【技术实现步骤摘要】
一种预测胶质母细胞瘤免疫微环境、预后及治疗敏感性的基因集及系统和方法
[0001]本专利技术属于生物医学专业领域,具体涉及一种预测胶质母细胞瘤免疫微环境、预后及治疗敏感性的基因集及系统和方法。
技术介绍
[0002]胶质瘤是原发性CNS肿瘤中最常见的恶性肿瘤,按其病理学分类可以分为低级别胶质瘤(LGG,WHO II
‑
III级)和高级别胶质瘤(GBM,WHO IV级)。其中胶质母细胞瘤恶性程度最高,预后最差,具有进展迅速、肿瘤增殖侵袭能力强、易复发的特点。即使患者手术并辅助以标准放化疗,其中位生存期也仅约为14个月。由于肿瘤的发生,肿瘤组织分泌的趋化因子,以及肿瘤组织中血管生成,肿瘤发生破坏血脑屏障等原因,使得胶质瘤中出现了大量的免疫细胞。而这些浸润到肿瘤组织中的免疫细胞,大部分都丧失其原有的肿瘤杀伤功能,甚至高表达抑制性免疫检查点来抑制免疫细胞对于肿瘤细胞的杀伤。
[0003]不同级别胶质瘤患者之间,同一级别不同胶质瘤患者之间,免疫微环境都存在明显异质性,而针对肿瘤微环境的研究是肿瘤个体化治疗的关 ...
【技术保护点】
【技术特征摘要】
1.一种预测胶质母细胞瘤免疫微环境、预后及治疗敏感性的基因集,其特征在于,所述基因集包括CD276、IL
‑
15、SLC11A1、TNFSF4和TREML2共5个基因。2.一种预测胶质母细胞瘤免疫微环境、预后的系统,其特征在于,所述系统包括输入模块、分析模块和输出模块,分析模块数据通信连接输入模块和输出模块;所述输入模块用于输入胶质母细胞瘤样本的转录组表达数据;所述分析模块基于胶质母细胞瘤样本的基因表达数据采用式I计算标准化风险评分RS*并根据标准化风险评分的分值预测胶质母细胞瘤样本的免疫微环境、预后情况:RS
*
=(RS
‑
8.7401)/4.4757(I)其中,RS为T细胞活化相关风险评分,采用式II计算:RS=(0.5258
×
E
CD276
)+(0.1477
×
E
IL
‑
15
)+(0.2178
×
E
SLC11A1
)+(0.2346
×
E
TNFSF4
)+(0.2192
×
E
TREML2
)(II)其中,E
CD276
、E
IL
‑
15
、E
SLC11A1
、E
TNFSF4
和E
TREML2
分别为胶质母细胞瘤样本中基因CD276、IL
‑
15、SLC11A1、TNFSF4和TREML2的表达量;所述输出模块用于输出胶质母细胞瘤样本的免疫微环境和预后情况。3.一种预测胶质母细胞瘤治疗敏感性的系统,其特征在于,所述系统包括输入模块、分析模块和输出模块,分析模块数据通信连接输入模块和输出模块;所述输入模块用于输入胶质母细胞瘤样本的转录组表达数据;所述分析模块基于胶质母细胞瘤样本的基因表达数据采用式III计算免疫治疗评...
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