【技术实现步骤摘要】
捕获探针的设计方法、捕获探针、捕获探针组和试剂盒
本专利技术属于基因检测领域,具体地,本专利技术涉及捕获探针的设计方法、捕获探针、捕获探针组和试剂盒,更具体地,本专利技术涉及高通量检测人循环肿瘤DNA基因变异的捕获探针的设计方法、捕获探针、捕获探针组和试剂盒。
技术介绍
自2015年1月20日,美国总统奥巴马在国情咨文中提出“精准医学计划”后,一时间“精准医疗”成为覆盖全球的热门话题,并引得医药健康产业市场风起云涌。此后,中国也提出了自己的发展计划,将发展精准医疗写入“十三五生物产业发展规划”中。预计2030年前,我国将在精准医疗领域投入600亿元。以第二代测序技术、化学发光技术为代表的新兴诊断技术为精准医疗及相关产业带来了前所未有的发展机遇。恶性肿瘤是危害人类健康的重大疾病种类之一,全球尚无十分有效的治疗和控制手段。我国每年约新增各类癌症病人300余万,入院病人600余万,死亡病人200余万。根据2017年国家癌症中心最新发布的统计数据显示,2013年我国肺癌、子宫癌、胃癌、结直肠癌、食管癌、卵巢癌、肝癌新发病人数分别73.3万、6.2万、42.7万、34.8万 ...
【技术保护点】
1.一种捕获探针的设计方法,其特征在于,包括:(1)设计基础探针序列;(2)在基础探针序列的5’游离区与3’游离区之间每间隔一定碱基数量插入一定长度的人类基因组无关序列;其中,在基础探针序列的5’游离区与3’游离区之间的第一个插入序列与最后一个插入序列互补,并且第一个插入序列与最后一个插入序列不与其它插入序列互补。
【技术特征摘要】
1.一种捕获探针的设计方法,其特征在于,包括:(1)设计基础探针序列;(2)在基础探针序列的5’游离区与3’游离区之间每间隔一定碱基数量插入一定长度的人类基因组无关序列;其中,在基础探针序列的5’游离区与3’游离区之间的第一个插入序列与最后一个插入序列互补,并且第一个插入序列与最后一个插入序列不与其它插入序列互补。2.根据权利要求1所述的捕获探针的设计方法,其特征在于,在步骤(2)中,在基础探针序列的5’游离区与3’游离区之间至少依次设置茎1区、间隔1区、插入1区、间隔2区和茎2区;其中,茎1区、插入1区和茎2区是插入的人类基因组无关序列。3.根据权利要求2所述的捕获探针的设计方法,其特征在于,所述5’游离区、所述间隔1区、所述间隔2区和所述3’游离区是与目标区域互补的序列。4.根据权利要求2所述的捕获探针的设计方法,其特征在于,所述茎1区与所述茎2区互补,在二级结构中形成茎环二级结构。5.根据权利要求2所述的捕获探针的设计方法,其特征在于,所述捕获探针的长度是50bp至1.5kb,优选是150bp。6.根据权利要求2所述的捕获探针的设计方法,其特征在于,所述间隔1区的长度是1bp至299bp,优选是30bp;所述间隔2区的长度是1bp至299bp,优选是30bp。7.根据权利要求2所述的捕获探针的设计方法,其特征在于,所述插入1区的长度是1bp至300bp,优选是10bp。8.根据权利要求2所述的捕获探针的设计方法,其特征在于,在所述基础探针序列的5’端连接生物标记。9.根据权利要求8所述的捕获探针的设计方法,其特征在于,所述生物标记是氨基酸、生物素、多肽标签、肝素、多糖或脂类;优选地,所述生物标记是生物素。10.一种捕获探针,其特征在于,包括:5’游离区、3’游离区和位于5’游离区与3’游离区之间的区域;其中,位于5’游离区与3’游离区之间的区域包括多个依次交替排列的间隔区和插入区,其中插入区是人类基因组无关序列。11.根据权利要求10所述的捕获探针,其特征在于,所述位于5’游离区与3’游离区之间的区域至少依次包括茎1区、间隔1区、插入1区、间隔2区和茎2区。12.根据权利要求11所述的捕获探针,其特征在于,所述5’游离区、所述间隔1区、所述间隔2区和所述3’游离区是与目标区域互补的序列。13.根据权利要求11所述的捕获探针,其特征在于,所述茎1区、所述插入1区和所述茎2区是人类基因组无关序列。14.根据权利要求11所述的捕获探针,其特征在于,所述茎1区与所述茎2区互补。15.根据权利要求11所述的捕获探针,其特征在于,所述捕获探针具有茎环二级结构。16.根据权利要求11所述的捕获探针,其特征在于,所述捕获探针的长度是50bp至1.5kb,优选是150bp。17.根据权利要求11所述的捕获探针,其特征在于,所述间隔1区的长度是...
【专利技术属性】
技术研发人员:孙虎林,
申请(专利权)人:上海思路迪生物医学科技有限公司,
类型:发明
国别省市:上海,31
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