一种胃癌基因变异及药物解读多数据库交互系统技术方案

本发明专利技术实施例公开了一种胃癌基因变异及药物解读多数据库交互系统，包括：胃癌基因变异信息数据库、胃癌药物治疗数据库以及胃癌文献信息数据库；各数据库用于存储对应的数据；其中，胃癌药物治疗数据库包括胃癌基因变异与药物治疗批准信息数据库、胃癌基因变异与药物治疗专家共识信息数据库以及胃癌基因变异与药物治疗临床试验信息数据库。通过建立多数据库交互系统，能够存储胃癌基因变异及药物相关数据，该交互系统数据量完善且易于使用。

【技术实现步骤摘要】
一种胃癌基因变异及药物解读多数据库交互系统
本专利技术实施例涉及计算机
，具体涉及一种胃癌基因变异及药物解读多数据库交互系统。
技术介绍
胃癌(gastriccarcinoma)是起源于胃黏膜上皮的恶性肿瘤，在我国各种恶性肿瘤中发病率居首位，胃癌发病有明显的地域性差别，在我国的西北与东部沿海地区胃癌发病率比南方地区明显为高。好发年龄在50岁以上，男女发病率之比为2：1。由于饮食结构的改变、工作压力增大以及幽门螺杆菌的感染等原因，使得胃癌呈现年轻化倾向。胃癌可发生于胃的任何部位，其中半数以上发生于胃窦部，胃大弯、胃小弯及前后壁均可受累。绝大多数胃癌属于腺癌，早期无明显症状，或出现上腹不适、嗳气等非特异性症状，常与胃炎、胃溃疡等胃慢性疾病症状相似，易被忽略，因此，目前我国胃癌的早期诊断率仍较低。胃癌的预后与胃癌的病理分期、部位、组织类型、生物学行为以及治疗措施有关。胃癌的分型方法经历了3个重要的阶段：1923年的大体形态分型、1965年的组织病理学分，2014年发展的四种基因分型法。目前，主流的分类方法主要为组织病理学分类和基因型分类，按照组织病理学分类，可将胃癌分为为腺癌、腺鳞癌、鳞癌、类癌等，绝大多数是胃腺癌。按组织结构不同，腺癌还可分为乳头状癌、管状腺癌、低分化腺癌、黏液腺癌和印戒细胞癌。按细胞分化程度不同，可分为高分化、中分化、低分化3种。按组织起源可分为肠型和胃型(弥漫型)；按照基因型分类，可将胃癌分为EB病毒感染型胃癌(EBV)、微卫星不稳定型胃癌(MSII)、基因组稳定型胃癌(GS)、染色体不稳定型胃癌(CIN)，四种不同分子分型呈现出不同的分子特征。EBV型，约占所有胃癌的9％，表现为PIK3CA基因高频突变和DNA高度甲基化，以及JAK2、PDL-1/2扩增，和ARID1A、BCOR频发突变；MIS型，约占所有胃癌的22％，表现为突变率高，包括编码靶向致癌信号蛋白的基因突变，有胃型CIMP、MHL1超甲基化；GS型，约占20％，多为弥漫型，存在RHOA基因突变或RHO家族GTP酶活化蛋白基因融合现象；CIN型，约为50％，多为肠型，显著的异倍体型和受体络氨酸激酶激活突变。按照不用分子分型使得胃癌在治疗上区别于传统治疗，根据不同的分子特点，选择个体化治疗，是胃癌治疗的发展趋势。随着胃癌患者样本中所检测基因数目的快速增加,临床分子实验室检测到越来越多的新的序列变异.某些病症及药物使用仅与单个基因突变相关,而多数病症及药物使用与多个基因突变相关，基因变异与药物解读之间的联系十分的紧密且复杂，对某个给定序列变异的临床意义进行分级解读，选择特异和最佳的药物方案进行治疗，用于胃癌的个体化用药指导是目前基因检测在序列解读方面不断面临着新的挑战。但是，随着二代测序技术的不断发展而产生的海量的基因变异数据，庞大的基因变异数据和各种形态数据(药物、指南、临床信息、文献等)的处理和分析是实现疾病精准医疗的重点。目前，并没有统一的关于胃癌基因变异与药物解读的标准和数据库，对于相关基因变异数据的解读和收集整理各大公司和临床机构有着不同的处理方法和流程，因此如何建立完善且方便使用的胃癌基因变异及药物数据库是亟待解决的问题。
技术实现思路
