用于OX40激动剂治疗的功效预测和评估的方法和生物标志物技术

本公开文本提供用于预测具有癌症的受试者对OX40激动剂治疗的响应性的方法，其通过测量一种或多种生物标志物的表达水平来进行。还提供的是用于监测OX40激动剂治疗的药效学活性或对OX40激动剂治疗的响应性的方法，其通过测量一种或多种生物标志物的表达水平来进行。进一步提供的是与之相关的用于在受试者中治疗癌症或延迟癌症进展的方法，其通过对受试者施用有效量的OX40激动剂来进行。本文中描述了用于所有此类方法的具体生物标志物。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于OX40激动剂治疗的功效预测和评估的方法和生物标志物对相关申请的交叉引用本申请要求2014年11月3日提交的流水号62/074,612的美国临时申请的优先权，通过援引将其完整收入本文。ASCII文本文件上的序列表的提交通过援引将ASCII文本文件上的下述提交的内容完整收入本文：计算机可读形式(CRF)的序列表(文件名称：146392028940SEQLIST.TXT，记录日期：2015年11月2日，大小：185KB)。专利
本公开文本涉及预测或监测对OX40激动剂治疗的响应性的方法，以及与之相关的治疗癌症的方法。专利技术背景OX40(也称作CD34，TNFRSF4和ACT35)是肿瘤坏死因子受体超家族的一个成员。OX40不在幼稚T细胞上组成性表达，但是在T细胞受体(TCR)卷入后诱导。OX40的配体OX40L主要在抗原呈递细胞上表达。OX40由活化后的CD4+T细胞，活化后的CD8+T细胞，记忆T细胞，和调节T细胞高表达。OX40信号传导能给CD4和CD8T细胞提供共刺激信号，引起增强的细胞增殖，存活，效应器功能和迁移。OX40信号传导还增强记忆T细胞发育和功能。调节T细胞(本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种用于预测具有癌症的受试者对OX40激动剂治疗的响应性的方法，其包括：(a)测量自该受试者获得的包含白细胞的样品中一种或多种标志物基因的表达水平，其中所述一种或多种标志物基因选自由CD8a，CD8b，H2‑d，CTLA4，CD64，CXCL9，IFNg，IDO1，GZMA，GZMB，PRF1，PDCA1，KLRK1，PTPRC，CXCL1，ITGAM，和IL7R组成的组；并(b)基于与参照相比自该受试者获得的该样品中所述一种或多种标志物基因的表达水平将该受试者归类为响应性或非响应性受试者，其中该一种或多种标志物基因的表达水平与该参照相比升高指示该受试者可能是对OX40激动剂治疗响应性的。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2014.11.03 US 62/074,6121.一种用于预测具有癌症的受试者对OX40激动剂治疗的响应性的方法，其包括：(a)测量自该受试者获得的包含白细胞的样品中一种或多种标志物基因的表达水平，其中所述一种或多种标志物基因选自由CD8a，CD8b，H2-d，CTLA4，CD64，CXCL9，IFNg，IDO1，GZMA，GZMB，PRF1，PDCA1，KLRK1，PTPRC，CXCL1，ITGAM，和IL7R组成的组；并(b)基于与参照相比自该受试者获得的该样品中所述一种或多种标志物基因的表达水平将该受试者归类为响应性或非响应性受试者，其中该一种或多种标志物基因的表达水平与该参照相比升高指示该受试者可能是对OX40激动剂治疗响应性的。2.一种用于在受试者中治疗癌症或延迟癌症进展的方法，其包括：(a)测量自该受试者获得的包含白细胞的样品中一种或多种标志物基因的表达水平，其中所述一种或多种标志物基因选自由CD8a，CD8b，H2-d，CTLA4，CD64，CXCL9，IFNg，IDO1，GZMA，GZMB，PRF1，PDCA1，KLRK1，PTPRC，CXCL1，ITGAM，和IL7R组成的组；并(b)如果自该受试者获得的该样品中所述一种或多种标志物基因的表达水平高于参照的话，对该受试者施用有效量的OX40激动剂。