氯吡格雷用药相关基因检测报告的自动出具系统技术方案

本发明专利技术提供了一种氯吡格雷用药相关基因检测报告的自动出具系统，涵盖了患者基本信息、检测结果、检测结论、个体化用药建议等众多信息，能够对大量信息进行有效整合、集中展示，个体化用药建议部分可以统一编辑好后直接套用，也可以单独添加个性化备注信息；即使在检测例数较多的情况下，也可以根据基因检测仪器上的相关基因(CYP 2C19、PON1和ABCB1基因)的基因型的结果快速、高效、准确地出具氯吡格雷用药相关基因检测报告，只要录入患者基本临床信息和基因检测结果，便可自动出具检测报告。避免了出具繁琐的报告时耗费的大量人力，可节约大量的时间成本，并可降低出具报告时的错误发生率，从而便于医护人员临床工作中的使用。

Automatic issuing system for detection report of clopidogrel related genes

The invention provides an automatic publishing system for clopidogrel-related gene testing report, which covers a great deal of information such as patient's basic information, test results, test conclusions, personalized drug recommendation, etc. It can effectively integrate and display a large amount of information, and the personalized drug recommendation part can be edited uniformly. Individualized annotation information can be added directly or individually, and clopidogrel-related gene testing reports can be produced quickly, efficiently and accurately based on genotyping results of related genes (CYP 2C19, PON1 and ABCB1 genes) on genetic testing instruments, even if the number of cases is high. The basic clinical information and gene test results can automatically produce the test report. It avoids the large amount of manpower consumed in issuing tedious reports, saves a lot of time and costs, and reduces the incidence of errors in issuing reports, thus facilitating the use of medical staff in clinical work.

