从微生物组水平上进行生物正交聚糖标记的方法及应用技术

本发明专利技术提供了一种从微生物组水平上进行生物正交聚糖标记的方法及应用。该方法包括将微生物菌群置于添加有第一探针的培养基上进行培养，得到被第一探针标记的微生物菌群，第一探针为一种或多种非天然糖；将被第一探针标记的微生物菌群与第二探针进行生物正交反应，得到被第二探针标记的微生物菌群；第二探针为能够与第一探针进行生物正交反应的化学标记物。该方法能够实现快速、高通量地筛查多种能够被非天然糖所代谢标记的细菌，并且能够确定不同细菌所能够被代谢标记的非天然糖的具体种类，也可以为特定微生物组的体内成像提供可能，同时为探究难以单独培养的细菌中含聚糖结构的大分子的生物学功能提供有力的研究工具。

Methods and applications of biorthorhombic glycans from microbial group level

The present invention provides a method and application of labeling bioorthogonal chitosan from a microbial group level. The method includes the microbial flora in the culture medium added with the first probe on the training, get the first probe labeled bacteria, the first probe into one or more non natural sugar; will be the first probe labeled bacteria and second probes is biological reaction, obtained by second probe labeling microbial flora; second probe as a chemical marker to bioorthogonal reaction with the first probes. This method can realize rapid and high-throughput screening can be a variety of non natural sugar metabolic labeling of bacteria, and to determine the different bacteria can be metabolically labeled non natural sugar specific types of in vivo imaging can also provide specific microbial groups may also provide a powerful research tool for exploring the biological function of macromolecules the chitosan structure containing difficult to separate bacteria in the.

【技术实现步骤摘要】
从微生物组水平上进行生物正交聚糖标记的方法及应用
本专利技术涉及化学生物学领域，具体而言，涉及一种从微生物组水平上进行生物正交聚糖标记的方法及应用。
技术介绍
以化学生物学方法为切入点，通过在聚糖的生物合成过程中引入含有炔基或者叠氮等生物正交基团的前体单糖类似物(非天然糖)，达到标记细胞聚糖结构的目的。通过对非天然糖探针的设计，使它们可以进入细胞的糖生物合成机制，通过细胞代谢，最终被表达在细胞表面含聚糖结构上。最后通过生物正交反应(bioorthogonalreaction)可以在活细胞条件下引入探针分子，如荧光探针，生物素探针等。在细菌中也已有广泛的生物正交聚糖标记的报道，在几个有代表性的研究中，含有生物正交基团的不同非天然糖探针分别被代谢表达到了细菌的脂多糖、糖蛋白、糖脂等含聚糖结构上。通过在细菌中引入叠氮等生物正交基团，可以对一些常规培养难以检出的病原菌进行快速鉴定；也可通过在免疫刺激剂上引入端炔并偶联到含有叠氮的细菌表面，以提高免疫系统对这些细菌的特异性识别与杀伤。作为原核生物，细菌中也和真核生物一样存在众多的糖蛋白表达，但由于技术手段的限制，与真核系统相比，到目前为止被鉴定本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种从微生物组水平上进行生物正交聚糖标记的方法，其特征在于，所述方法包括：将微生物菌群置于添加有第一探针的培养基上进行培养，得到被所述第一探针标记的微生物菌群，所述第一探针为一种或多种非天然糖；将被所述第一探针标记的微生物菌群与第二探针进行生物正交反应，得到被第二探针所标记的微生物菌群；所述第二探针为能够与所述第一探针进行生物正交反应的化学标记物。

【技术特征摘要】
1.一种从微生物组水平上进行生物正交聚糖标记的方法，其特征在于，所述方法包括：将微生物菌群置于添加有第一探针的培养基上进行培养，得到被所述第一探针标记的微生物菌群，所述第一探针为一种或多种非天然糖；将被所述第一探针标记的微生物菌群与第二探针进行生物正交反应，得到被第二探针所标记的微生物菌群；所述第二探针为能够与所述第一探针进行生物正交反应的化学标记物。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，在得到被所述第二探针标记的微生物菌群之后，所述方法还包括：从被所述第二探针标记的微生物菌群中分选出带有阳性标记的细菌。3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述分选的方法包括流式细胞仪细胞分选法。4.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，在分选出所述带有阳性标记的细菌之后，所述方法还包括：对所述带有阳性标记的细菌进行种类鉴定；和/或对所述带有阳性标记的细菌中的未知糖蛋白进行分离和鉴定。5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，通过检测16SrDNA对所述带有阳性标记的细菌进行种类鉴定。6.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述非天然糖为含有生物正交基团的聚糖生物合成过程中的前体单糖类似物，所述生物正交基团选自含炔基、叠氮、端烯、甲基环丙烯中的任意一种；优选所述非天然糖为具有如下任一种结构的非天然糖：其中，以及中的任意一种；更优选地，所述非天然糖选自如下任意一种：7.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述第二探针为能够所述与第一探针进行生物正交反应的荧光基团、生物素、FLAG肽标签、His肽标签、Avi肽标签、Calm...

【专利技术属性】
技术研发人员：陈兴，王炜，
申请(专利权)人：北京大学，
类型：发明
国别省市：北京,11