The invention discloses a method for enriching and capturing trace DNA of pancreatic cancer, which comprises steps: (1) extracting free DNA from a sample; (2) constructing a library of the free DNA; (3) enriching the library; (4) capturing the enriched library to obtain the captured DNA; (5) sequencing the captured DNA to obtain the measurement. Sequence analysis; (6) comparing the sequencing results with reference sequences, we obtained mutation sites.
【技术实现步骤摘要】
一种胰腺癌痕量DNA富集捕获测序的方法以及应用
本专利技术属于癌症基因检测领域,更具体而言涉及一种胰腺癌痕量DNA富集捕获测序的方法以及应用。
技术介绍
胰腺癌是消化道常见的恶性肿瘤之一,恶性程度高、预后极差(SiegelR,NaishadhamD,JemalA.Cancerstatistics,2013.CA:acancerjournalforclinicians.2013;63(1):11-30.doi:10.3322/caac.21166.)。全球胰腺癌死亡率为4.2%,位列恶性肿瘤死亡率的第7位,5年生存率不足6%,其中复发和转移是胰腺癌患者死亡的主要原因。目前,临床上通常采用影像学、肿瘤标志物、穿刺活检的方法对胰腺癌进行复发或治疗进展评估。由于胰腺癌乏血供的特性,常规影像学手段均较难发现早期转移灶及局部复发灶,导致影像学表现滞后;CA-199是目前仅有的FDA批准的用于胰腺癌术后监测的指标,但也存在敏感性和特异性的局限(OsayiSN,BloomstonM,SchmidtCM,EllisonEC,MuscarellaP.Biomarkersaspredi ...
【技术保护点】
1.一种胰腺癌痕量DNA富集捕获测序的方法,所述方法包括步骤:(1)从样本中提取游离DNA;(2)将所述游离DNA建文库;(3)将所述文库进行富集;(4)将所述富集的文库使用捕获探针进行捕获,获得捕获DNA;(5)将所述捕获DNA测序,获得测序结果;(6)将所述测序结果与参考序列比较,获得突变位点。
【技术特征摘要】
1.一种胰腺癌痕量DNA富集捕获测序的方法,所述方法包括步骤:(1)从样本中提取游离DNA;(2)将所述游离DNA建文库;(3)将所述文库进行富集;(4)将所述富集的文库使用捕获探针进行捕获,获得捕获DNA;(5)将所述捕获DNA测序,获得测序结果;(6)将所述测序结果与参考序列比较,获得突变位点。2.权利要求1的方法,步骤(1)中,所述样本选自胰液脱落细胞、穿刺活检样本、唾液、胸腹腔积液、尿液、粪便等。3.权利要求1或2的方法,在步骤(3)中进行PCR富集所述文库。4.权利要求1或2的方法,在步骤(4)中捕获探针为针对表3中所列出基因的基因序...
【专利技术属性】
技术研发人员:黄东胜,杨柳,胡晓歌,倪超,蒋佳宏,常连鹏,徐亚平,易鑫,杨玲,
申请(专利权)人:浙江省人民医院,北京吉因加科技有限公司,
类型:发明
国别省市:浙江,33
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