The invention belongs to the field of molecular marker technology, and relates to application of a quinoa two state InDel molecular marker and molecular marker by the method of development, which corresponds to 38 sites of forward and reverse primers of allotetraploid quinoa genotype, can improve the accuracy of quinoa gene typing greatly reduced, the high molecular markers in quinoa genotype in the tape read error rate.
【技术实现步骤摘要】
藜麦二态性InDel分子标记及其开发方法与应用
本专利技术属于分子标记
，具体涉及一种藜麦二态性InDel分子标记及其开发方法与应用。
技术介绍
InDel(Insertion/Deletion)又称为插入缺失，通常是指相比于一个基因组，另一个基因组序列存在一定数量核苷酸的插入或缺失。根据基因组插入缺失位点设计可以扩增这些位点的引物就是InDel分子标记。该标记能够显示扩增序列的长度差异，具有稳定性高、共显性等特点，可以用于遗传图谱构建、遗传多样性分析、群体结构评价以及核心种质筛选等。由于基因组中存在较丰富的InDel变异，且InDel变异可以在基因内或基因调控区域发生，因此，InDel变异具有发展成为功能性分子标记的潜力。藜麦(ChenopodiumquinoaWilld.)，是原产于南美安第斯地区一年生双子叶草本植物，其在安第斯地区具有上千年的栽培历史，具有出色的耐干旱、耐盐碱的特性，是安第斯地区的主要食物来源。由于其种子营养均衡，已被联合国粮农组织认定为单体即可满足人体基本营养需求的唯一植物。藜麦市场需求逐年扩大，种植地已经扩展到欧美、日本、中国等地。...
【技术保护点】
一种藜麦二态性InDel分子标记，其特征在于：包括如下38个位点所对应的正向、反向引物：
【技术特征摘要】
1.一种藜麦二态性InDel分子标记，其特征在于：包括如下38个位点所对应的正向、反向引物：2.根据权利要求1所述的藜麦二态性InDel分子标记，其特征在于：所述分子标记对藜麦基因组DNA进行PCR扩增后，在纯合位点可以扩增出一条等位基因，在杂合位点可以扩增出两条等位基因。3.一种权利要求1所述的藜麦二态性InDel分子标记的开发方法，其特征在于，该方法包括以下步骤：(1)获取藜麦基因组序列信息；(2)利用mInDel软件对藜麦基因组序列进行预处理、组装、InDel分析、引物设计及评价；(3)筛选较好...
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。