【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物信息，尤其涉及一种sgrna文库的分析方法和系统。
技术介绍
1、在crispr/cas9基因敲除文库中，向导rna(sgrna)是引导cas9酶进行精准切割的重要元件。每个sgrna都包含一个靶向序列，用于识别和结合到特定dna序列上，从而引导cas9酶进行切割。
2、在crispr/cas9的基因敲除文库可靶向编辑全基因组范围的目的基因时，利用生物信息学手段统计sgrna文库的丰度，从而鉴定出与特定表型相关的基因。其中，sgrna文库丰度统计的准确性尤为重要。
3、目前的sgrna文库的丰度分析方法主要是通过将测序序列与sgrna文库比对的方法来统计与sgnra文库中完全匹配的sgrna数目及丢失的sgrna等，即使有些算法会切除fastq文件中的一致性序列，但仍然可能有一些测序序列与sgrna文库中的某些条目存在一定的相似性，导致它们被错误地匹配，降低了sgrna文库分析的准确率。
4、因此，需提出一种sgrna文库的分析方法和系统。
技术实现思路
1、本说明书提供一种sgrna文库的分析方法和系统，通过比对所述目标样本数据与所述原始sgrna文库信息，得到匹配信息，所述匹配信息包括完全匹配信息、部分匹配信息；基于所述匹配信息，对所述原始sgrna文库信息进行分析，得到分析结果，确定目标基因，提高sgrna文库的分析准确性，减少人力物力成本。
2、本申请提供的一种sgrna文库的分析方法采用如下的技术方案，包括
3、获取原始样本数据和原始sgrna文库信息；
4、对所述原始样本数据进行预处理，得到目标样本数据；
5、比对所述目标样本数据与所述原始sgrna文库信息，得到匹配信息，所述匹配信息包括完全匹配信息、部分匹配信息；
6、基于所述匹配信息，对所述原始sgrna文库信息进行分析，得到分析结果，确定目标基因。
7、可选的，所述获取原始样本数据，包括：
8、获取原始配置信息；
9、根据所述原始配置信息中的样本脚本，确定所述原始样本数据的位置并提取所述原始样本数据，所述原始样本数据包括第一测序数据和第二测序数据。
10、可选的，所述对所述原始样本数据进行预处理，得到目标样本数据，包括：
11、依照预设处理条件对所述第一测序数据进行质控和过滤，得到第一目标数据；
12、依照所述预设处理条件对所述第二测序数据进行质控和过滤，得到第二目标数据；
13、将所述第一目标数据和所述第二目标数据进行合并，得到所述目标样本数据。
14、可选的，所述比对所述目标样本数据与所述原始sgrna文库信息，得到匹配信息，包括：
15、校验所述目标样本数据，基于校验结果确定所述目标样本数据中的第一统计信息；
16、基于所述第一统计信息和所述原始sgrna文库信息，得到匹配信息。
17、可选的，所述基于所述匹配信息，对所述原始sgrna文库信息进行分析，得到分析结果，确定目标基因，包括：
18、基于所述匹配信息进行差异分析，得到差异分析结果；
19、根据所述差异分析结果，按照预设筛选顺序筛选目标基因；分析得到所述目标基因的可视化结果和富集分析结果。
20、可选的，所述基于所述匹配信息，对所述原始sgrna文库信息进行分析，得到分析结果，包括：
21、对所述匹配信息进行标准化，基于标准化结果绘制箱线图，得到分布结果。
22、可选的，还包括：
23、所述目标样本数据包括处理样本；
24、对所述处理样本进行主成分分析和样本相关性聚类分析，得到相关性分析结果。
25、可选的，还包括：
26、汇总所述分布结果、所述差异分析结果、所述目标基因的可视化结果和富集分析结果中的至少一个，生成分析报告。
27、本申请提供的一种sgrna文库的分析系统采用如下的技术方案，包括：
28、获取模块，用于获取原始样本数据和原始sgrna文库信息；
29、预处理模块，用于对所述原始样本数据进行预处理，得到目标样本数据；
30、比对模块，用于比对所述目标样本数据与所述原始sgrna文库信息，得到匹配信息，所述匹配信息包括完全匹配信息、部分匹配信息；
31、分析模块，用于基于所述匹配信息，对所述原始sgrna文库信息进行分析，得到分析结果，确定目标基因。
