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一种脑胶质母细胞瘤患者生存期预测系统技术方案

技术编号:15691240 阅读:423 留言:0更新日期:2017-06-24 04:17
本发明专利技术公开了一种脑胶质母细胞瘤患者生存期预测系统,所述预测系统包括:输入模块、分析模块和输出模块,所述分析模块能够基于所述变量输入模块输入的变量建立生存概率列线图并计算总风险分值,所述总风险分值为卡氏功能评分、肿瘤切除程度、MGMT基因启动子甲基化状态、IDH基因状态和替莫唑胺治疗策略的风险分值的累加和;根据所述总风险分值计算脑胶质母细胞瘤患者生存期预测值;输出模块,所述输出模块用于输出脑胶质母细胞瘤患者生存期预测值。本公开所提出的脑胶质母细胞瘤患者生存期预测系统将临床上易获得的变量综合起来,输入所述五个变量即可快速准确的获得脑胶质母细胞瘤患者生存期的预测结果,节约了使用者的时间与精力。

A survival prediction system for patients with glioblastoma

The invention discloses a prediction system of glioblastoma patient survival, the prediction system includes an input module, analysis module and output module, the analysis module to the variable input module input variables based on the survival probability of the nomogram and calculate the total risk score, score, the total risk score for the card's function of the extent of tumor resection, the methylation status of MGMT gene, IDH gene and temozolomide treatment strategies of the cumulative risk score and total risk score; according to the calculation of glioblastoma patients survival prediction value; output module, the output module is used to predict the survival time of output glioblastoma patients value. This disclosure proposed glioblastoma survival prediction system will be easy to obtain clinical variables, the prediction results obtained the survival of patients with glioblastoma fast and accurate input of the five variables, saving time and energy users.

