用于对样品成像用于生物或化学分析的方法、载体组件和系统技术方案
Methods, carrier components and systems used for biological or chemical analysis of sample imaging
The method includes positioning the first carrier component on the system platform. The first carrier component includes a support frame, which has an inner frame edge of a window that defines a supporting frame. The first carrier component includes a first substrate located in a window and encircled by the edge of the inner frame. The first substrate has a sample on it. The method includes the detection of light signals from the samples from the first base. The method also includes replacing the first carrier component on the system table with the second carrier component on the system table. The second carrier component consists of a support frame and a mounting plate maintained by a support frame. The second carrier component has a second substrate maintained by the mounting plate, and the second substrate has a sample on it. The method also includes the detection of light signals from the samples from the second substrate.
【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于对样品成像用于生物或化学分析的方法、载体组件和系统相关申请的交叉引用本申请要求于2015年3月24日提交的美国临时专利申请第62/137,600号的利益，其通过引用以其整体并入本文。专利技术背景本专利技术的实施方式大体上涉及生物或化学分析，且更特别地涉及用于检测来自样品的光信号以用于生物或化学分析的方法、载体组件和系统。用于生物或化学研究的各种测定方案涉及进行大量受控反应。在一些情况下，受控反应在支撑表面上进行。然后可以观察和分析指定的反应，以帮助识别指定反应中所涉及的化学物质的性质或特性。例如，在一些方案中，包括可识别标记(例如荧光标记)的化学组成部分可以在受控条件下选择性地结合到另一化学组成部分。可以通过用辐射激发标记并检测来自标记的光发射来观察这些化学反应。这些方案的示例包括DNA测序和基于多重阵列的测定。在一个边合成边测序(SBS)方案中，克隆扩增子的簇通过桥式PCR在流动池的通道的表面上形成。在生成克隆扩增子的簇之后，扩增子可以被“线性化”以制造单链DNA(sstDNA)。试剂的预定序列可以流入流动池内以完成测序周期。每个测序周期将sstDNA延长具有...
【技术保护点】
一种方法，包括：将第一载体组件定位在系统台上，所述第一载体组件包括支撑框架，所述支撑框架具有限定所述支撑框架的窗口的内框架边缘，所述第一载体组件包括可移除的第一基底，所述第一基底位于所述窗口内并被所述内框架边缘包围，所述第一基底在其上具有位于光学系统的成像区内的样品；根据第一成像方案使用所述光学系统来检测来自所述第一基底的所述样品的光信号；用所述系统台上的第二载体组件替换所述第一载体组件，所述第二载体组件具有可移除的第二基底，所述第二基底在其上具有位于所述光学系统的所述成像区内的样品，其中所述第一基底和第二基底是不同类型的基底；以及根据与所述第一成像方案不同的第二成像方案使...
