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与高尿酸血症密切相关的新的人URAT1基因SNP位点制造技术

技术编号:1765108 阅读:262 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术涉及维持血尿酸水平的关键基因-hURAT1第三内含子SNP位点+11G>A的发现。内容包括:原发性高尿酸血症患者以及正常人群的收集;常规方法提取外周血;根据目的基因设计特异性的引物,PCR扩增获得目的基因;将PCR产物纯化后测序;应用haploview软件检验研究对象SNP Hardy-Weinberg平衡,确认研究对象选取的随机性及两两SNP位点之间的连锁关系;应用X2检验比较不同组别基因型及等位基因频率,确定与原发性高尿酸血症相关的SNP及突变位点;应用Phase软件进行与原发性高尿酸血症相关的SNP位点所组成的单倍型分析,确定原发性高尿酸血症易感单倍型;应用Logistic回归分析和不同组别间生化指标的比较,确认原发性高尿酸血症的致病位点。结果显示我们在汉族人群中新发现的hURAT1第三内含子的SNP位点+11G>A与高尿酸血症易感性的提高显著相关。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术为与血液中尿酸水平密切相关的hURATl基因第三内含子SNP位点+11 G〉A,涉 及生物医学高技术中新基因的开发与应用领域。
技术介绍
尿酸是人体嘌呤代谢的终末产物,肾脏是尿酸排泄的主要途径。肾脏对尿酸的排泄主要 取决于肾小管腔和基底膜侧尿酸重吸收、分泌转运体的数目和活性。有关资料显示,肾小管对尿酸的重吸收增加是人类高尿酸血症的主要原因,而hURATl作为最重要的尿酸盐重吸收 转运体,被认为是调节血尿酸水平的关键蛋白。hURATl基因属于有机离子转运家族SLC22,该基因位于11ql3,含有10个外显子和9 个内含子。hURATl为阴离子交换通道,通过与乳酸等有机阴离子及氯等无机阴离子交换, 将肾小管管腔内的尿酸转运到肾小管上皮细胞内。临床资料显示,hURATl基因多态性与原发性高尿酸血症密切相关。GraesslerJ等研究发 现,hURATl基因第二外显子C426T多态性与德国人群肾尿酸排泄减少和高尿酸血症显著相 关,相对于CC基因型,CT和TT基因型个体肾脏尿酸排泄分数(FEUA)明显降低,血尿 酸水平明显升高;YukioShima等研究发现,日本男性受试者中hURATl第四内含子G/T多 态不同基因型者(GGGT和TT)血尿酸水平明显不同,GG基因型者血尿酸水平最高,GT 基因型者次之,TT基因型者最低,提出在日本人群中,该SNP位点可作为独立的高尿酸血 症预测标记。Vdzquez-Mellado等对69名墨西哥原发性痛风患者及其29名一级家属和120名 健康个体的hURATl基因进行序列分析,结果显示69名痛风患者中16名患者存在hURATl 基因突变,占患者的23%,其中5种突变位于第5外显子,l种突变位于第4外显子,16名 突变患者中有11名为第5外显子的C850G错义突变,提出上述突变可能与原发性痛风有关。单核苷酸多态性是人类遗传变异的主要来源,众多研究证明单核苷酸多态性影响多基因 遗传病个体的易感性。高尿酸血症是一种多基因遗传病,hURATl作为高尿酸血症的候选基 因,其单核苷酸多态性在导致高尿酸血症中发挥重要的作用。单核苷酸多态性在不同人群中 分布不同,在中国人群中没有高尿酸血症和hURATl基因单核苷酸多态性的相关性报道。本 研究中,我们选择568名中国北方汉族人群hURATl基因10个外显子和9个内含子进行测序,以期发现中国北方汉族人群中与高尿酸血症相关的hURATl基因单核苷酸多态性。 专利技术目的选择原发性高尿酸血症病人227例,对照组341例。取所有研究对象外周抗凝血,提取 基因组DNA。设计特异性引物,采用PCR方法分别扩增hURATl基因启动子、10个外显子 及外显子和内含子交界处,进行正向和反向测序,应用Genestar软件寻找SNP及突变位点;应 用haploview软件检验研究对象SNP Hardy-Weinberg平衡,确认研究对象选取的随机性及两 两SNP位点之间的连锁关系;应用乂2检验比较不同组别基因型及等位基因频率,确定与原 发性高尿酸血症相关的SNP及突变位点;应用Phase软件进行与原发性高尿酸血症相关的SNP 位点所组成的单倍型分析,确定原发性高尿酸血症易感单倍型;应用Logistic回归分析和不 同组别间生化指标的比较,确认原发性高尿酸血症的致病位点,从而为高尿酸血症的基因治疗 以及新药筛选等提供可能的理论指导和依据。