由于现有方法存在上述问题，本专利技术实施例提出一种胃癌基因变异及药物解读多数据库交互系统。第一方面，本专利技术实施例提出一种胃癌基因变异及药物解读多数据库交互系统，包括：胃癌基因变异信息数据库、胃癌药物治疗数据库以及胃癌文献信息数据库；所述胃癌基因变异信息数据库、所述胃癌药物治疗数据库和所述胃癌文献信息数据库分别两两连接；所述胃癌基因变异信息数据库用于存储胃癌基因变异相关的数据；所述胃癌药物治疗数据库用于存储胃癌药物治疗相关的数据；所述胃癌文献信息数据库用于存储胃癌文献相关的数据；其中，所述胃癌药物治疗数据库包括：胃癌基因变异与药物治疗批准信息数据库、胃癌基因变异与药物治疗专家共识信息数据库以及胃癌基因变异与药物治疗临床试验信息数据库。在一些实施方案中，所述系统还包括：解读报告装置；所述解读报告装置分别与所述胃癌基因变异信息数据库、所述胃癌药物治疗数据库和所述胃癌文献信息数据库连接，用于对接收的判断结果进行解读，生成解读报告。在一些实施方案中，所述系统还包括：检索解读结果统计装置；所述解读结果统计装置分别与所述胃癌基因变异信息数据库、所述胃癌药物治疗数据库、所述胃癌文献信息数据库和所述解读报告装置连接，用于统计各数据库中检索的胃癌基因变异与药物相关的证据等级，判断所述证据等级的高低得到判断结果，将所述判断结果发送给所述解读报告装置，并接收所述解读报告装置反馈的解读报告。在一些实施方案中，所述胃癌基因变异信息数据库包括基因变异信息数据库、胃癌信息数据库和胃癌药物数据库；所述基因变异信息数据库用于存储选自下组的一项或多项：基因名称、基因功能背景介绍、染色体位置、转录本号、基因变异RS号、基因所处信号通路、基因变异核苷酸变异信息、基因变异氨基酸变异信息、序列变异在核苷酸和氨基酸水平功能预测结果；所述胃癌信息数据库用于存储选自下组的一项或多项：疾病发生部位、疾病名称、发生原因、疾病特征、诊断学方法及指标。所述胃癌药物数据库用于存储疾病治疗药物，包括选自下组的一项或多项：化学药物、靶向治疗药物、免疫治疗药物、基因治疗药物等其他新型治疗药物。在一些实施方案中，所述胃癌基因变异与药物治疗批准信息数据库用于存储选自下组的一项或多项：药物商品名称、通用名称、适应症信息、使用方法、剂量和管理、禁忌症、警告和预防措施、不良反应数据、药物相互作用及特定使用人群信息；优选地，所述胃癌基因变异与药物治疗批准信息数据库的信息检索层级包括两层，第一层为胃癌与基因变异信息，第二层为基因变异信息。在一些实施方案中，所述胃癌基因变异与药物治疗专家共识信息数据库用于存储与基因变异药物使用的诊断、治疗、监控和/或预后信息；优选地，所述胃癌基因变异与药物治疗专家共识信息数据库的信息检索层级包括两层，第一层为胃癌与基因变异信息，第二层为基因变异信息。在一些实施方案中，所述胃癌基因变异与药物治疗临床试验信息数据库用于存储已完成的临床试验和在招募的临床试验信息，包括选自下组的一项或多项：临床研究号、研究名称、研究方案、变异检测方法、样本数量、人群特征、研究结果和研究结论；优选地，所述胃癌基因变异与药物治疗临床试验信息数据库的信息检索层级包括两层，第一层为胃癌与基因变异信息，第二层为基因变异信息。在一些实施方案中，所述胃癌文献信息数据库用于选自下组的一项或多项：存储期刊名称、肿瘤类型、基因变异信息、检测方法、人群特征、样本数量、研究结果、研究结论、文献编号PMID和期刊IF因子；优选地，所述胃癌文献信息数据库的信息检索层级包括两层，第一层为胃癌与基因变异信息，第二层为基因变异信息。第二方面，本专利技术实施例提出基于上述系统的多数据交互方法，包括：接收检索终端的检索请求，所述检索请求包括检索关键字；根据所述检索请求与胃癌基因变异及药物解读多数据库交互系统进行交互，并根据所述检索关键字在所述胃癌基因变异及药物解读多数据库交互系统中进行检索，得到胃癌基因变异与药物证据；查询预设相关性表得到胃癌基因变异与药物证据的相关性，将所述相关性与临床本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种胃癌基因变异及药物解读多数据库交互系统，其特征在于，包括：胃癌基因变异信息数据库、胃癌药物治疗数据库以及胃癌文献信息数据库；所述胃癌基因变异信息数据库、所述胃癌药物治疗数据库和所述胃癌文献信息数据库分别两两连接；所述胃癌基因变异信息数据库用于存储胃癌基因变异相关的数据；所述胃癌药物治疗数据库用于存储胃癌药物治疗相关的数据；所述胃癌文献信息数据库用于存储胃癌文献相关的数据；其中，所述胃癌药物治疗数据库包括：胃癌基因变异与药物治疗批准信息数据库、胃癌基因变异与药物治疗专家共识信息数据库以及胃癌基因变异与药物治疗临床试验信息数据库。