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2015.03.24 US 62/137,6001.一种方法，包括：将第一载体组件定位在系统台上，所述第一载体组件包括支撑框架，所述支撑框架具有限定所述支撑框架的窗口的内框架边缘，所述第一载体组件包括可移除的第一基底，所述第一基底位于所述窗口内并被所述内框架边缘包围，所述第一基底在其上具有位于光学系统的成像区内的样品；根据第一成像方案使用所述光学系统来检测来自所述第一基底的所述样品的光信号；用所述系统台上的第二载体组件替换所述第一载体组件，所述第二载体组件具有可移除的第二基底，所述第二基底在其上具有位于所述光学系统的所述成像区内的样品，其中所述第一基底和第二基底是不同类型的基底；以及根据与所述第一成像方案不同的第二成像方案使用所述光学系统来检测来自所述第二基底的所述样品的光信号。2.如权利要求1所述的方法，其中，所述第一载体组件和第二载体组件中的每一个包括延伸到相应的载体组件中的孔，当所述相应的载体组件位于所述系统台上时，所述孔接纳所述系统台的对应基准，其中所述第二载体组件包括保持所述第二基底的接装板，所述基准在所述第一载体组件位于所述系统台上时接合所述第一基底，并在所述第二载体组件位于所述系统台上时接合所述接装板。3.如权利要求1所述的方法，其中，所述光学系统包括物镜，其中检测来自所述第一基底的光信号包括相对于彼此移动所述物镜和所述第一基底，其中检测来自所述第二基底的光信号包括相对于彼此移动所述物镜和所述第二基底，其中所述光学系统沿着第一成像区检测来自所述第一基底的光信号，所述光学系统沿着第二成像区检测来自所述第二基底的光信号，所述第一成像区和第二成像区的大小不同，其中所述第一成像方案和第二成像方案包括分别相对于所述第一基底和第二基底沿着不同的路径自动移动所述物镜。4.如权利要求1所述的方法，其中，所述第二载体组件包括保持机构，所述保持机构包括可移动基准块，所述方法还包括按压所述基准块，将所述第二基底定位在所述第二载体组件上，以及释放所述基准块，所述基准块与所述第二基底接合以将所述第二基底保持在所述第二载体组件上，其中所述基准块不相对于所述第一载体组件保持所述第一基底。5.如权利要求1所述的方法，其中，所述第一基底和第二基底具有不同的厚度并分别具有第一基底表面和第二基底表面，其中检测来自所述第一基底和第二基底的光信号包括分别检测来自所述第一基底表面和第二基底表面的光信号，所述第一基底表面和第二基底表面处于公共平面或偏移100微米或更小。6.如权利要求1所述的方法，其中，所述第二基底包括特征的微阵列，以及检测来自所述第二基底的光信号包括捕获所述特征的微阵列的重叠部分的一系列图像，所述特征中的每一个都具有固定于其的指定探针分子，所述微阵列具有附着于其的目标分析物；所述方法还包括：分析所述图像中的与相应特征相关联的光强度并确定所述图像的数据表示，所述数据表示具有基于所述微阵列的相应特征的数据特征的相应子阵列，所述数据特征中的每一个具有相对于其他数据特征的对应位置和基于所述光强度中的一个或更多个的信号值；以及基于相邻图像的数据表示的数据特征的信号值的比较来组合所述相邻图像的数据表示，从而生成所述微阵列的数据表示；分析所述微阵列的所述数据表示以确定样品的性质或特性。7.如权利要求1所述的方法，其中，所述第一基底是流动池。8.如权利要求2所述的方法，其中，所述流动池包括在所述流动池的入口和出口之间延伸的流动通道，所述入口和出口流体地耦合到歧管以用于使液体流动通过所述流动通道。9.如权利要求2所述的方法，其中，所述流动池包括在所述流动池的相应的入口和出口之间延伸的多个流动通道，所述入口和出口流体地耦合到歧管以用于使液体流动通过所述流动通道。10.如权利要求2所述的方法，还包括重复地使试剂流动通过所述流动池以进行边合成边测序(SBS)方案。11.如权利要求1所述的方法，其中，所述第一成像方案和第二成像方案包括沿着不同的路径相对于彼此移动物镜和/或所述系统台。12.如权利要求1所述的方法，其中，所述第二基底是开放面基底，所述开放面基底具有固定到该开放面基底的外表面的生物或化学物质。13.如权利要求7所述的方法，其中，所述开放面基底包括沿着所述外表面的微阵列。14.如权利要求8所述的方法，其中，所述微阵列包括平行于彼此延伸的多个特征条带，所述特征条带中的每一个都有反应部位的阵列。15.如权利要求1所述的方法，其中，所述第一载体组件和第二载体组件中的每一个包括延伸到相应的载体组件中的孔，当所述相应的载体组件位于所述系统台上时，所述孔接纳对应的基准。16.如权利要求10所述的方法，其中，所述第一基底接合所述基准，而所述第二基底不接合所述基准。17.如权利要求1所述的方法，其中，所述第一基底大于所述第二基底。18.