林麝四碱基微卫星遗传标记位点及其筛选方法技术

本发明专利技术提供了林麝四碱基微卫星遗传标记位点及其筛选方法，具体涉及林麝基因组多态性四碱基微卫星遗传标记的筛选方法及17个中高度多态性四碱基微卫星标记特征。本发明专利技术使用生物信息学方法搜索林麝全基因组中四碱基微卫星序列，设计引物，经过引物PCR条件优化、多色荧光标记、基因分型扫描等步骤，筛选得到17个中高度多态性四碱基微卫星遗传标记位点。具有实验快捷，操作简便，成功率高，节约成本的优点。

【技术实现步骤摘要】
林麝四碱基微卫星遗传标记位点及其筛选方法
本专利技术属于生物技术和遗传学领域，尤其涉及林麝四碱基微卫星遗传标记位点及其筛选方法。
技术介绍
林麝(Moschusberezovskii)隶属于偶蹄目，麝科麝属。成体雄麝香腺囊分泌的麝香具有较高的经济价值和药用价值。在巨大经济利益驱动下，野外乱捕滥猎猖獗，加之其栖息地不断遭到破坏，林麝种群数量急剧下降，现存麝类已经濒危。为了有效保护林麝，海内外做出了不懈努力，在积极保护野生林麝的同时鼓励林麝的人工养殖，圈养麝类曾在20世纪80年代达到3000只之多。虽然林麝的人工饲养取得了可喜成果，但也一直存在着不可忽略的缺陷如近亲繁殖，野生与圈养种群之间缺乏基因交流，饲养管理粗放等。再者，对林麝的保护不只是局限在增长其种群数量，精确估计林麝野外种群数量，比较、评估野外与圈养种群遗传多样性，基因交流分析等工作的深入才是林麝得到有效的长期的保护的前提和基础，他们为及时评估反馈保护工作进度与成效，制定生态保护策略等提供系统的理论指导。因此，应用遗传标记对林麝进行以上生态保护研究已经刻不容缓。微卫星标记具有多态性高，共显性遗传，在基因组中广泛分布，重复性和稳定本文档来自技高网...

【技术保护点】
林麝基因组多态性四碱基微卫星遗传标记位点，其特征在于：应用生物信息学方法，使用MSDBv2.4软件搜索林麝全基因组四碱基微卫星序列，在此基础上筛选出适合设计引物的四碱基原始序列，利用软件Primer3对选定进行引物设计，然后进行引物条件优化，筛选出17个具有中高度多态性的四碱基微卫星位点。

【技术特征摘要】
1.林麝基因组多态性四碱基微卫星遗传标记位点，其特征在于：应用生物信息学方法，使用MSDBv2.4软件搜索林麝全基因组四碱基微卫星序列，在此基础上筛选出适合设计引物的四碱基原始序列，利用软件Primer3对选定进行引物设计，然后进行引物条件优化，筛选出17个具有中高度多态性的四碱基微卫星位点。2.林麝基因组多态性四碱基微卫星遗传标记位点引物对，所述引物对选自：SEQIDNO:1+SEQIDNO:2，SEQIDNO:3+SEQIDNO:4，SEQIDNO:5+SEQIDNO:6，SEQIDNO:7+SEQIDNO:8，SEQIDNO:9+SEQIDNO:10，SEQIDNO:11+SEQIDNO:12，SEQIDNO:13+SEQIDNO:14，SEQIDNO:15+SEQIDNO:16，SEQIDNO:17+SEQIDNO:18，EQIDNO:19+SEQIDNO:20，SEQIDNO:21+SEQIDNO:22，SEQIDNO:23+SEQIDNO:24，SEQIDNO:25+SEQIDNO:26，SEQIDNO:27+SEQIDNO:28，SEQIDNO:29+SEQIDNO:30，SEQIDNO:31+SEQIDNO:32，SEQIDNO:33+SEQIDNO:34。3.根据权利要求1所述的林麝基因组多态性四碱基微卫星遗传标记的筛选方法，其特征在于：该方法包括以下步骤：a.标本获取和DNA制备；b.使用MSDBv2.4软件，在默认搜索条件下搜索获得林麝基因组四碱基微卫星序列；c.筛选出适合设计引物的四碱基原始序列；d.利用软件Primer3对选定序列进行引物设计；e.微卫星引物条件筛选；f.引物荧光标记、基因分型及数据分析。4.根据权利要求3所述的林麝基因组多态性四碱基微卫星遗传标记的筛选方法，其特征在于：所述的步骤c中，适合设计引物的四碱基原始序列筛选原则为：1)微卫星重复拷贝数不小于7，且不大于20；2)选取重复单元构成和分布是完美型的四碱基微卫星序列；3)选取侧翼序列完整的微卫星序列。5.根据权利要求3所述的林麝基因组多态性四碱基微卫星遗传标记的筛选方法，其特征在于：...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘越飞，岳碧松，耿介，
申请(专利权)人：四川好医生攀西药业有限责任公司，
类型：发明
国别省市：四川,51