水稻抗稻瘟病Pi9基因的共显性功能分子标记Pi9InDel2及其应用制造技术

本发明专利技术涉及农作物分子遗传育种学领域，具体公开了水稻抗稻瘟病Pi9基因的共显性功能分子标记Pi9InDel2及其应用。所述水稻抗稻瘟病Pi9基因的共显性功能分子标记Pi9InDel2，由如SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示的引物扩增得到。利用Pi9InDel2标记引物，对不同遗传背景水稻亲本基因组DNA、及其与Pi9基因供体亲本的杂交后代基因组DNA进行PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳检测，鉴定不同水稻亲本及杂交后代中是否含有Pi9功能基因，以及杂交育种选育后代中的Pi9基因是否纯合，并通过分子标记辅助选择育种技术培育含Pi9基因的抗稻瘟病水稻新种质或品种。

【技术实现步骤摘要】
水稻抗稻瘟病Pi9基因的共显性功能分子标记Pi9InDel2及其应用
本专利技术涉及农作物分子遗传育种学领域，具体地说，涉及水稻抗稻瘟病Pi9基因的共显性功能分子标记Pi9InDel2及其应用。
技术介绍
抗稻瘟病基因Pi9是第一个被克隆水稻广谱抗稻瘟病基因(Qu等2006，Genetics，172(3)：1901-1914)。Pi9基因对来自13个国家的43个稻瘟菌生理小种都表现高抗(Liu等2002，Mol.Genet.Genomics,267(4):472-480)。Pi9基因全长编码序列为8589bp(不含启动子)，含2个内含子和3个外显子(Qu等2006)，如序列SEQIDNO.1所示。Pi9基因的克隆为设计开发基因内部功能分子标记，并应用于水稻抗稻瘟病分子标记辅助选择育种培育抗病水稻新品种奠定了基础。目前，已报道的Pi9基因的分子标记辅助育种方法主要为：一是利用Pi9基因连锁标记进行选择(倪大虎等2005，分子植物育种3:329-334；殷得所等2011，中国水稻科学25(1)：25-30)；二是利用Pi9基因内显性功能分子标记(文婷等2012，湖南农业大学学报38:26本文档来自技高网...

【技术保护点】
水稻抗稻瘟病Pi9基因的共显性功能分子标记Pi9InDel2，其特征在于，所述分子标记由如SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4所示的引物扩增得到。

【技术特征摘要】
1.水稻抗稻瘟病Pi9基因的共显性功能分子标记Pi9InDel2，其特征在于，所述分子标记由如SEQIDNO.3和SEQIDNO.4所示的引物扩增得到。2.权利要求1所述的分子标记在检测Pi9基因方面的应用，其特征在于，利用SEQIDNO.3和SEQIDNO.4所示的引物对待测目标进行PCR扩增，若扩增后得到长度为306bp的片段，则待测目标含Pi9基因；若扩增后得到长度为407bp的片段，则待测目标不含Pi9基因。3.权利要求1所述的分子标记在选育杂交育种后代中Pi9基因纯合体方面的应用，其特征在于，利用SEQIDNO.3和SEQIDNO.4所示的引物对待测目标进行PCR扩增，若扩增后仅得到长度为306bp的片段，则待测目标为含有Pi9基因的纯合子；若扩增后仅得到长度为407bp的片段，则待测目标为不含Pi9基因的纯合子；若扩增后得到长度为306bp和407bp的两个片段，则待测目标为含有Pi9基因的杂合子。4.一种引物组合，其特征在于，所述引物组合包括SEQIDNO.3和SEQ...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘金灵，李永聪，刘雄伦，肖应辉，周小龙，匡博文，罗秋红，
申请(专利权)人：湖南农业大学，
类型：发明
国别省市：湖南,43