如权利要求1所述的方法，其中，所述光学系统包括物镜，其中检测来自所述第一基底的光信号包括相对于彼此移动所述物镜和所述第一基底，其中检测来自所述第二基底的光信号包括相对于彼此移动所述物镜和所述第二基底。19.如权利要求13所述的方法，其中，所述光学系统沿着第一成像区检测来自所述第一基底的光信号，所述光学系统沿着第二成像区检测来自所述第二基底的光信号，所述第一成像区和第二成像区的大小不同。20.如权利要求13所述的方法，其中，所述第一成像方案和第二成像方案包括分别相对于所述第一基底和第二基底沿着不同路径自动移动所述物镜。21.如权利要求1所述的方法，其中，所述第一载体组件和第二载体组件以实质上相同的方式接合所述系统台。22.一种方法，包括：将第一载体组件定位在系统台上，所述第一载体组件包括支撑框架，所述支撑框架具有限定所述支撑框架的窗口的内框架边缘，所述第一载体组件包括位于所述窗口内并被所述内框架边缘包围的第一基底，所述第一基底在其上具有位于光学系统的成像区内的样品；使用所述光学系统检测来自所述第一基底的所述样品的光信号；用所述系统台上的第二载体组件替换所述第一载体组件，所述第二载体组件包括支撑框架和耦合到所述支撑框架的接装板，所述第二载体组件具有由所述接装板保持的第二基底，所述第二基底具有在其上的样品，所述第二基底的所述样品位于所述光学系统的所述成像区内；以及使用所述光学系统检测来自所述第二基底的所述样品的光信号。23.如权利要求22所述的方法，其中，所述第一载体组件和第二载体组件中的每一个包括延伸到相应的载体组件中的孔，当所述相应的载体组件位于所述系统台上时，所述孔接纳所述系统台的对应基准，所述基准在所述第一载体组件位于所述系统台上时接合所述第一基底且在所述第二载体组件位于所述系统台上时接合所述接装板。24.如权利要求22所述的方法，其中，所述光学系统包括物镜，其中检测来自所述第一基底的光信号包括相对于彼此移动所述物镜和所述第一基底，其中检测来自所述第二基底的光信号包括相对于彼此移动所述物镜和所述第二基底，其中所述光学系统沿着第一成像区检测来自所述第一基底的光信号，所述光学系统沿着第二成像区检测来自所述第二基底的光信号，所述第一成像区和第二成像区的大小不同，其中所述第一成像方案和第二成像方案包括沿着不同路径分别相对于所述第一基底和第二基底自动移动所述物镜。25.如权利要求22所述的方法，其中，所述第二载体组件包括保持机构，所述保持机构包括可移动基准块，所述方法还包括按压所述基准块，将所述第二基底定位在所述第二载体组件上，以及释放所述基准块，所述基准块与所述第二基底接合以将所述第二基底保持在所述第二载体组件上，其中所述基准块不相对于所述第一载体组件保持所述第一基底。26.如权利要求22所述的方法，其中，所述第一基底和第二基底具有不同的厚度并分别具有第一基底表面和第二基底表面，其中检测来自所述第一基底和第二基底的光信号包括分别检测来自所述第一基底表面和第二基底表面的光信号，所述第一基底表面和第二基底表面处于公共平面或偏移100微米或更小。27.如权利要求26所述的方法，其中，所述第二基底包括特征的微阵列，以及检测来自所述第二基底的光信号包括捕获所述特征的微阵列的重叠部分的一系列图像，所述特征中的每一个都具有固定于其的指定探针分子，所述微阵列具有附着于其的目标分析物；所述方法还包括：分析所述图像中的与相应特征相关联的光强度并确定所述图像的数据表示，所述数据表示具有基于所述微阵列的相应特征的数据特征的相应子阵列，所述数据特征中的每一个具有相对于其他数据特征的对应位置和基于所述光强度中的一个或更多个的信号值；以及基于相邻图像的所述数据表示的所述数据特征的所述信号值的比较来组合所述相邻图像的所述数据表示，从而生成所述微阵列的数据表示；分析所述微阵列的数据表示以确定样品的性质或特性。28.如权利要求22所述的方法，其中，所述第一基底是流动池。29.如权利要求23所述的方法，其中，所述流动池包括在所述流动池的入口和出口之间延伸的流动通道，所述入口和出口流体地耦合到歧管以用于使液体流动通过所述流动通道。30.如权利要求23所述的方法，其中，所述流动池包括在所述流动池的相应入口和出口之间延伸的多个流动通道，所述入口和出口流体地耦合到歧管以用于使液体流动通过所述流动通道。31.如权利要求30所述的方法，其中，所述流动通道彼此平行地延伸通过所述成像区。32.如权利要求22所述的方法，还包括重复地使试剂流动通过所述流动池以进行边...
【专利技术属性】
技术研发人员：史蒂芬·罗林斯，文卡特施·迈索尔·纳加拉贾拉奥，洪明强，尼廷·阿德帕，
申请(专利权)人：伊鲁米那股份有限公司，伊鲁米纳剑桥有限公司，
类型：发明
国别省市：美国,US
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