黄瓜果实多刺基因ns紧密连锁的SNP标记及其应用制造技术

技术编号:21134239 阅读:35 留言:0更新日期:2019-05-18 03:14
本发明专利技术涉及生物技术辅助育种领域,特别涉及黄瓜果实多刺基因ns紧密连锁的SNP标记及其应用。用于检测黄瓜果实多刺基因ns紧密连锁的SNP标记的引物,核苷酸序列为TCACCCTTACTCTAAAAAAGTA/GCTTTCAACGTGAAAAATGTG;所述引物扩增的与黄瓜果实多刺基因ns连锁的特征条带的核苷酸序列如Seq ID No.1所示,序列的23位碱基为T;所述引物扩增的与黄瓜果实少刺基因Ns连锁的特征条带的核苷酸序列如Seq ID No.2所示,序列的23位碱基为C。该标记可用在黄瓜候选材料的任何阶段判断其果实为多刺还是少刺,具有效率高、限制少、准确度高的优点。

SNP Markers Closely Linked to the Spiny Gene ns in Cucumber Fruit and Their Application

The invention relates to the field of biotechnology-assisted breeding, in particular to SNP markers closely linked to the spiny gene ns in cucumber fruits and their application. The primers used to detect SNP markers closely linked to the spiny gene ns in cucumber fruits are TCACCCTTACTAAAAGTA/GCTTTCAACGTGAAATGTG. The nucleotide sequences of the characteristic bands linked to the spiny gene ns in Cucumber Fruits amplified by the primers are shown in Seq ID No.1, and the 23 base bases of the sequence are T. The primers amplify the characteristic bands linked to the spiny gene Ns in Cucumber fruits. The nucleotide sequence of the band is shown in Seq ID No.2, and the 23 base of the sequence is C. This marker can be used in any stage of cucumber candidates to judge whether the fruit is more or less thorny. It has the advantages of high efficiency, less restriction and high accuracy.

【技术实现步骤摘要】
黄瓜果实多刺基因ns紧密连锁的SNP标记及其应用
本专利技术涉及生物技术辅助育种领域,特别涉及一种黄瓜果实多刺基因ns紧密连锁的SNP标记及其在黄瓜育种材料选择中的应用。
技术介绍
黄瓜(CucumissativusL.)是世界十大蔬菜之一,因其风味清香、口感脆爽、营养丰富,深受各国消费者的喜爱。作为重要的果菜类蔬菜,果实品质一直是黄瓜育种研究的重点。黄瓜果实品质包括外观品质和内在品质。通常说的品质性状主要指商品性即外观品质,包括瓜色、瓜长、果刺多少、果刺颜色、果瘤大小、果色均匀度、光泽度、果棱、果实表面黄色条纹等。果刺多少作为黄瓜重要的商品性状之一,对商品销售影响很大。一般来讲,国内市场上需求密刺黄瓜,目前生产上主推的品种绝大多数为密刺。研究黄瓜果刺多少的遗传规律及分子标记,对于选育符合市场需求的新品种具有重要意义。关于控制黄瓜果刺的相关基因,已报道的有五个基因,分别为s、s-2、s-3、ss和ns。前人对于果刺多少的遗传规律进行了多项研究。1984年Fanourakis首次报道了控制黄瓜果实多刺的基因(ns),少刺Ns对多刺ns为显性。随后Fanourakis和Simon的研究也本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.用于检测黄瓜果实多刺基因ns紧密连锁的SNP标记的引物,其特征在于:其核苷酸序列如下:SNPns‑01‑F:5’‑TCACCCTTACTCTAAAAAAGTA‑3’;SNPns‑01‑R:5’‑GCTTTCAACGTGAAAAATGTG‑3’;所述引物扩增的与黄瓜果实多刺基因ns连锁的特征条带的核苷酸序列如Seq ID No.1所示,序列的第23位碱基为T,经RsaI酶切后得到154bp片段;所述引物扩增的与黄瓜果实少刺基因Ns连锁的特征条带的核苷酸序列如Seq ID No.2所示,序列的第23位碱基为C,经RsaI酶切后得到133bp片段。

【技术特征摘要】
1.用于检测黄瓜果实多刺基因ns紧密连锁的SNP标记的引物,其特征在于:其核苷酸序列如下:SNPns-01-F:5’-TCACCCTTACTCTAAAAAAGTA-3’;SNPns-01-R:5’-GCTTTCAACGTGAAAAATGTG-3’;所述引物扩增的与黄瓜果实多刺基因ns连锁的特征条带的核苷酸序列如SeqIDNo.1所示,序列的第23位碱基为T,经RsaI酶切后得到154bp片段;所述引物扩增的与黄瓜果实少刺基因Ns连锁的特征条带的核苷酸序列如SeqIDNo.2所示,序列的第23位碱基为C,经RsaI酶切后得到133bp片段。2.一种筛选具有果实多刺基因ns的黄瓜种质资源的方法,其特征在于:包括以下步骤:(1)提取待测样品基因组DNA;(2)以所述待测样品基因组DNA为模板,以权利要求1所述的引物进行PCR扩增;(3)对PCR扩增片段进行测序或RsaI酶切;如果测序结果如SeqIDNo.1所示,则果实为多刺性状;如果测序结果如SeqIDNo.2所示,则果实为少刺性状;如果酶切后片段为154bp,则果实为多刺性状;如果酶切后片段为133bp,则果实为少刺性状。3.根据权利要求2所述的方法...

【专利技术属性】
技术研发人员:张圣平顾兴芳苗晗蔡和序薄凯亮
申请(专利权)人:中国农业科学院蔬菜花卉研究所
类型:发明
国别省市:北京,11

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