数据列表单元和任务搜索框单元；任务数据列表单元，用于记录用户所进行过的所有的任务信息；任务搜索框单元，用于对任务名称的关键字进行任务信息的查询。可选地，分析平台模块包括：微生物多样性分析平台单元、转录组分析平台单元和遗传图谱分析平台单元。可选地，微生物多样性分析平台单元包括：第一流程分析子单元和第一结果交互分析子单元；第一结果交互分析子单元包括：分组方案组件、OTU筛选组件、物种分类分析组件、Alpha多样性分析组件、Beta多样性分析组件和功能分析组件；分组方案组件，用于根据实验需求将样本进行分组；OTU筛选组件，用于按照需要筛选OTU，自动生成后续分析所需要的OTU丰度表格以对样本进行筛选，接着对筛选出的样本进行分析；物种分类分析组件，用于对样本进行针对不同分类水平，在物种层面进行分析；Alpha多样性分析组件，用于对样本进行α多样性指数、稀释曲线和α多样性差异分析；Beta多样性分析组件，用于对样本进行样本距离分析、UPGMA聚类树、多元统计分析和群落结构差异分析；功能分析组件，用于对样本进行PICRUSt、Tax4FUN和FUNGuild分析。可选地，转录组分析平台单元包括：第二流程分析子单元和第二结果交互分析子单元；第二结果交互分析子单元包括：总览组件、样本关系组件、基因筛选组件、差异分析组件、基本功能分析组件和高级功能分析组件；总览组件，用于展示项目标号、样本名称、分组方案及样本间差异方案、测序数据；样本关系组件，用于对样本进行分组并进行后续分析或样本件关系分析；基因筛选组件，用于对样本进行基因筛选和基因序列筛选；差异分析组件，用于对比较组样本的基因进行表达量差异分析；基本功能分析组件，用于对样本进行GO、KEGG功能富集分析；高级功能分析组件，用于对样本选择分组并进行参数设置后再进行趋势分析。可选地，遗传图谱分析平台单元包括：第三流程分析子单元和第三结果交互分析子单元；第三结果交互分析子单元包括：表型导入与分析组件、标记筛选过滤组件和QTL分析组件；表型导入与分析组件，用于按照输入文件格式选择上传原始表型记录文件，并进行表型分析参数设定，来提交表型分析任务，得到处理后的表型文件；标记筛选过滤组件，用于对处理后的表型文件进行过滤参数的设置，进行图谱标记过滤，得到处理后的基因型文件；QTL分析组件，用于对表型文件和基因型文件进行QTL分析。可选地，还包括：快捷组件；快捷组件，用于连接到生物信息知识共享平台。本专利技术的优点在于，通过本专利技术可以实现：对于一些无生物信息经验或经验不足的用户来说，当在操作过程中有任何知识欠缺时，可以便捷地进入能够提供丰富多组学知识的集课堂、论坛、分析于一体的知识共享平台，学习专业知识和解决相关操作问题。附图说明图1为本专利技术实施例的整合多组学知识库的交互式生物信息云分析平台；图2为本专利技术实施例的生物信息知识共享平台；图3为本专利技术实施例的生物信息在线分析交互平台；图4为本专利技术实施例的生物信息在线分析交互平台的分析平台模块；图5为本专利技术实施例的生物信息在线分析交互平台的微生物多样性分析平台单元；图6为本专利技术实施例的微生物多样性分析平台单元的第一结果交互分析子单元；图7为本专利技术实施例的生物信息在线分析交互平台的转录组分析平台单元；图8为本专利技术实施例的转录组分析平台单元的第二结果交互分析子单元；图9为本专利技术实施例的生物信息在线分析交互平台的遗传图谱分析平台单元；图10为本专利技术实施例的遗传图谱分析平台单元的第三结果交互分析子单元。具体实施方式以下通过特定的具体实例并结合附图说明本专利技术的实施方式，本领域技术人员可由本说明书所揭示的内容轻易地了解本专利技术的其它优点与功效。本专利技术亦可通过其它不同的具体实例加以施行或应用，本说明书中的各项细节亦可基于不同观点与应用，在不背离本专利技术的精神下进行各种修饰与变更。如图1所示，本专利技术实施例提供一种整合多组学知识库的交互式生物信息云分析平台，主要包括了两大部分，分别为生物信息知识共享平台和生物信息在线分析交互平台。生物信息知识共享平台包括但不限于：云平台模块、在线课堂模块和论坛模块；云平台模本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种整合多组学知识库的交互式生物信息云分析平台，其特征在于，所述交互式生物信息云分析平台包括：生物信息知识共享平台和生物信息在线分析交互平台；生物信息知识共享平台包括：云平台模块、在线课堂模块和论坛模块；云平台模块，用于提供生物信息分析所需的作图软件；在线课堂模块，用于提供各项组学技术的课堂和工具软件的实操教程；论坛模块，用于提供在线经验交流的服务。

【技术特征摘要】
1.一种整合多组学知识库的交互式生物信息云分析平台，其特征在于，所述交互式生物信息云分析平台包括：生物信息知识共享平台和生物信息在线分析交互平台；生物信息知识共享平台包括：云平台模块、在线课堂模块和论坛模块；云平台模块，用于提供生物信息分析所需的作图软件；在线课堂模块，用于提供各项组学技术的课堂和工具软件的实操教程；论坛模块，用于提供在线经验交流的服务。2.如权利要求1所述的交互式生物信息云分析平台，其特征在于，生物信息在线分析交互平台包括：项目模块、任务模块和分析平台模块。3.如权利要求2所述的交互式生物信息云分析平台，其特征在于，项目模块包括：项目数据列表单元和项目搜索框单元；项目数据列表单元，用于展示用户所要分析的所有的项目信息；项目搜索框单元，用于对流程名称的关键字进行项目信息的查询。4.如权利要求2所述的交互式生物信息云分析平台，其特征在于，任务模块包括任务数据列表单元和任务搜索框单元；任务数据列表单元，用于记录用户所进行过的所有的任务信息；任务搜索框单元，用于对任务名称的关键字进行任务信息的查询。5.如权利要求2所述的交互式生物信息云分析平台，其特征在于，分析平台模块包括：微生物多样性分析平台单元、转录组分析平台单元和遗传图谱分析平台单元。6.如权利要求5所述的交互式生物信息云分析平台，其特征在于，微生物多样性分析平台单元包括：第一流程分析子单元和第一结果交互分析子单元；第一结果交互分析子单元包括：分组方案组件、OTU筛选组件、物种分类分析组件、Alpha多样性分析组件、Beta多样性分析组件和功能分析组件；分组方案组件，用于根据实验需求将样本进行分组；OTU筛选组件，用于按照需要筛选OTU，自动生成后续分析所需要的OTU丰度表格以对样本进行筛选，接着对筛选出的样本进行分析；物种分类分析组件，用于对样本进行针对不...

【专利技术属性】
技术研发人员：周煌凯，夏昊强，高川，张羽，陶勇，罗玥，邢燕，曾川川，
申请(专利权)人：广州基迪奥生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：广东,44