用于运动系统状况的微生物组来源的诊断和治疗的方法及系统技术方案

一种用于至少一个受试者中的运动系统状况的表征、诊断和治疗中的至少一种的方法，该方法包括：接收来自受试者群体的生物样品的聚合集；生成受试者群体的微生物组组成数据集和微生物组功能多样性数据集中的至少一种；基于从微生物组组成数据集和微生物组功能多样性数据集中的至少一种提取的特征生成运动系统状况的表征；基于该表征生成被配置为矫正运动系统状况的疗法模型；以及在与受试者相关联的输出设备，基于表征和疗法模型为受试者安排疗法。

The method and system for the diagnosis and treatment of the source of the microorganism group for the state of the motion system

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于运动系统状况的微生物组来源的诊断和治疗的方法及系统相关申请的交叉引用本申请还要求2015年4月14日提交的序号为62/147,102的美国临时申请、2015年4月14日提交的序号为62/147,321的美国临时申请、2015年4月14日提交的序号为62/147,324的美国临时申请、2015年4月14日提交的序号为62/147,287的美国临时申请、和2015年4月14日提交的序号为62/147,314的美国临时申请的权益，其每一个通过该引用以其整体并入本文。
本专利技术总体涉及运动系统健康领域，且更具体地涉及运动系统健康领域中的用于微生物组来源(microbiome-derived)的诊断和治疗的新的且有用的方法及系统。背景微生物组是与生物体相关的共栖(commensal)、共生(symbiotic)和病原微生物的生态群。人类微生物组包含与整个人体中存在的人类细胞一样多的微生物细胞，但由于样品处理技术、遗传分析技术和用于处理大量数据的资源方面的限制，人类微生物组的表征仍处于初期阶段。尽管如此，怀疑微生物组在许多与健康/疾病相关的状态(例如，分娩的准备(preparation本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种用于至少一个受试者中的运动系统状况的表征、诊断和治疗中的至少一种的方法，所述方法包括：●在样品处理网络，用片段化操作、使用引物组的多重扩增操作、测序分析操作、和比对操作处理来自受试者群体的样品的聚合集的每一个的核酸内容物；●在与所述样品处理网络通信的计算系统，在处理所述样品的聚合集后生成微生物组组成数据集和微生物组功能多样性数据集；●在所述计算系统，接收补充数据集，所述补充数据集提供所述受试者群体中的所述运动系统状况的信息；●在所述计算系统，将所述补充数据集和从所述微生物组组成数据集和所述微生物组功能多样性数据集提取的特征转化成所述运动系统状况的表征模型；●与所述表征模型相关联地，生成被配...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2015.04.14 US 62/147,314;2015.04.14 US 62/147,321;1.一种用于至少一个受试者中的运动系统状况的表征、诊断和治疗中的至少一种的方法，所述方法包括：●在样品处理网络，用片段化操作、使用引物组的多重扩增操作、测序分析操作、和比对操作处理来自受试者群体的样品的聚合集的每一个的核酸内容物；●在与所述样品处理网络通信的计算系统，在处理所述样品的聚合集后生成微生物组组成数据集和微生物组功能多样性数据集；●在所述计算系统，接收补充数据集，所述补充数据集提供所述受试者群体中的所述运动系统状况的信息；●在所述计算系统，将所述补充数据集和从所述微生物组组成数据集和所述微生物组功能多样性数据集提取的特征转化成所述运动系统状况的表征模型；●与所述表征模型相关联地，生成被配置为改进所述运动系统状况的状态的疗法模型；以及●在与所述受试者相关联的输出设备，在根据所述表征模型和所述疗法模型表征所述受试者具有所述运动系统状况后，为所述受试者安排疗法。2.如权利要求1所述的方法，其中生成所述表征模型包括进行统计分析以评价跨表现出所述运动系统状况的所述受试者群体的第一子集和未表现出所述运动系统状况的所述受试者群体的第二子集具有变化的微生物组组成特征和微生物组功能特征的集合。3.如权利要求2所述的方法，其中生成所述表征模型包括：●提取与所述微生物组组成数据集中指示的微生物组组分的功能方面的集合相关的候选特征，以生成所述微生物组功能多样性数据集；以及●关于所述功能方面的集合的子集表征所述运动系统状况，所述子集源自以下中的至少一种：蛋白特征的直系同源聚类、来自京都基因和基因组百科全书(KEGG)的基因组功能特征、来自直系同源聚类(COG)数据库的基因组功能特征、化学功能特征和系统功能特征。4.如权利要求3所述的方法，其中生成所述运动系统状况的所述表征模型包括生成诊断关节炎紊乱的表征。5.如权利要求4所述的方法，其中生成所述运动系统状况的所述表征模型包括生成以下中的至少一种的表征：痛风、类风湿性关节炎和反应性关节炎。6.如权利要求3所述的方法，其中生成所述运动系统状况的所述表征模型包括生成诊断神经肌肉骨骼系统紊乱的表征。7.如权利要求6所述的方法，其中生成所述运动系统状况的所述表征模型包括生成以下中的至少一种的表征：多发性硬化和帕金森病。8.如权利要求7所述的方法，其中生成诊断多发性硬化的表征包括在处理所述样品的聚合集和确定来源于以下中的至少一种的特征的存在后生成所述表征：1)分类单元的集合，包括：乳球菌属(Lactococcus)(属)，和2)与以下中的至少一种相关的功能的集合：京都基因和基因组百科全书(KEGG)功能特征和直系同源聚类(COG)功能特征。9.如权利要求3所述的方法，其中生成所述运动系统状况的所述表征模型包括生成诊断肌肉骨骼系统紊乱的表征。10.一种用于表征运动系统状况的方法，所述方法包括：●在处理来自受试者群体的样品的聚合集后，生成所述受试者群体的微生物组组成数据集和微生物组功能多样性数据集中的至少一种，所述微生物组功能多样性数据集指示所述样品的聚合集的微生物组组分中存在的系统功能；●在所述计算系统，将从所述微生物组组成数据集和所述微生物组功能多样性...

【专利技术属性】
技术研发人员：扎迦利·阿普特，丹尼尔·阿尔莫纳西德，杰西卡·里奇曼，斯亚沃什·瑞兹万·贝赫巴哈尼，
申请(专利权)人：优比欧迈公司，
类型：发明
国别省市：美国,US