【技术特征摘要】
1.一种胃癌基因变异及药物解读多数据库交互系统，其特征在于，包括：胃癌基因变异信息数据库、胃癌药物治疗数据库以及胃癌文献信息数据库；所述胃癌基因变异信息数据库、所述胃癌药物治疗数据库和所述胃癌文献信息数据库分别两两连接；所述胃癌基因变异信息数据库用于存储胃癌基因变异相关的数据；所述胃癌药物治疗数据库用于存储胃癌药物治疗相关的数据；所述胃癌文献信息数据库用于存储胃癌文献相关的数据；其中，所述胃癌药物治疗数据库包括：胃癌基因变异与药物治疗批准信息数据库、胃癌基因变异与药物治疗专家共识信息数据库以及胃癌基因变异与药物治疗临床试验信息数据库。2.根据权利要求1所述的系统，其特征在于，所述系统还包括：解读报告装置；所述解读报告装置分别与所述胃癌基因变异信息数据库、所述胃癌药物治疗数据库和所述胃癌文献信息数据库连接，用于对接收的判断结果进行解读，生成解读报告。3.根据权利要求2所述的系统，其特征在于，所述系统还包括：检索解读结果统计装置；所述解读结果统计装置分别与所述胃癌基因变异信息数据库、胃癌药物治疗数据库、胃癌文献信息数据库和解读报告装置连接，统计各数据库中检索的胃癌基因变异与药物相关的证据等级，判断所述证据等级的高低得到判断结果，将所述判断结果发送给所述解读报告装置，并接收所述解读报告装置反馈的解读报告。4.根据权利要求1所述的系统，其特征在于，所述胃癌基因变异信息数据库包括基因变异信息数据库、胃癌信息数据库和胃癌药物数据库；所述基因变异信息数据库用于存储选自下组的一项或多项：基因名称、基因功能背景介绍、染色体位置、转录本号、基因变异RS号、基因所处信号通路、基因变异核苷酸变异信息、基因变异氨基酸变异信息、序列变异在核苷酸和氨基酸水平功能预测结果；所述胃癌信息数据库用于存储选自下组的一项或多项：疾病发生部位、疾病名称、发生原因、疾病特征、诊断学方法及指标；所述胃癌药物数据库用于存储选自下组的一项或多项：疾病治疗药物，包括化学药物、靶向治疗药物、免疫治疗药物、基因治疗药物等其他新型治疗药物。5.根据权利要求1所述的系统，其特征在于，所述胃癌基因变异与药物治疗批准信息数据库用于存储选自下组的一项或多项：药物商品名称、通用名称、适应症信息、使用方法、剂量和管理、禁忌症、警告和/或预防措施、不良反应数据、药物相互作用及特定使用人群信息；优选地，所述胃癌基因变异与药物治疗批准信息数据库的信息检索层级包括两层，第一层为胃癌与基因变异信息，第二层为基因变异信息；所述胃癌基因变异与药物治疗专家共识信息数据库用于存储与基因变异药物使用的诊断、治疗、监控和/或预后信息；优选地，所述胃癌基因变异与药物治疗专家共识信息数据库的信息检索层级包括两层，第一层为胃癌与基因变异信息，第二层为基因变异信息；所述胃癌基因变异与药物治疗临床试验信息数据库用于存储已完成的临床试验和在招募的临床试验信息，包括选自下组的一项或多项：临床研究号、研究名称、研究方案、变异检测方法、样本数量、人群特征、研究结果和研究结论；优选地，所述胃癌基因变异与药物治疗临床试验信息数据库的信息检索层级包括两层，第一层为胃癌与基因变异信息，第二层为基因变异信息。6.根据权利要求1所述的系统，其特征在于，所述胃癌文献信息数据库用于存储选自下组的一项或多项：期刊名称、肿瘤类型、基因变异信息、检测方法、人群特征、样本数量、研究结果、研究结论、文献编号PMID和期刊IF因子；优选地，所述胃癌文献信息数据库的信息检索层级包括两层，第一层为胃癌与基因变异信息，第二层为基因变异信息。7.一种基于权利要求1-6任一项系统的多数据交互方法，其特征在于，包括：接收检索终端的检索请求，所述检索请求包括检索关键字；根据所述检索请求与胃癌基因变异及药物解读多数据库交互系统进行交互，并根据所述检索...

【专利技术属性】
技术研发人员：杨达梅，杨丽，陈雷，黄梦珠，
申请(专利权)人：迈凯基因科技有限公司，
类型：发明
国别省市：四川,51