智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定系统及方法技术方案

本发明专利技术公开了一种智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定系统及方法，涉及DNA测序鉴定技术领域，通过该细菌核酸测序鉴定系统及方法，方便了人们快速对食物中毒源的DNA条形码数据库及其检测鉴定溯源的技术研究，保障了食品安全、指导人们膳食选择、预防中毒事件的发生，同时建立了常见细菌的核酸测序鉴定方法，为人们在生物领域内的细菌、细胞及病毒的DNA条形码测序和鉴定带来方便，同时DNA基因组在提取和纯化时采用特殊的方式进行操作，避免DNA序列发生分解，且本发明专利技术采用构建的标准核酸序列，按照统一的共性描述和规范编码录入细菌核酸测序鉴定标准核酸序列数据库，其可为细菌核酸测序鉴定方法提供客观、准确的判定依据。

Intelligent DNA Barcode System and Method for Bacterial Nucleic Acid Sequencing and Identification

The invention discloses an intelligent DNA barcode bacterial nucleic acid sequencing and identification system and method, which relates to the technical field of DNA sequencing and identification. Through the bacterial nucleic acid sequencing and identification system and method, it is convenient for people to quickly study the DNA barcode database of food poisoning sources and its detection and identification traceability technology, and ensures food safety, guides people's dietary choice and prevents poisoning events. At the same time, the method of nucleic acid sequencing and identification of common bacteria has been established, which brings convenience for DNA barcode sequencing and identification of bacteria, cells and viruses in the biological field. At the same time, the DNA genome is extracted and purified in a special way to avoid the decomposition of DNA sequence. The present invention adopts the standard nucleic acid sequence constructed, and describes it in accordance with the common characteristics. The standard nucleic acid sequence database of bacterial nucleic acid sequencing and identification can provide objective and accurate judgment basis for bacterial nucleic acid sequencing and identification methods.

