疾病的快速辅助定位方法技术
Rapid auxiliary positioning method for diseases
The invention discloses a fast positioning method for diseases, including all patients suffering from the disease receiving phenotype described, and the construction of all patients receiving the phenotype described phenotype sets; get all diseases have described phenotypes in phenotype annotation in the database; searching corresponding each disease phenotype and the phenotype corresponding to each disease were constructed related disease phenotype set; similarity patients describe the phenotype associated with each set of disease phenotype sets; compared with the description set with all related phenotype disease phenotype set similarity, the similarity value is bigger, the probability of patients suffering from the disease the greater the corresponding similarity.
【技术实现步骤摘要】
疾病的快速辅助定位方法
本专利技术涉及临床诊断系统，具体涉及一种疾病的快速辅助定位方法。
技术介绍
在罕见疾病的临床诊断中,一个常见的问题便是如何根据患者的表型信息快速准确地分析出其罹患的具体的疾病类型。表型诊断就是通过比较患者表型和所有已知疾病记录的表型间的相似程度，跟患者越相似的疾病可能性越大，因此精确地计算记录的疾病表型和患者间的表型间的相似程度是成功诊断的关键。由于各种外界原因，比如患者间的遗传和环境等个体差异、临床医生的知识结构差异等，临床诊断时患者的表型描述不可能跟疾病的已知表述完全一致，在现实场景中，经常出现以下问题：1)数据不完整(只包括部分表型)；2)噪音(跟真实疾病无关的表型，即提供了错误的表型)；3)不准确描述(表型描述过于宽泛，不具有区分度)。
技术实现思路
针对现有技术中的上述不足，本专利技术提供的疾病的快速辅助定位方法解决了实际场景中表型数据不完备、带有噪音和描述不够准确引起疾病定位不准确的问题。为了达到上述专利技术目的，本专利技术采用的技术方案为：提供一种疾病的快速辅助定位方法，其包括：接收患者描述的罹患疾病的所有表型，并采用接收的所有表...
【技术保护点】
疾病的快速辅助定位方法，其特征在于，包括：接收患者描述的罹患疾病的所有表型，并采用接收的所有表型构建患者描述表型集；获取表型注释数据库中具有患者描述的表型的所有疾病；查找每种疾病所对应的表型，并采用每种疾病所对应的表型分别构建相关疾病表型集；计算患者描述表型集与每个相关疾病表型集的相似度：
【技术特征摘要】
1.疾病的快速辅助定位方法，其特征在于，包括：接收患者描述的罹患疾病的所有表型，并采用接收的所有表型构建患者描述表型集；获取表型注释数据库中具有患者描述的表型的所有疾病；查找每种疾病所对应的表型，并采用每种疾病所对应的表型分别构建相关疾病表型集；计算患者描述表型集与每个相关疾病表型集的相似度：其中，T1为患者描述表型集；T2为相关疾病表型集；sim(T1,T2)为集合T1与集合T2之间的相似度；t1和t2疾病所对应的两种不同的表型；sim(t1,t2)为表型t1和t2之间的相似度；比较患者描述表型集与所有相关疾病表型集的相似度，相似度值越大，则患者罹患当前相似度对应疾病的概率越大。2.根据权利要求1所述的疾病的快速辅助定位方法，其特征在于，所述表型t1和t2之间的相似度sim(t1,t2)的具体算法为：sim...
【专利技术属性】
技术研发人员：李其刚，赵科研，杨京忠，
申请(专利权)人：成都奇恩生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：四川,51
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