一种人肿瘤相关的甲基化位点及其筛选方法和用途技术

本发明专利技术提供的人肿瘤相关的甲基化位点及其筛选方法和用途，所述甲基化位点选自人第18号染色体、人第3号染色体和人第2号染色体上的至少一个甲基化位点，由BMI引起的上述的染色体上的甲基化位点发生改变与人子宫内膜癌相关，可以通过检测上述染色体上的甲基化位点改变进行人肿瘤的预后诊断，所述人肿瘤相关的甲基化位点可以作为肿瘤潜在的预后诊断标志物，尤其是作为子宫内膜癌的预后诊断标志物。

Human tumor associated methylation site and screening method and use thereof

The invention provides a human tumor associated methylated sites screening method and use thereof, at least one methyl methylation sites from human chromosome eighteenth, chromosome third and chromosome second on the site, methylation sites caused by the BMI of the chromosome changes and human endometrium cancer, can change the prognosis of tumor by methylation detection of the chromosome, the methylation of the tumor can be used as a potential marker of tumor prognosis, especially as a prognostic marker for diagnosis of endometrial carcinoma.

【技术实现步骤摘要】
一种人肿瘤相关的甲基化位点及其筛选方法和用途
本专利技术属于子宫内膜癌诊断以及检测
，具体涉及一种人肿瘤相关的甲基化位点及其筛选方法和用途。
技术介绍
子宫内膜癌是发生于子宫内膜的一组上皮性恶性肿瘤，好发于围绝经期和绝经后女性。子宫内膜癌是最常见的女性生殖系统肿瘤之一，每年有接近20万的新发病例，是导致死亡的第三位常见妇科恶性肿瘤。由于致病因素复杂、发病机制不明，对子宫内膜癌的早期诊断和检测非常困难，往往发现患有子宫内膜癌时已经是中晚期，导致患者错失治疗子宫内膜癌的最佳良机。近年来有研究表明，DNA甲基化可作为肿瘤等早期诊断的生物标记物和预后评估指标，对肿瘤的筛查和风险评估、早期诊断、分期分型、预后判断及治疗监测都具有重要的意义。所谓DNA甲基化是一种表观遗传修饰，它是由DNA甲基转移酶(DNAmethyl-transferase，Dnmt)催化S-腺苷甲硫氨酸作为甲基供体，将胞嘧啶转变为5-甲基胞嘧啶(mC)的一种反应，在真核生物DNA中，5-甲基胞嘧啶是唯一存在的化学性修饰碱基。CG二核苷酸是最主要的甲基化位点，它在基因组中呈不均匀分布，存在高甲基化、低甲基化和非甲基化的区本文档来自技高网...

【技术保护点】
人肿瘤相关的甲基化位点，其特征在于，所述的甲基化位点选自人第18号染色体、人第3号染色体和人第2号染色体上的至少一个甲基化位点。

【技术特征摘要】
1.人肿瘤相关的甲基化位点，其特征在于，所述的甲基化位点选自人第18号染色体、人第3号染色体和人第2号染色体上的至少一个甲基化位点。2.根据权利要求1所述的人肿瘤相关的甲基化位点，其特征在于，所述的甲基化位点所在的核苷酸序列选自如SEQIDNO.1所示的核苷酸序列、SEQIDNO.2所示的核苷酸序列和SEQIDNO.3所示的核苷酸序列。3.根据权利要求1或2所述的人肿瘤相关的甲基化位点，其特征在于，所述的甲基化位点选自cg12645852、cg09621472和cg14044785中的至少一个。4.人肿瘤相关的甲基化位点的筛选方法，其特征在于，包括如下步骤：(1)获取肿瘤样本，选定身体质量指数BMI值25kg/cm2作为对所述肿瘤样本分组的的阈值，依据所述阀值将所述肿瘤样本分成对照BMI组和高水平BMI组；(2)采用limma软件包从步骤(1)的两组中筛选出差异甲基化位点；(3)对步骤(1)获取的肿瘤样本，采用一般线性回归模型方法对甲基化位点和BMI进行关联分析，筛选得到与BMI相关的甲基化位点；(4)选择步骤(2)筛选的甲基化位点与步骤(3)中筛选的甲基化位点交集的甲基化位点作为候选甲基化位点，通过秩和检验和生存分析，获得所述的人肿瘤相关的甲基化位点。5.根据权利要求4所述的人肿瘤相关的甲基化位点的筛选方法，其特征在于，包括如下步骤：(1)获取子宫内膜癌样本，取BMI为25kg/m2作为所述子宫内膜癌样本分组的阈值，将BMI小于25kg/m2的子宫内膜癌样本作为对照BMI组，BMI大于或等于25kg/m2的子宫内膜癌样本作为高水平BMI组；(2)采用limma软件包校正步骤(1)中两组的年龄、种族和肿瘤取样点三个混杂因素，通过多重假设检验，以应用错误发现率FDR小于0.05为具有...

【专利技术属性】
技术研发人员：高山，顾殷敏，张卫红，
申请(专利权)人：中国科学院苏州生物医学工程技术研究所，英威福赛生物技术有限公司，
类型：发明
国别省市：江苏,32