用于荧光数据校正的方法技术

本发明专利技术涉及用于数据校正的(计算机实现的)方法，尤其是荧光数据、相关系统、软件、图形用户界面及其使用，更具体而言，本发明专利技术描述了一种用于在相同的依赖于时间的区域下调整来自在不同时间点得到的多个测量结果的部分的方法，其中所述调整在不同时间点被执行以便获得计算出的测量结果，所述测量结果可以被比较，如同它们是在相同时间点(并且因而在相同环境下)得到的。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于荧光数据校正的方法
本专利技术涉及用于数据校正的(计算机实现的)方法，尤其是荧光数据、相关系统、软件、图形用户界面及其使用。
技术介绍
尽管存在将(计算机实现的)方法用于数据校正的概念，但是这些方法主要集成在测量系统中并且因此它们不是非常精确或灵活。
技术实现思路
本专利技术的目的是提供用于数据校正、相关系统、软件、图形用户界面及其用途的(计算机实现的)方法，它们是更加精确和/或灵活的，并且可以或者无法被独立使用，其尤其适合于荧光数据。本专利技术包括用于数据校正、相关系统、软件、图形用户界面及其用途的各种(计算机实现的)子方法，尤其适合于荧光数据，本专利技术还提供了这些子方法的优选顺序。底层软件可被用作独立的或者可被集成在测量装备中，并且因此其可在处理器上运行，其可被集成在测量装备中，或者其可被分开(即部分地在测量装备上，部分在独立计算机上)。底层软件还可以包括基本软件和特定于客户端和/或特定于应用的部分。本创造性贡献涉及认识到从测量装备得到的数据即使在用集成在测量装备中的软件处理该数据之后也偏离理想上可被预期的数据。甚至更多地，所述偏离可由共集成(co-integrated)软件造成，并且测量装备的缺陷的仔细校正因而是必需的。该校正应当优选地在各种步骤中发生，更甚至，优选地通过按照特定次序为这些步骤排序来发生。另一创造性贡献是认识到这些校正是特定于客户端的和/或特定于应用的和/或特定于测量装备的，并且因此提供足够的选项来由此进行处理，例如通过提供使用多个数据格式、校准数据和/或其他设定参数的可能性。然而，本专利技术不仅如此注重于数据的校正本身，而且还旨在改善将数据用于对目标分子的检测、对感染的更特定检测，其通常经由峰值检测完成。在数据的校正之后的数据分析必须因而优选地集成在软件中并且还具有所需参数和验证方法。本专利技术的各种方面在权利要求中得到描述。附图说明图1示出了本专利技术的实施例的流程图。图2示出了荧光频谱以及时移的结果。图3示出了荧光频谱以及颜色补偿的结果。图4示出了基准解链曲线。图5示出了没有补偿的解链曲线。图6示出了具有补偿的解链曲线。图7示出了没有减去背景信号的数据。图8示出了减去背景信号之后的数据。图9(A和B)示出了使用移动平均的效果。图10例示出数据点丢失的问题。图11示出了方法的流程图。图12示出了验证方法的流程图。图13例示出峰值检测。图14例示出肩部感染。图15例示出多重感染。图16例示出用于数据分析的方法。图17例示出在各种区域中3值分数(3-value-score)的使用。图18例示出时移的方法。具体实施方式关于本专利技术的编号陈述陈述1.一种用于调整来自多个参数(600，610，620)的至少第一参数(600)的测量结果(630，660，670)的子集的方法，所述多个参数各自经受相同的依赖于时间的环境，其中测量结果是在不同时间点(700，703，706)得到的并且其中所述调整产生可与至少第二参数(620)的对应测量结果(650，680，690)相比较的计算出的值(630*，660*，670*)，相当于它们是在第二参数(620)的对应测量结果被确定时的时间(702，705，708)得到的，其中该方法包括以下步骤：(1)计算针对第一参数(600)的各自在不同时间(700，703，706)得到的一些测量结果(630，660，670)；(2)确定当第二参数(620)的对应测量结果(650，680，690)被确定时的时间点(702，705，708)；以及(3)基于第一参数(630，660，670)的测量结果确定在第二参数(620)的时间点(702，705，708)处代表第一参数(600)的计算出的值(630*，660*，670*)。陈述2.根据陈述1所述的方法，其中，测量结果是实时PCR实验的荧光数据，并且依赖于时间的环境由在PCR反应期间的温度来反映。陈述3.根据陈述1或2所述的方法，其中，第一参数的计算出的值是通过对第一参数的测量结果关于第二参数的时间点进行插值而确定的。陈述4.一种用于调整样本的荧光测量结果(300，310，320)的方法，其中测量结果是在至少两个部分重叠的波长区域中得到的，该方法包括以下步骤：(1)确定荧光测量结果，(2)确定指示所述重叠的信息，(3)基于来自步骤(2)的信息通过使用数学乘法运算来调整荧光测量结果，以减少所述重叠的影响。陈述5.根据陈述4所述的方法，其中，调整是使得不存在过度补偿。陈述6.一种用于调整荧光测量结果的方法，包括执行根据陈述1至3中的一个所述的方法，接着是执行根据陈述4至5所述的方法。陈述7.根据陈述1至6中的一个所述的方法，还包括以下步骤：确定针对参数中的至少一个参数的背景信号的存在；以及针对所述背景信号校正(减去)通过陈述1至6所述的方法得到的经调整的测量结果。陈述8.根据陈述1至7所述的方法，还包括优选地通过使用移动平均使通过陈述1至7所述的方法得到的经调整的测量结果变得平坦的步骤。