【技术实现步骤摘要】
氯吡格雷用药相关基因检测报告的自动出具系统
本专利技术属于医疗信息管理
，特别涉及一种氯吡格雷用药相关基因检测报告的自动出具系统。
技术介绍
氯吡格雷是治疗急性冠状动脉综合征和经皮冠状动脉介入术后抗血小板的重要药物，但有4％～30％患者在治疗期间出现氯吡格雷疗效下降，甚至出现氯吡格雷抵抗(即用药后无效)。随着遗传药理学和精准医学的快速发展，现已证实，氯吡格雷是一种本身无活性的前体药物，吸收入血后，需要依赖于肝脏内的一种酶，即CYP2C19酶代谢生成具有活性的代谢产物，才能发挥抗血小板的临床疗效。而CYP2C19酶作为一种蛋白质，是在CYP2C19基因的指导下合成的。越来越多的研究证实，CYP2C19基因中有3个基因位点，即CYP2C19*2、CYP2C19*3和CYP2C19*17的多态性(即这3个基因位点是否发生突变)与氯吡格雷用药后是否发生抵抗密切相关。在研究氯吡格雷的代谢时，可以依据CYP2C19*2、CYP2C19*3和CYP2C19*173个基因位点的多态性把人群中不同个体的CYP2C19基因型分为以下4种类型：1.野生纯合型(又称正常代谢型)：CYP2C19*2和CYP2C19*32个基因位点的基因型均为GG，且CYP2C19*17基因位点的基因型为CC时。2.中间代谢型：CYP2C19*2和CYP2C19*32个基因位点中有且仅有1者的基因型为AG(或GA。GA基因型与AG基因型可视作为相同的，下同)时，此时无论CYP2C19*17基因位点的基因型为CC、CT(或TC。TC基因型与CT基因型可视作为相同的，下同)还是TT，CYP2C19基因型均为中间代谢型。3.慢代谢型：CYP2C19*2和CYP2C19*32个基因位点的基因型均为AG时；或者这2个基因位点中有一者的基因型为AA，此时无论另一者的基因型是什么。在这2种情况下，无论CYP2C19*17基因位点的基因型为CC、CT还是TT，CYP2C19基因型均为慢代谢型。4.超快代谢型：CYP2C19*2和CYP2C19*32个基因位点的基因型均为GG，且CYP2C19*17基因位点的基因型为CT或TT时。常规剂量的氯吡格雷在野生纯合型(正常代谢型)患者中活性代谢产物正常，发生氯吡格雷抵抗的风险低；在中间代谢型患者中可先按常规剂量用药，必要时可增加氯吡格雷剂量或者调整治疗方案；在慢代谢型患者中产生的活性代谢物减少，抑制血小板聚集的作用下降，形成血栓风险增加，常需调整治疗方案；而在超快代谢型患者中产生活性代谢产物增加，抑制血小板聚集作用增强，发生出血的风险增加，氯吡格雷宜减量使用。2010年美国FDA修改的氯吡格雷说明书中列出黑框警告：CYP2C19基因型检测结果应作为医生调整治疗策略的参考，对于慢代谢型患者，建议考虑调整治疗方案或治疗策略。最新研究也证实，一种名为对氧磷酶1(PON1)的酶在氯吡格雷转化为活性产物的过程中也起着关键作用。但是该作用没有CYP2C19酶突出。表达PON1酶的PON1基因的多态性也可影响机体对氯吡格雷活化的能力，从而影响氯吡格雷的抗血小板疗效。临床中常把人群中不同个体PON1基因的基因型分为以下3种类型：1.野生纯合型：即PON1基因的基因型为GG。氯吡格雷活性代谢产物水平正常；2.突变杂合型：即PON1基因的基因型为AG或GA。氯吡格雷活性代谢产物水平减弱；3.突变纯合型：即PON1基因的基因型为AA。氯吡格雷活性代谢产物水平低。此外，ATP结合盒B亚家族成员1转运蛋白(ABCB1蛋白)是一种能量依赖性的膜蛋白，主要分布于肠道等部位。诸多研究显示，ABCB1蛋白在氯吡格雷从胃肠道吸收入血的过程中发挥作用。表达ABCB1蛋白的基因为ABCB1基因，该基因中关键位点，如3435C>T位点的变异可影响氯吡格雷在肠道的吸收过程。具体为：1.野生纯合型：即ABCB1基因的基因型为CC。氯吡格雷经肠道吸收正常；2.突变杂合型：即ABCB1基因的基因型为CT或TC。氯吡格雷经肠道吸收稍减弱(稍弱)；3.突变纯合型：即ABCB1基因的基因型为TT。氯吡格雷经肠道吸收较CT或TC基因型更弱，即肠道吸收减弱。由于在氯吡格雷转化为活性产物的过程中，PON1酶的作用没有CYP2C19酶突出，故常认为PON1基因的多态性影响氯吡格雷活化的过程中没有CYP2C19基因显著。而在氯吡格雷对人体发挥治疗效果的整个过程中，ABCB1蛋白的作用较CYP2C19酶和PON1酶更弱。故综合CYP2C19基因、PON1基因和ABCB1基因在氯吡格雷转化为活性产物的过程中的作用，现在的循证医学证据认为：1.当CYP2C19基因的基因型为慢代谢型时：无论PON1基因和ABCB1基因的基因型是什么，均认为患者氯吡格雷转化为活性产物的能力减弱，发生氯吡格雷抵抗的风险高。2.当CYP2C19基因的基因型为中间代谢型时：(1)当PON1基因的基因型为突变纯合型时，无论ABCB1基因的基因型是什么，认为患者氯吡格雷转化为活性产物的能力减弱，发生氯吡格雷抵抗的风险高；(2)当PON1基因的基因型为野生纯合型或突变杂合型时，无论ABCB1基因的基因型是什么，认为患者氯吡格雷转化为活性产物能力稍弱，存在中度氯吡格雷抵抗风险；3.当CYP2C19基因的基因型为野生纯合型(正常代谢型)时：(1)当PON1基因的基因型为突变纯合型或突变杂合型时，无论ABCB1基因的基因型是什么，认为患者氯吡格雷转化为活性产物能力稍弱，存在中度氯吡格雷抵抗风险；(2)当PON1基因的基因型也为野生纯合型时：①当ABCB1基因的基因型为野生纯合型时，此时，CYP2C19基因、PON1基因和ABCB1基因三者均为野生纯合型，认为患者氯吡格雷转化为活性产物能力正常(完全正常)，发生氯吡格雷抵抗的风险低；②当ABCB1基因的基因型为突变杂合型或突变纯合型时，认为患者氯吡格雷转化为活性产物能力基本正常，发生氯吡格雷抵抗的风险也低。4.当CYP2C19基因的基因型为超快代谢型时：患者氯吡格雷转化为活性产物能力增强，抑制血小板聚集作用增强，发生出血的风险增加。如前所述，此时，要求CYP2C19*17基因位点的基因型为CT或TT，且要求CYP2C19*2和CYP2C19*32个基因位点的基因型同时均为GG。现有的大样本研究中，CYP2C19*17基因位点的基因型为CT或TT的概率合计起来为4.40％，CYP2C19*2和CYP2C19*32个基因位点的基因型同时为GG的概率分别为51.10％和88.70％，故CYP2C19基因的基因型为超快代谢型的概率＝4.40％*51.10％*88.70％＝1.99％。即CYP2C19基因的基因型为超快代谢型的概率很低。这是根据基因检测公司提供的数据计算的结果(根据百余例患者的基因检测结果统计得出的)，首都医科大学附属北京潞河医院已完成千余例氯吡格雷相关基因检测，其中CYP2C19基因的基因型为超快代谢型的概率＜1％。目前，北京协和医院、北京大学人民医院、北京安贞医院、卫生部北京医院、阜外医院、解放军第309医院、复旦大学附属中山医院、广东省人民医院、福建省立医院、千佛山医院、安徽医科大学第一附属医院、新疆维吾尔自治区人民医院等成众多大型医本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种氯吡格雷用药相关基因检测报告的自动出具系统，其特征在于，包括如下部分：基本信息管理模块(1)，用于对患者的临床基本资料和氯吡格雷用药相关基因的检测结果进行整理和存储，所述氯吡格雷用药相关基因包括CYP2C19基因、PON1基因以及ABCB1基因，所述CYP2C19基因包括CYP2C19*2位点、CYP2C19*3位点以及CYP2C19*17位点，其中CYP2C19*2位点、CYP2C19*3位点以及PON1基因均包括GG、GA、AA三种基因型，CYP2C19*17位点以及ABCB1基因均包括CC、CT、TT三种基因型；检测结论推导模块(2)，用于根据所述氯吡格雷用药相关基因的检测结果，推导出每个所述患者的氯吡格雷转化活性产物能力的检测结论，并分别给出个体化用药建议，所述检测结论包括正常、基本正常、稍弱、减弱以及增强五类；检测报告出具模块(3)，用于根据所述临床基本资料、所述检测结论以及所述个体化用药建议，为每个患者对应生成一个氯吡格雷用药相关基因检测报告。