3.一种用于在受试者中治疗癌症或延迟癌症进展的方法，其包括对该受试者施用有效量的OX40激动剂，其中自该受试者获得的包含白细胞的样品具有与参照相比升高的一种或多种标志物基因的表达，所述一种或多种标志物基因选自由CD8a，CD8b，H2-d，CTLA4，CD64，CXCL9，IFNg，IDO1，GZMA，GZMB，PRF1，PDCA1，KLRK1，PTPRC，CXCL1，ITGAM，和IL7R组成的组。4.权利要求1-3任一项的方法，其中所述一种或多种标志物基因选自由CD8a，CD8b，IFNg，GZMA，GZMB，PRF1，和PDCA1组成的组。5.权利要求1-3任一项的方法，其中所述一种或多种标志物基因选自由H2-d，CTLA4，CXCL9，PTPRC，IL7R，KLRK1，和CXCL1组成的组。6.权利要求1-3任一项的方法，其中所述一种或多种标志物基因选自由CD64，IDO1，和ITGAM组成的组。7.一种用于预测具有癌症的受试者对OX40激动剂治疗的响应性的方法，其包括：(a)测量自该受试者获得的包含白细胞的样品中一种或多种标志物基因的表达水平，其中所述一种或多种标志物基因选自由CSF2，CCL22，EPCAM，GATA3，IL13，和VTCN1组成的组；并(b)基于与参照相比自该受试者获得的该样品中所述一种或多种标志物基因的表达水平将该受试者归类为响应性或非响应性受试者，其中该一种或多种标志物基因的表达水平与该参照相比降低指示该受试者可能是对OX40激动剂治疗响应性的。8.一种用于在受试者中治疗癌症或延迟癌症进展的方法，其包括：(a)测量自该受试者获得的包含白细胞的样品中一种或多种标志物基因的表达水平，其中所述一种或多种标志物基因选自由CSF2，CCL22，EPCAM，GATA3，IL13，和VTCN1组成的组；并(b)如果自该受试者获得的该样品中所述一种或多种标志物基因的表达水平低于参照的话，对该受试者施用有效量的OX40激动剂。9.一种用于在受试者中治疗癌症或延迟癌症进展的方法，其包括对该受试者施用有效量的OX40激动剂，其中自该受试者获得的包含白细胞的样品具有与参照相比降低的一种或多种标志物基因的表达，所述一种或多种标志物基因选自由CSF2，CCL22，EPCAM，GATA3，IL13，和VTCN1组成的组。10.一种用于监测OX40激动剂治疗的药效学活性的方法，其包括：(a)测量自该受试者获得的包含白细胞的样品中一种或多种标志物基因的表达水平，其中该受试者已经用OX40激动剂治疗，且其中所述一种或多种标志物基因选自由ARG1，CCL2，CCL22，CCL5，CCR5，CD226，CD27，CD274，CD28，CD3E，CD40，CD8A，CD8b，CXCL10，CXCL9，EOMES，FasL，Fcgr1/CD64，FOXP3，GZMA，GZMB，HAVCR2，ICAM1，IDO1，IFNg，IL10，IL12A(TDO2)，IL13，IL2，IL7R，ITGAM，KLRK1，LAG3，MAP4K1，MS4A1，PDCD1，PDCD1LG2，PRF1，PTPRC，TNF，TNFRSF14，TNFRSF9，和TNFSF4组成的组；并(b)基于与参照相比自该受试者获得的该样品中所述一种或多种标志物基因的表达水平确定该治疗为展现药效学活性，其中该一种或多种标志物基因的表达水平与该参照相比升高指示对该OX40激动剂治疗的药效学活性。11.权利要求10的方法，其中所述一种或多种标志物基因选自由C...

【专利技术属性】
技术研发人员：M·侯赛尼，
申请(专利权)人：豪夫迈·罗氏有限公司，
类型：发明
国别省市：瑞士,CH