构建突变集合的方法及其应用技术

本发明专利技术提供了一种构建突变集合的方法及其应用，该方法包括：(1)基于所述群体的个体总数和预先确定的碰撞概率阈值，确定所述突变集合中突变位点数目的最小值；和(2)从预先确定的初始集合中，选择预定数目的突变，以便获得所述突变集合，所述预定数目不小于步骤(1)中的所述最小值，其中，所述初始集合包括多个突变位点，所述多个突变位点的至少一部分满足下列条件：(a)所述突变位点的最大基因型概率不超过0.5；(b)所述突变位点的杂合比例不小于0.4；(c)所述突变位点不在重复序列区域中；(d)所述多个突变位点之间不存在连锁不平衡关系；和(e)所述突变位点满足哈温伯格平衡。和(e)所述突变位点满足哈温伯格平衡。

【技术实现步骤摘要】
构建突变集合的方法及其应用


[0001]本专利技术涉及生物信息领域，具体地，涉及构建突变集合的方法及其应用，更具体地，涉及一种突变集合、构建突变集合的装置、基于所述突变集合对个体进行身份识别的应用、一种非临时性可存储介质、一种计算机设备和一种计算机程序产品。

技术介绍

[0002]目前在司法领域的个体身份识别中，主要采用的是基于STR(short tandem repeat，短片段重复序列)多态性的技术。其主要是用于解决两个个体(比如犯罪现场嫌疑犯与随机个人)之间的识别问题，在该场景中主要运用的是一个称为“个体识别能力DP(discrimination power)”的统计量作为评价指标，用于衡量遗传标记系统中识别不同个体效能的大小，其考虑的是随机两个个体之间在遗传标记上存在差别的概率，该过程在统计学中被称为“单次伯努利试验”。
[0003]这套方法的重点在于确保单次比较中的两个个体区分度的“平均效能”达到最大，即确保平均进行一次比较的DP值达到最大。
[0004]但这种将DP最大化的原理在用于构建总体人群的DNA身份证(DNA本文档来自技高网...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.一种构建突变集合的方法，所述突变集合用于在群体中进行个体身份识别，其特征在于，包括：(1)基于所述群体的个体总数和预先确定的碰撞概率阈值，确定所述突变集合中突变位点数目的最小值；和(2)从预先确定的初始集合中，选择预定数目的突变，以便获得所述突变集合，所述预定数目不小于步骤(1)中的所述最小值，其中，所述初始集合包括多个突变位点，所述多个突变位点的至少一部分满足下列条件：(a)所述突变位点的最大基因型概率不超过0.5，优选地，所述突变位点的最大基因型概率为4/9；(b)所述突变位点的杂合比例不小于0.4；(c)所述突变位点不在重复序列区域中；(d)所述多个突变位点之间不存在连锁不平衡关系；和(e)所述突变位点满足哈温伯格平衡。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述突变包括选自SNP、STR、Indel的至少之一。3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，在步骤(1)中基于下列公式确定所述最小值：其中，m表示所述突变集合中的突变位点的数目；n表示所述群体的个体总数；和α表示所述碰撞概率阈值。4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述初始集合包括下列的至少一部分：
5.一种突变集合，所述突变集合用于在群体中进行个体身份识别，其特征在于，所述突变集合由多个突变位点构成，其中，所述多个突变位点的数目满足下列条件：其中，m表示所述突变集合中突变位点的数目；n表示所述群体的个体总数；和α表示所述预先确定的碰撞概率阈值，所述多个突变位点的每一个均满足下列条件：(a)所述突变位点的最大基因型概率不超过0.5，优选地，所述突变位点的最大基因型概率为4/9；(b)所述突变位点的杂合比例不小于0.4；(c)所述突变位点不在重复序列区域中；(d)所述多个突变位点之间不存在连锁不平衡关系；和(e)所述突变位点满足哈温伯格平衡。6.根据权利要求5所述的突变集合，其特征在于，所述α是根据a/n确定，其中n为群体的个体总数，...

【专利技术属性】
技术研发人员：谢刚，黄树嘉，金鑫，尹烨，王洪琦，
申请(专利权)人：深圳华大法医科技有限公司，
类型：发明
国别省市：