32、可选的，所述获取模块，包括：
33、第一获取子模块，用于获取原始配置信息；
34、第二获取子模块，用于根据所述原始配置信息中的样本脚本，确定所述原始样本数据的位置并提取所述原始样本数据，所述原始样本数据包括第一测序数据和第二测序数据。
35、可选的，所述预处理模块，包括：
36、第一预处理子模块，用于依照预设处理条件对所述第一测序数据进行质控和过滤，得到第一目标数据；
37、第二预处理子模块，用于依照所述预设处理条件对所述第二测序数据进行质控和过滤，得到第二目标数据；
38、合并子模块，用于将所述第一目标数据和所述第二目标数据进行合并，得到所述目标样本数据。
39、可选的，所述比对模块，包括：
40、校验子模块，用于校验所述目标样本数据，基于校验结果确定所述目标样本数据中的第一统计信息；
41、匹配子模块，用于基于所述第一统计信息和所述原始sgrna文库信息，得到匹配信息。
42、可选的，所述分析模块，包括：
43、差异分析子模块，用于基于所述匹配信息进行差异分析，得到差异分析结果；
44、第二分析子模块，用于根据所述差异分析结果，按照预设筛选顺序筛选目标基因；分析得到所述目标基因的可视化结果和富集分析结果。
45、可选的，所述分析模块，包括：
46、分布分析子模块，用于对所述匹配信息进行标准化，基于标准化结果绘制箱线图，得到分布结果。
47、可选的，还包括：
48、所述目标样本数据包括处理样本；
49、聚类分析子模块，用于对所述处理样本进行主成分分析和样本相关性聚类分析，得到相关性分析结果。
50、可选的，还包括：
51、报告生成子模块，用于汇总所述分布结果、所述差异分析结果、所述目标基因的可视化结果和富集分析结果中的至少一个，生成分析报告。
52、本说明书还提供一种电子设备，其中，该电子设备包括：
53、处理器；以及，
54、存储计算机可执行指令的存储器，所述可执行指令在被执行时使所述处理器执行上述任一项方法。
55、本说明书还提供一种计算机可读存储介质，其中，所述计算机可读存储介质存储一个或多个程序，所述一个或多个程序本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种sgRNA文库的分析方法，其特征在于，包括：
2.如权利要求1所述的一种sgRNA文库的分析方法，其特征在于，所述获取原始样本数据，包括：
3.如权利要求2所述的一种sgRNA文库的分析方法，其特征在于，所述对所述原始样本数据进行预处理，得到目标样本数据，包括：
4.如权利要求1所述的一种sgRNA文库的分析方法，其特征在于，所述比对所述目标样本数据与所述原始sgRNA文库信息，得到匹配信息，包括：
5.如权利要求1所述的一种sgRNA文库的分析方法，其特征在于，所述基于所述匹配信息，对所述原始sgRNA文库信息进行分析，得到分析结果，确定目标基因，包括：
6.如权利要求1所述的一种sgRNA文库的分析方法，其特征在于，所述基于所述匹配信息，对所述原始sgRNA文库信息进行分析，得到分析结果，包括：
7.如权利要求1所述的一种sgRNA文库的分析方法，其特征在于，还包括：
8.如权利要求5-7所述的一种sgRNA文库的分析方法，其特征在于，还包括：
9.一种sgRNA文库的分析
...【技术特征摘要】
1.一种sgrna文库的分析方法，其特征在于，包括：
2.如权利要求1所述的一种sgrna文库的分析方法，其特征在于，所述获取原始样本数据，包括：
3.如权利要求2所述的一种sgrna文库的分析方法，其特征在于，所述对所述原始样本数据进行预处理，得到目标样本数据，包括：
4.如权利要求1所述的一种sgrna文库的分析方法，其特征在于，所述比对所述目标样本数据与所述原始sgrna文库信息，得到匹配信息，包括：
5.如权利要求1所述的一种sgrna文库的分析方法...
【专利技术属性】
技术研发人员：闫增强，李鸿毅，姜丽荣，孙子奎，
申请(专利权)人：上海派森诺生物科技股份有限公司，
类型：发明
国别省市：
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