【技术实现步骤摘要】
一种脑胶质母细胞瘤患者生存期预测系统
本公开涉及计算机应用技术,具体地,涉及一种脑胶质母细胞瘤患者生存期预测系统。
技术介绍
脑胶质瘤是中枢神经系统最常见的恶性肿瘤,其中恶性程度最高的胶质母细胞瘤占脑胶质瘤整体发病率的30%以上。胶质母细胞瘤具有发病率、致死率、复发率高和治愈率低的特点。目前胶质母细胞瘤的治疗方案包括手术切除和术后放化疗,以往国内外文献报道胶质母细胞瘤病人中位生存期为12-15个月。但是在临床实践中病人生存时间存在较大差别,其中15%的病人可存活超过3年,9%的病人可存活超过5年,如此大跨度的生存时限极大地增加了准确预测病人生存期的难度。准确的预测病人生存期具有重要的临床、科研及社会价值。在临床工作中,准确的生存期预测可指导医生针对高风险病人制定个性化的检查及治疗方案,帮助医生制定合理的复查及随访计划,进而提高医疗服务的质量。在科研中,准确的预测病人风险层级,可以为研发针对高风险病人的有效治疗方案提供重要依据,并且可以成为检验新型治疗效果的重要方法。从社会角度来说,准确预测病患生存期,可为病患及家属提供科学的生存预期,指引病人依从治疗计划,避免过度医疗,减轻家庭经济压力,有助于改善医患关系。目前,脑胶质母细胞瘤临床实践中尚缺少一种简单可靠的工具,能够提供综合的、可靠的生存预测。针对现有不足,亟需一种适用于中国人群的、结合分子诊疗优势的胶质母细胞瘤生存预测系统,更加全面准确的预测胶质母细胞瘤病人生存时间。
技术实现思路
本公开的目的是提供一种预测系统,该系统可以准确预测胶质母瘤病人生存时间,为医疗服务提供指导。为了实现上述目的,本公开提供一种脑胶质母细胞瘤患者生存期预测系统,所述预测系统包括:变量输入模块,所述变量输入模块包括五个变量输入子模块,所述五个变量输入子模块为卡氏功能评分输入子模块、肿瘤切除程度输入子模块、MGMT基因启动子甲基化程度输入子模块、IDH基因状态输入子模块和替莫唑胺治疗策略输入子模块;所述分析模块能够基于所述变量输入模块输入的变量建立生存概率列线图并计算总风险分值,所述总风险分值为卡氏功能评分、肿瘤切除程度、MGMT基因启动子甲基化状态、IDH基因状态和替莫唑胺治疗策略的风险分值的累加和;根据所述总风险分值计算脑胶质母细胞瘤患者生存期预测值;所述输出模块用于输出脑胶质母细胞瘤患者生存期预测值。通过上述技术方案,本公开所提出的脑胶质母细胞瘤患者生存期预测系统将临床上易获得的变量综合起来,输入所述五个变量即可快速准确的获得脑胶质母细胞瘤患者生存期的预测结果,节约了使用者的时间与精力。优选地,基于所述变量输入模块输入的变量建立生存概率列线图的方法为应用R语言RMS运算包完成Cox回归模型的列线图可视化。所述生存概率列线图中卡氏功能评分、肿瘤切除程度、MGMT基因启动子甲基化状态、IDH基因状态和替莫唑胺治疗策略分别对应不同的风险分值范围。计算上述5项变量的累加和为总风险分值,在总风险分值的位置画垂直线,所述垂直线与6月生存率线的交点为患者6月生存率的概率,同样方法可以得到患者的1年,2年及3年生存率。不同的总风险分值对应不同的6月、1年,2年及3年生存率。优选的,所述卡氏功能评分对应的风险分值的计算方法如式(1)所示,,所述脑胶质母细胞瘤患者的KPS评分为a,风险分值为b:在所述肿瘤切除程度为完全切除时,所述肿瘤切除程度对应的风险分值为0;在所述肿瘤切除程度为次全切除时,所述肿瘤切除程度对应的风险分值为30;在所述MGMT基因启动子甲基化状态为高甲基化时,所述MGMT基因启动子甲基化状态对应的风险分值为0;在所述MGMT基因启动子甲基化状态为野生型时,所述MGMT基因启动子甲基化状态对应的风险分值为25;在所述IDH基因状态为突变时,所述IDH基因状态对应的风险分值为0;在所述IDH基因状态为野生型时,所述IDH基因状态对应的风险分值为35;在所述替莫唑胺治疗策略为接受替莫唑胺治疗时,所述替莫唑胺治疗策略对应的风险分值为0;在所述替莫唑胺治疗策略为未接受替莫唑胺治疗时,替莫唑胺治疗策略对应的风险分值为39。其中所述分析模块可以为电脑主机、中央处理器或网络服务器等,所述输出模块为显示器、打印机或音频输出装置。优选地,所述MGMT基因启动子甲基化状态输入子模块、IDH基因状态输入子模块为基因芯片读取装置。采用基因芯片装置可以方便的一次获取多个信息。优选地,所述输入模块和所述分析模块之间通过有线方式和/或无线方式连接。优选地,其中,所述分析模块和所述输出模块之间通过有线方式和/或无线方式连接。其中,无线连接方式可以为无线局域网、蓝牙、红外线等;有线连接方式可以为固话网络等。采用前述连接方式可以大大方便使用者对预测装置的使用,同时可以借助日益发展的信息技术和日益普及的网络资源为脑胶质母细胞瘤患者的生存期作出准确预测。本公开的其他特征和优点将在随后的具体实施方式部分予以详细说明。附图说明附图是用来提供对本公开的进一步理解,并且构成说明书的一部分,与下面的具体实施方式一起用于解释本公开,但并不构成对本公开的限制。在附图中:图1是预测系统示意图。图2是建立脑胶质母细胞瘤患者生存期预测模型的流程图。图3是脑胶质母细胞瘤患者的生存概率列线图。图4是脑胶质母细胞瘤患者生存概率列线图所预测的生存概率和患者实际生存概率之间的校准曲线。具体实施方式以下对本公开的具体实施方式进行详细说明。应当理解的是,此处所描述的具体实施方式仅用于说明和解释本公开,并不用于限制本公开。如图1所示,本公开的脑胶质母细胞瘤患者的生存期预测系统包括输入模块、分析模块和输出模块,所述输入模块与分析模块、分析模块与输出模块之间可以通过有线连接(USB、固化线路等)和/或无线连接(WIFI、蓝牙、红外线等)。所述输入模块中又包含有五个变量输入子模块,所述五个变量输入子模块为卡氏功能评分(记为KPS评分)输入子模块、肿瘤切除程度输入子模块、MGMT基因启动子甲基化程度输入子模块、IDH基因状态输入子模块和替莫唑胺治疗策略输入子模块;其中,所述输入模块可以采用键盘、鼠标、触摸屏等装置;所述MGMT基因启动子甲基化程度输入子模块、IDH基因状态输入子模块也可以采用基因芯片读取装置来获取MGMT启动子甲基化程度和IDH基因状态的直接信息;所述分析模块可以采用中央处理器或者网络服务器来计算生存期;所述输出模块将所述生存期的预测结果输出,可以采用显示器、打印机或音频输出装置等。本公开中所述脑胶质母细胞瘤患者生存期预测计算通过如图2所示的流程得到。为了筛选出影响脑胶质母细胞瘤患者生存期的变量,根据收集的191例脑胶质母细胞瘤患者由生存到死亡的随访信息,其中191例脑胶质母细胞瘤患者的最长随访时间为8.4年。筛选出部分可能与患者生存期相关的临床数据,包括年龄、性别、卡氏功能评分、肿瘤切除程度、MGMT启动子甲基化程度、IDH基因状态、治疗策略和肿瘤位置,用于后续生存期预测模型的建立,根据所建立的生存期预测模型进行准确地及归一化的预测。建立脑胶质母细胞瘤患者的生存期预测模型的具体步骤为:(1)应用单因素Cox回归分析可能与患者生存期相关的临床数据,包括年龄、性别、卡氏功能评分、肿瘤切除程度、MGMT启动子甲基化程度、IDH基因状态、本文档来自技高网...
一种脑胶质母细胞瘤患者生存期预测系统