【技术实现步骤摘要】
智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定系统及方法
本专利技术涉及DNA测序鉴定
，具体为一种智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定系统及方法。
技术介绍
DNA特征序列(DNA条形码)分子鉴定是利用基因组中一段公认的、相对较短的DNA序列来进行物种鉴定的分子生物学分类方法。该方法以核酸测序技术为基础，通过筛选通用DNA特征序列，建立数据库和鉴定平台，运用生物信息学方法分析比对DNA数据，进而对物种进行鉴定，是对传统生物鉴定方法的有效补充和重大突破，近年来受到国内外药品质量标准制定机构的广泛关注，并逐渐成为物种鉴定和分类的研究热点。DNA条形码技术已发展近20年，鉴别技术、引物设计、扩增条件均较为成熟，鲀毒鱼、高生物胺水产品、有毒蘑菇、曼陀罗等有毒动植物毒性强烈、致死率高，且存在广泛，严重威胁人类健康。鉴定标准数据库的缺乏和分析方法的局限在很大程度上阻碍了食品安全预警、食物中毒溯源、以及污染水平和暴露风险研究。因此，建立地区常见食物中毒源DNA条形码数据库及其快速检测鉴定溯源技术研究已成为当务之急，是保障我国食品安全、指导人们膳食选择、预防中毒事件发生的迫切要求。
技术实现思路
(一)解决的技术问题针对现有技术的不足，本专利技术提供了一种智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定系统及方法，解决了上述
技术介绍
中所提出的问题。(二)技术方案为达到以上目的，本专利技术采取的技术方案是：一种智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定系统，包括提取模块、数据生成模块和数据检测模块，所述提取模块包括细菌核酸提取纯化和细菌核酸测序运作，所述数据生成模块包括细菌核酸DNA的序列生成以及细菌核酸DNA的序列拼接，所述数据检测模块包括细菌DNA序列的数据对比鉴定。优选的，所述数据对比检测模块包括数据库，所述数据库与数据对比鉴定模块进行双向连接。优选的，所述数据生成模块在DNA序列数据生成后直接通过数据检测模块进行对比鉴定检测。一种智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定方法，包括以下步骤：S1、获取并培养获得需要进行鉴定的细菌菌株；S2、提取步骤一获得的细菌菌株的基因组DNA；S3、使用通用核酸测序引物对PCR扩增菌株特定序列；S4、提取并纯化PCR产物；S5、测定并生成步骤四得到的PCR产物的核酸序列；S6、应用序列分析软件进行序列拼接，以通用核酸测序引物对定位，去除引物区，获得相应片段的DNA序列；S7、将步骤六相应片段的DNA序列与数据库中的资料进行序列对比，对细菌进行鉴定，然后自动生成鉴定结果。优选的，所述DNA核酸序列在进行序列比对分析时，首先选择具有鉴定和分类意义的核酸序列片段，并根据保守区域核酸序列设计通用核酸测序引物对。优选的，所述细菌的基因组DNA的提取和纯化采用溶菌酶、十二烷基硫酸钠、十六烷基三甲基溴化铵进行菌体破碎；采用苯酚-氯仿-异戊醇、乙醇沉淀核酸，获得符合质量控制要求的基因组DNA。(三)有益效果该智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定系统及方法，有益效果在于：通过该细菌核酸测序鉴定系统及方法，方便了人们快速对食物中毒源的DNA条形码数据库及其检测鉴定溯源的技术研究，保障了食品安全、指导人们膳食选择、预防中毒事件的发生，同时建立了常见细菌的核酸测序鉴定方法，为人们在生物领域内的细菌、细胞及病毒的DNA条形码测序和鉴定带来方便，同时DNA基因组在提取和纯化时采用特殊的方式进行操作，避免DNA序列发生分解，且本专利技术采用构建的标准核酸序列，按照统一的共性描述和规范编码录入细菌核酸测序鉴定标准核酸序列数据库，其可为细菌核酸测序鉴定方法提供客观、准确的判定依据。附图说明图1为本专利技术智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定系统的结构示意图。具体实施方式下面将结合本专利技术实施例中的附图，对本专利技术实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述，显然，所描述的实施例仅仅是本专利技术一部分实施例，而不是全部的实施例。基于本专利技术中的实施例，本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例，都属于本专利技术保护的范围。如图1所示，本专利技术提供一种技术方案：一种智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定系统，包括提取模块、数据生成模块和数据检测模块，提取模块包括细菌核酸提取纯化和细菌核酸测序运作，数据生成模块包括细菌核酸DNA的序列生成以及细菌核酸DNA的序列拼接，数据生成模块在DNA序列数据生成后直接通过数据检测模块进行对比鉴定检测，数据检测模块包括细菌DNA序列的数据对比鉴定，数据对比检测模块包括数据库，数据库与数据对比鉴定模块进行双向连接。一种智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定方法，包括以下步骤：S1、获取并培养获得需要进行鉴定的细菌菌株；S2、提取步骤一获得的细菌菌株的基因组DNA；S3、使用通用核酸测序引物对PCR扩增菌株特定序列；S4、提取并纯化PCR产物；S5、测定并生成步骤四得到的PCR产物的核酸序列；S6、应用序列分析软件进行序列拼接，以通用核酸测序引物对定位，去除引物区，获得相应片段的DNA序列；S7、将步骤六相应片段的DNA序列与数据库中的资料进行序列对比，对细菌进行鉴定，然后自动生成鉴定结果。DNA核酸序列在进行序列比对分析时，首先选择具有鉴定和分类意义的核酸序列片段，并根据保守区域核酸序列设计通用核酸测序引物对。细菌的基因组DNA的提取和纯化采用溶菌酶、十二烷基硫酸钠、十六烷基三甲基溴化铵进行菌体破碎；采用苯酚-氯仿-异戊醇、乙醇沉淀核酸，获得符合质量控制要求的基因组DNA。以上所述的具体实施方式，对本专利技术的目的、技术方案和有益效果进行了进一步详细说明，所应理解的是，以上所述仅为本专利技术的具体实施方式而已，并不用于限制本专利技术，凡在本专利技术的精神和原则之内，所做的任何修改、等同替换、改进等，均应包含在本专利技术的保护范围之内。本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定系统，包括提取模块、数据生成模块和数据检测模块，所述提取模块包括细菌核酸提取纯化和细菌核酸测序运作，所述数据生成模块包括细菌核酸DNA的序列生成以及细菌核酸DNA的序列拼接，所述数据检测模块包括细菌DNA序列的数据对比鉴定。

【技术特征摘要】
1.一种智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定系统，包括提取模块、数据生成模块和数据检测模块，所述提取模块包括细菌核酸提取纯化和细菌核酸测序运作，所述数据生成模块包括细菌核酸DNA的序列生成以及细菌核酸DNA的序列拼接，所述数据检测模块包括细菌DNA序列的数据对比鉴定。2.根据权利要求1所述的智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定系统，其特征在于：所述数据对比检测模块包括数据库，所述数据库与数据对比鉴定模块进行双向连接。3.根据权利要求1所述的智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定系统，其特征在于：所述数据生成模块在DNA序列数据生成后直接通过数据检测模块进行对比鉴定检测。4.一种智能DNA条形码的细菌核酸测序鉴定方法，包括以下步骤：S1、获取并培养获得需要进行鉴定的细菌菌株；S2、提取步骤一获得的细菌菌株的基因组DNA；S3、使用通用核酸测序引物对P...

【专利技术属性】
技术研发人员：于维森，石学香，杜惠琴，牛娟娟，
申请(专利权)人：青岛市疾病预防控制中心青岛市预防医学研究院，
类型：发明
国别省市：山东,37