内容与要求-研究对象中高尿酸血症组患者的收入标准普通饮食并排除心、肝、肾以及全身性疾病 的基础上,连续三次测定男性及绝经后女性血清中尿酸含量超过416umol/L,绝经前女性超过 357 umol/L。正常对照组收入标准血脂、肾功能、肝功能、尿酸值(各项生化指标)均在 正常范围内的无高尿酸血症家族史正常人。利用常规方法提取患者外周血的基因组DNA,结 合PCR方法获得目的片段,纯化后测序,与正常人相比较,寻找SNP位点。该基因/蛋白达到的技术指标为1、 hURATl基因中我们共发现了 13个SNP位点,其中12个与已知报道相符,但我们发现的 第3内含子+11G>A位点在国内、国际上均未见有相关报道,因此,该位点是hURATl基 因的一个新的SNP位点(测序图见图l)。2、 13个SNPs Hardy-Weinberg平衡检验显示所有实验样本均符合随机性原则(见表l)。3、 SNPs等位基因及基因型频率进行比较结果显示,高尿酸血症患者中第三内含子+llG〉ASNP, A等位基因频率为6.28。/。,在正常对照者中仅为1.7%,差异具有极显著性(A5.94X10—5)。 高尿酸血症患者AG+AA突变基因型频率显著高于正常对照组(12.11% VS 3.40%, /^8. 21 X10—5 )(见表2)。4、 单倍型Ht4 (包含所有突变型等位基因)在高尿酸血症组中的频率显著高于正常对照组, 与原发性高尿酸血症发病危险性密切相关(5.73% VS 1.74%,尸=5.93X10,。单倍型Ht4是4种单倍型中唯一包含第三内含子+3, 11 G〉A SNP A突变型等位基因的单倍型,并 是唯一与高尿酸血症密切相关的单倍型93X10—5)(见表3)。5、 连锁分析结果显示,第三内含子+3, 11G〉A不位于任何一个周围高度连锁的hURATl基因 BLOCK中,在基因连锁图中呈现断开现象(见图2)。6、 对发现的13个hURATl基因SNP位点进行Logistic回归分析结果显示,如果固定SNP11(+3, 11G〉A),其它任何SNP位点都不能改变它的尸值,相反SNPll (+3, 11G〉A)可以 改变其它任何一个SNP位点的尸值(见表4)。附图说明图1. hURATl基因第三内含子+3, 11G>A三种基因型GG, GA, M 图2. hURATl基因SNP位点连锁分析结果1-13代表hURATl基因上13个SNP位点l(SNPl): Promotor, -454A/T; 2(SNP2): Promotor, -434T/C ; 3(SNP3): Promotor, —382C/T; 4(SNP4): Promotor, -87C/T; 5(SNP5): Promotor, +118G/A;6(SNP6): Exon 1,C258T; 7(SNP7): Exon 2,C426T; 8(SNP8): Intron2, +271A/G ;9(SNP9): Intron 2, +277 C/T; 10(SNP10) : Intron 2,十278A/G; 11 (SNP11): Intron 3,+11 G/A; 12(SNP12): Intro 8,-103G/A; 13(SNP13): Exon8, T1309C.具体实施方式-1、 研究对象的分组与收集(1) 原发性高尿酸血症组收入标准普通饮食并排除心、肝、肾以及全身性疾病的基础上,连续三次测定男性及绝经后女性血清中尿酸含量超过416umol/L,绝经前女性超过357 umol/L。 227例原发性高尿酸血症患者来自青岛大学附属医院内分泌门诊、内分泌病房及健 康体检中心。其中,男性193例,平均年龄49.58±14.33岁;女性34例,平均年龄54.2± 1本文档来自技高网...

【技术保护点】
本专利技术涉及维持血尿酸水平的关键基因-hURAT1,发现该基因第三内含子的SNP位点+11G>A,其特征在于:首次在中国汉族人群中发现。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:李长贵苗志敏闫胜利韩琳王云龙孟冬梅
申请(专利权)人:李长贵苗志敏闫胜利
类型:发明
国别省市:95[中国|青岛]

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