【技术保护点】
一种脑胶质母细胞瘤患者生存期预测系统,其特征在于,所述预测系统包括:输入模块,所述输入模块包括五个变量输入子模块,所述五个变量输入子模块为卡氏功能评分输入子模块、肿瘤切除程度输入子模块、MGMT基因启动子甲基化状态输入子模块、IDH基因状态输入子模块和替莫唑胺治疗策略输入子模块;分析模块,所述分析模块能够基于所述变量输入模块输入的变量建立生存概率列线图并计算总风险分值,所述总风险分值为卡氏功能评分、肿瘤切除程度、MGMT基因启动子甲基化状态、IDH基因状态和替莫唑胺治疗策略的风险分值的累加和;根据所述总风险分值计算脑胶质母细胞瘤患者生存期预测值;输出模块,所述输出模块用于输出脑胶质母细胞瘤患者生存期预测值。

【技术特征摘要】
1.一种脑胶质母细胞瘤患者生存期预测系统,其特征在于,所述预测系统包括:输入模块,所述输入模块包括五个变量输入子模块,所述五个变量输入子模块为卡氏功能评分输入子模块、肿瘤切除程度输入子模块、MGMT基因启动子甲基化状态输入子模块、IDH基因状态输入子模块和替莫唑胺治疗策略输入子模块;分析模块,所述分析模块能够基于所述变量输入模块输入的变量建立生存概率列线图并计算总风险分值,所述总风险分值为卡氏功能评分、肿瘤切除程度、MGMT基因启动子甲基化状态、IDH基因状态和替莫唑胺治疗策略的风险分值的累加和;根据所述总风险分值计算脑胶质母细胞瘤患者生存期预测值;输出模块,所述输出模块用于输出脑胶质母细胞瘤患者生存期预测值。2.根据权利要求1所述的预测系统,其中,基于所述变量输入模块输入的变量建立生存概率列线图的方法为应用R语言RMS运算包完成Cox回归模型的列线图可视化。3.根据权利要求1所述的预测系统,其中,所述卡氏功能评分对应的风险分值的计算方法如式(1)所示,所述脑胶质母细胞瘤患者的卡氏功能评分为a,风险分值为b:b=100-[(a-20)/8]×100式(1);在所述肿瘤切除程度为完全切除时,所述肿瘤切除程度对应的风险分值为0;在所述肿瘤切除程度为...

【专利技术属性】
技术研发人员:程文张传宝吴安华
申请(专利权)人:吴安华
类型:发明
国别省市:辽宁,21

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