【技术特征摘要】
1.一种氯吡格雷用药相关基因检测报告的自动出具系统，其特征在于，包括如下部分：基本信息管理模块(1)，用于对患者的临床基本资料和氯吡格雷用药相关基因的检测结果进行整理和存储，所述氯吡格雷用药相关基因包括CYP2C19基因、PON1基因以及ABCB1基因，所述CYP2C19基因包括CYP2C19*2位点、CYP2C19*3位点以及CYP2C19*17位点，其中CYP2C19*2位点、CYP2C19*3位点以及PON1基因均包括GG、GA、AA三种基因型，CYP2C19*17位点以及ABCB1基因均包括CC、CT、TT三种基因型；检测结论推导模块(2)，用于根据所述氯吡格雷用药相关基因的检测结果，推导出每个所述患者的氯吡格雷转化活性产物能力的检测结论，并分别给出个体化用药建议，所述检测结论包括正常、基本正常、稍弱、减弱以及增强五类；检测报告出具模块(3)，用于根据所述临床基本资料、所述检测结论以及所述个体化用药建议，为每个患者对应生成一个氯吡格雷用药相关基因检测报告。2.如权利要求1所述的氯吡格雷用药相关基因检测报告的自动出具系统，其特征在于，所述基本信息管理模块(1)包括如下部分：通信单元(11)，用于从医院信息系统中获取患者的病例信息和基因检测信息；临床基本资料录入单元(12)，用于从所述病例信息中提取临床基本信息并进行存储；基因检测结果录入单元(13)，用于从所述基因检测信息中提取氯吡格雷用药相关基因的检测结果并进行存储。3.如权利要求2所述的氯吡格雷用药相关基因检测报告的自动出具系统，其特征在于，所述基因检测结果录入单元(13)还用于对CYP2C19*17位点的检测结果进行监控，当患者的CYP2C19*17位点为含有至少一个T的基因型时，对所述患者的所述病例信息和所述基因检测信息进行标记。4.如权利要求1所述的氯吡格雷用药相关基因检测报告的自动出具系统，其特征在于，所述检测结论推导模块(2)包括如下部分：基因类型判断单元(21)，用于根据氯吡格雷用药相关基因的检测结果，分别对所述患者的CYP2C19基因、PON1基因以及ABCB1基因的基因类进行判断；检测结论推导单元(22)，用于同时根据CYP2C19基因、PON1基因以及ABCB1基因的检测结果推导出所述患者的氯吡格雷转化活性产物能力的检测结论，所述检测结论包括正常、基本正常、稍弱、减弱以及增强五类；用药建议单元(23)，用于根据氯吡格雷转化活性产物能力的检测结论，分别为每一类所述检测结论对应的所述患者提供关于氯吡格雷的个体化用药建议。5.如权利要求4所述的氯吡格雷用药相关基因检测报告的自动出具系统，其特征在于，所述基因类型判断单元(21)包括如下部分：CYP2C19类型判断子单元(211)，用于同时根据CYP2C19*2位点、CYP2C19*3位点以及CYP2C19*17位点的基因型判断CYP2C19基因的基因类型：当CYP2C19*2位点和CYP2C19*3位点的基因型不含有A、且CYP2C19*17位点的基因型不含有T时，CYP2C19基因的类型为正常代谢型；当CYP2C19*2位点和CYP2C19*3位点的基因型有且仅有一个A时，CYP2C19基因的类型为中间代谢型；当CYP2C19*2位点和CYP2C19*3位点的基因型含有至少两个A时，CYP2C19基因的类型为慢代谢型；当CYP2C19*2位点和CYP2C19*3位点的基因型不含有A、且CYP2C19*17位点的基因型含有至少一个T时，CYP2C19基因的类型为超快代谢型；PON1类型判断子单元(212)，用于根据PON1基因的基因型判断PON1基因的基因类型：当PON1基因的基因型不含有A时，类型为野生纯合型；当PON1基因的基因型含有一个A时，类型为突变杂合型；当PON1基因的基因型含有两个A时，类型为突变纯合型；ABCB1类型判断子单元(213)，用于根据ABCB1基因的基因型判断ABCB1基因的基因类型：当ABCB1基因的基因型不含有T时，类型为野生纯合型；当ABCB1基因的基因型含有一个T时，类型为突变杂合型；当AB...

【专利技术属性】
技术研发人员：李六水，刘宪军，陈世才，成华，
申请(专利权)人：首都医科大学附属北京潞河医院，
类型：发明
国别省市：北京,11