陈述9.一种用于确定样本中的一个或多个目标分子的存在的方法，包括：(1)对从样本得到的测量结果执行前述陈述中的一个的方法以取得计算出的值，(2)基于来自步骤(1)的计算出的值来确定目标分子的存在与否。陈述10.根据权利要求9所述的方法，其中，在步骤(2)中，基于来自步骤(1)的计算出的值来确定目标分子的存在与否是通过确定最大值以及将针对该计算的可靠性的3值分数考虑在内来执行的。陈述11.根据陈述9或10所述的方法，还包括：(3)通过对在指定的最大值附近的前述经调整的值执行对称分析来描述目标分子的特性。陈述12.一种计算机程序产品，其在用于执行根据陈述1至11中的一个所述的方法的步骤之一的计算的处理器上活动。陈述13.一种机器可读存储介质，其存储先前发现结果的计算机程序产品。陈述14.根据陈述1至12所述的方法的使用。陈述15.一种图形用户界面，其适合于使用根据陈述1至12所述的方法。在一个具体实施例中，本专利技术还包括如本文所定义的方法，其中上面提到的步骤借助于计算机通过加载和/或计算测量/时间点来执行。这里应当特别注意到，在该具体实施例中，时间点实际上被考虑在内，而现有技术未预见任何时间校正，并且因而不承认时移对目标分子的检测的影响，并且更具体地是对待分析的样本中的感染的检测的影响。具体而言，通过与粗数据一起显式地读取时间点或者通过使用测量设备的特征(例如，其对环境因素即温度做出的改变)从而隐式地确定这些时间点来考虑到时间点，并且将这些时间点用于未来的计算以改善对目标分子的检测，并且更具体地是对待分析的样本中的感染的检测。在方法中一个接一个地执行不同步骤的情况下，使用从先前步骤接收到的计算出的值来执行每一个步骤。详细说明本专利技术包括可以在软件中实现的、特别是用于对在生物技术应用中使用的数据(诸如PCR分析中的荧光)进行计算、校正和处理的方法，因此，其旨在用于检测目标分子更具体地是检测在待分析的样本中的感染的应用。以下表示可能的实施例，然而，本专利技术不仅限于该实施例。在图2和3中，x轴(10)表示测量光的波长并且y轴表示测量光(荧光)的量。在图4至10(这里仅在图4中示出)、图13至15和图17中，x轴(30)表示温度(指示测量样本的环境)并且y轴(40)表示经处理的本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种用于调整来自多个参数(600，610，620)的至少第一参数(600)的测量结果(630，660，670)的子集的方法，所述多个参数各自经受相同的依赖于时间的环境，其中测量结果是在不同时间点(700，703，706)得到的并且其中所述调整产生能够与至少第二参数(620)的对应测量结果(650，680，690)相比较的计算出的值(630*，660*，670*)，相当于它们是在第二参数(620)的对应测量结果被确定时的时间(702，705，708)得到的，其中该方法包括以下步骤：(1)确定针对第一参数(600)的各自在不同时间(700，703，706)得到的一些测量结果(630，660，670)；(2)确定当第二参数(620)的对应测量结果(650，680，690)被确定时的时间点(702，705，708)；以及(3)基于第一参数(630，660，670)的测量结果确定在第二参数(620)的时间点(702，705，708)处代表第一参数(600)的计算出的值(630*，660*，670*)，其中测量结果是实时PCR实验的荧光数据，并且依赖于时间的环境由在PCR反应期间的温度来指示。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2014.04.11 BE BE2014/02511.一种用于调整来自多个参数(600，610，620)的至少第一参数(600)的测量结果(630，660，670)的子集的方法，所述多个参数各自经受相同的依赖于时间的环境，其中测量结果是在不同时间点(700，703，706)得到的并且其中所述调整产生能够与至少第二参数(620)的对应测量结果(650，680，690)相比较的计算出的值(630*，660*，670*)，相当于它们是在第二参数(620)的对应测量结果被确定时的时间(702，705，708)得到的，其中该方法包括以下步骤：(1)确定针对第一参数(600)的各自在不同时间(700，703，706)得到的一些测量结果(630，660，670)；(2)确定当第二参数(620)的对应测量结果(650，680，690)被确定时的时间点(702，705，708)；以及(3)基于第一参数(630，660，670)的测量结果确定在第二参数(620)的时间点(702，705，708)处代表第一参数(600)的计算出的值(630*，660*，670*)，其中测量结果是实时PCR实验的荧光数据，并且依赖于时间的环境由在PCR反应期间的温度来指示。2.根据权利要求1所述的方法，其中，针对第一参数的计算出的值是通过对第一参数的测量结果关于第二参数的时间点进行插值而得到的。3.一种用于调整荧光测量结果的方法，包括根据权利要求1至2中的一个所述的方法，接着是用于调整样本的荧光测量结果(300，310，320)的方法，其中测量...

【专利技术属性】
技术研发人员：W·尤泰恩，M·雷詹斯，Y·A·奥佐格，
申请(专利权)人：乌根泰克股份有限公司，
类型：发明
国别省市：比利时,BE