一种基于二代测序的个体识别体系、试剂盒及其用途制造技术

技术编号:18908694 阅读:43 留言:0更新日期:2018-09-12 01:14
本发明专利技术公开了一种基于二代测序的个体识别体系、试剂盒及其用途,个体识别体系包括针对112个STR位点和318个SNP位点设计的引物序列,112个STR位点包括53个常染色体STR位点、23个X染色体STR位点及35个Y染色体STR位点和一个性别决定位点AMEL;318个SNP位点包括186个常染色体SNP位点、69个X染色体SNP位点、57个Y染色体SNP位点、及6个血型表型相关SNP位点。本个体识别体系只需要一次扩增就能同时获得常染色体、X染色体、Y染色体上的二代或三代遗传标记信息,减少操作步骤,缩短实验时间,适用于全球不同国家不同地区人群的DNA分型检测。

An individual identification system, kit and its application based on the two generation sequencing

The invention discloses an individual identification system, a kit and its application based on second generation sequencing. The individual identification system comprises a primer sequence designed for 112 STR loci and 318 SNP loci, 112 STR loci including 53 autosomal STR loci, 23 X chromosome STR loci, 35 Y chromosome STR loci and a sex determination. AMEL; 318 SNP loci included 186 autosomal SNP loci, 69 X SNP loci, 57 Y SNP loci, and 6 blood group phenotype related SNP loci. This system can obtain the second or third generation genetic marker information on autosomal, X and Y chromosomes at the same time with only one amplification. It can reduce the operation steps and shorten the experiment time. It is suitable for DNA typing detection in different countries and regions of the world.

【技术实现步骤摘要】
一种基于二代测序的个体识别体系、试剂盒及其用途
本专利技术涉及基因
,具体涉及一种基于二代测序的个体识别体系、试剂盒及其用途。
技术介绍
短串联重复序列(ShortTandomRepeat,STR),又称微卫星DNA或简单序列重复(SimpleSequenceRepeats,SSR),是一类广泛存在于人类基因组中的重复序列,它由2-6个碱基对构成核心序列,呈串联重复排列。STR在人类基因组中数量大、分布广泛、具有高度的遗传多态性、检测方法简单,因而被广泛应用于个体识别、亲权鉴定和群体遗传学研究。SNP(SingleNucleotidePolymorphism,单核苷酸多态性)是指基因组内DNA中某一特定核苷酸位置上存在转换、颠换、插入、缺失等变化。SNP作为第三代遗传标记在法医学鉴定中具有一定的优势。第一,密度大、分布广,SNP的位点极其丰富,几乎遍及整个基因组,据估计基因组中大约平均每1000bp就会出现一个SNP;第二,相对稳定,SNP具有相对较低的自发突变率(10-8);第三,二等位基因,SNP标记在人群或生物群体中一般只有两种等位型(allele)故亦称为双等位标记(b本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种基于二代测序的个体识别体系,其特征在于,包括针对112个STR位点和318个SNP位点同时扩增设计的引物序列,所述112个STR位点包括53个常染色体STR位点、23个X染色体STR位点及35个Y染色体STR位点和一个性别决定位点AMEL;所述318个SNP位点包括186个常染色体SNP位点、69个X染色体SNP位点、57个Y染色体SNP位点、及6个血型表型相关SNP位点。

【技术特征摘要】
1.一种基于二代测序的个体识别体系,其特征在于,包括针对112个STR位点和318个SNP位点同时扩增设计的引物序列,所述112个STR位点包括53个常染色体STR位点、23个X染色体STR位点及35个Y染色体STR位点和一个性别决定位点AMEL;所述318个SNP位点包括186个常染色体SNP位点、69个X染色体SNP位点、57个Y染色体SNP位点、及6个血型表型相关SNP位点。2.如权利要求1所述的基于二代测序的个体识别体系,其特征在于,所述53个常染色体STR位点对应的引物序列如SEQIDNO.1至SEQIDNO.106所示;所述性别决定位点AMEL和23个X染色体STR位点、35个Y染色体STR位点对应的引物序列如SEQIDNO.107至SEQIDNO.224所示;所述186个常染色体SNP位点对应的引物序列如SEQIDNO.225至SEQIDNO.596所示;所述69个X染色体SNP位点对应的引物序列如SEQIDNO.597至SEQIDNO.734所示;所述57个Y染色体SNP位点对应的引物序列如SEQIDNO.735至SEQIDNO.848所示;所述6个血型表型相关SNP位点对应的引物序列如SEQIDNO.849至SEQIDNO.860所示。3.如权利要求2所述的基于二代测序的个体识别体系,其特征在于,一个位点对应一对引物,采用3对引物分别扩增6个血型表型相关SNP位...

【专利技术属性】
技术研发人员:李生斌王泳钦杨慧龚雨晴
申请(专利权)人:深圳华大法医科技有限公司
类型:发明
国别省市:广东,44

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