一种新型GBS的建库接头结构制造技术

本发明专利技术公开的一种新型的GBS建库接头结构，包括首尾两种接头，分别称做P1接头和P2接头,其中所述P1接头为线性接头，含4‑10个碱基标签序列；所述P1接头为Y型接头，是由2‑10种不同片段长度接头组成的混合接头。本发明专利技术具有如下优点：1、P1和P2接头通过对酶切位点粘性末端的一个碱基的替换，是酶切位点一旦链接就不会再被切开，提高了链接效率。2、P1接头通过4‑10个碱基个数的错开排列，避免Reads1测序碱基不平衡造成测序质量差问题。3、P2接头通过插入0‑4个碱基个数的错开排列，避免Reads2测序碱基不平衡造成测序质量差问题。4、P2接头末端通过引入Y型结构，有效减少接头的自链，从而进一步提高链接效率。

A new GBS joint structure for building library

The invention discloses a novel GBS database building joint structure, which comprises a first and a tail joint, respectively called a P1 joint and a P2 joint, wherein the P1 joint is a linear joint and contains 4_10 base tag sequences, and the P1 joint is a Y joint, which is a mixed joint composed of 2_10 different segment length joints. The invention has the following advantages: 1. By substituting a base at the sticky end of the enzyme digestion site, the P1 and P2 junctions can not be cut again once the enzyme digestion site is linked, thereby improving the link efficiency. 2. The P1 junction is staggered by 4_10 base numbers to avoid the poor sequencing quality caused by the unbalanced base number of Reads1. 3. By inserting a staggered arrangement of 0_4 bases into the P2 joint, the problem of poor sequencing quality caused by unbalanced bases in Reads2 sequencing can be avoided. 4. By introducing Y-shaped structure at the end of P2 joint, the self-chain of the joint can be effectively reduced and the link efficiency can be further improved.

【技术实现步骤摘要】
一种新型GBS的建库接头结构
本专利技术涉及生物
，特别涉及一种新型的GBS建库接头结构。
技术介绍
GBS文库由于酶切位点的一致性，使用目前普遍使用的建库接头，都会存在比较严重的碱基平衡现象。导致测序质量差，有效数据量减少的情况。
技术实现思路
本专利技术所要解决的技术问题在于针对现有GBS的建库接头所存在的诸多问题而提供一种新型的GBS建库接头的结构，可以有效的减少接头自连，同时避免碱基不平衡的发生。本专利技术所要解决的技术问题可以通过以下技术方案来实现：一种新型的GBS建库接头结构，包括首尾两种接头，分别称做P1接头和P2接头,其中所述P1接头为线性接头，含4-10个碱基标签序列，用于区分不同的样本及避免测序中Reads1的碱基不平衡性；所述P1接头为Y型接头，是由2-10种不同片段长度接头组成的混合接头，可以极大降低接头本身的自连，并有效避免测序中Reads2的碱基不平衡。在本专利技术一个优选实施例中，所述P1接头的碱基序列如下：P1序列结构：正链：5`ACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT(4-10碱基barcode序列)(酶切位点序列)；负链本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种新型的GBS建库接头结构，其特征在于，包括首尾两种接头，分别称做P1接头和P2接头,其中所述P1接头为线性接头，含4‑10个碱基标签序列；所述P1接头为Y型接头，是由2‑10种不同片段长度接头组成的混合接头。

【技术特征摘要】
1.一种新型的GBS建库接头结构，其特征在于，包括首尾两种接头，分别称做P1接头和P2接头,其中所述P1接头为线性接头，含4-10个碱基标签序列；所述P1接头为Y型接头，是由2-10种不同片段长度接头组成的混合接头。2.如权利要求1所述的一种新型的GBS建库接头结构，其特征在于，所述P1接头的碱基序列如下：P1序列结构：正链：5`ACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT；负链：5`AGATCGGAAGAGCGTCGTGTAGGGAAAGAGTGT。3.如权利要求1所述的一种新型的GBS建库接头结构，其特征在于，所述P2接头的碱基序列如下：P2为5种接头的混合物：正链1：GATCGGAAGAGCGGGGACTTTAAGC；正链2：CA...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘艳艳，朱月艳，孙子奎，
申请(专利权)人：上海派森诺生物科技股份有限公司，
类型：发明
国别省市：上海,31