一种用于结肠腺癌的分子标志物制造技术

本发明专利技术公开了一种用于结肠腺癌的分子标志物，所述分子标志物为LOC105377352，其中LOC105377352在结肠腺癌患者中表达上调。本发明专利技术所提供的lncRNA标志物，可以用于结肠腺癌的早期诊断，具有较高的灵敏度和特异性。

A molecular marker used in colorectal adenocarcinoma

The present invention discloses a molecular marker for colon adenocarcinoma, the molecular marker LOC105377352, wherein LOC105377352 is upregulated in colon adenocarcinoma patients. The lncRNA marker provided by the invention can be used for the early diagnosis of colon adenocarcinoma, and has high sensitivity and specificity.

【技术实现步骤摘要】
一种用于结肠腺癌的分子标志物
本专利技术属于生物医药领域，涉及一种用于结肠腺癌的分子标志物，具体的涉及一种用于早期结肠腺癌的分子标志物LOC105377352。
技术介绍
结结肠癌是我国最常见的消化道恶性肿瘤之一，其发病率在我国居第三位，仅次于肺癌和胃癌，严重危害着人民健康。近年来，随着人民生活水平的不断提高，饮食习惯和饮食结构的改变以及人口老龄化，我国结肠癌的发病率和病死率均保持上升趋势。结肠癌的发生受到遗传和内外环境因素的作用，其发病是涉及到多个因素、多个步骤、多个阶段的综合复杂的病理过程，包括肠上皮细胞增殖、分化、凋亡和存活机制的紊乱。基因水平及表观遗传学改变是结肠癌发病的重要原因。在结肠癌的临床治疗中发现，相同病理类型、分期不同的患者，相同方案治疗其疗效、预后存在明显不同。因此积极探索结肠癌形成的分子机制，寻找预测其生物学行为的标志物对结肠癌的诊断和治疗具有重要意义。随着人类对肿瘤在基因和分子水平的深入认识，以及分子生物学的发展，人们逐渐发现lncRNA在肿瘤中的作用贯穿肿瘤的整个发生和发展的过程中。长链非编码RNA(longnoncodingRNA,lncRNA)是一类能在多种生物学过程中发挥调控作用的大分子ncRNA。其分布广泛，长度一般多于200个碱基，由于缺少有效开放阅读框(ORF)而无或很少有编码蛋白的能力。作为分子生物学中的一个全新领域，lncRNA是以RNA的形式在多个层面上发挥调控基因表达的作用，主要是在表观遗传调控、转录调控以及转录后调控三个层面进行调控。lncRNA既可对癌细胞的周期、凋亡、转移等产生影响，也可在表观遗传的层面上宏观调控肿瘤细胞的很多特征。由于lncRNA与肿瘤的发生和发展有重要关系，人们看到了它在肿瘤的诊治中可能具有的重大潜力。诊断方面，在肿瘤组织中往往有lncRNA的异常表达，其可能成为重要的肿瘤标志物，尤其在一些肿瘤的早期，由于肿瘤组织很小，传统的影像学方法很难发现。而通过检测样本中的某种lncRNA水平，却可以方便快速了解病人患某种肿瘤的可能性。目前，lncRNA的研究还处于起步阶段，对其机制和功能的认识也还在探索之中。lncRNA不仅在生物体中发挥各种重要的生物学功能，同时也参与多种疾病的发生和发展。在肿瘤研究领域，lncRNA仍是一个相对未知的领域，我们需要通过对lncRNA的不断研究来为肿瘤的诊治提供新的契机。
技术实现思路
为了弥补现有技术的不足，本专利技术的目的之一，提供一种早期结肠腺癌的诊断产品，使患者在早期就得以预防，进而提高生存率和生活质量。本专利技术的目的之二，提供一种分子标志物，作为临床应用的检测指标。为了实现上述目的，本专利技术采用如下技术方案：本专利技术提供了长链非编码RNALOC105377352在制备诊断早期结肠腺癌的产品中的应用。本专利技术中，LOC105377352指基因或从该基因转录的mRNA，在人类中，位于4号染色体长臂2区4带。该基因具有7个注释转录本(或剪接变体)：长5110bp的LOC105377352-001(转录本ID为XR001741411.1.1)、长4634bp的LOC105377352-002(转录本ID为XR_001741410.1.1)、长4531bp的LOC105377352-003(转录本ID为XR_939038.2.1)、长3540bp的转录本LOC105377352-004(转录本ID为XR_001741412.1.1)、长3463bp的转录本LOC105377352-005(转录本ID为XR_001741414.1.1)、长3401的转录本LOC105377352-006(转录本ID为XR_939040.2.1)和长1785bp的转录本LOC105377352-007(转录本ID为XR_001741413.1.1)。进一步，所述LOC105377352基因产物为长转录物，其序列如SEQIDNO.1所示。进一步，所述LOC105377352在结肠腺癌患者中表达上调。进一步，所述诊断早期结肠腺癌的产品包括：通过测序技术、核酸杂交技术、核酸扩增技术或免疫测定的方法检测LOC105377352基因的表达水平。进一步，所述核酸扩增技术选自聚合酶链式反应、逆转录聚合酶链式反应、转录介导的扩增、连接酶链式反应、链置换扩增和基于核酸序列的扩增。本专利技术提供了一种体外检测样品中lncRNALOC105377352表达水平的产品，其特征在于所述产品包括制剂、芯片、或试剂盒。进一步，所述制剂、芯片或试剂盒包括针对LOC105377352的特异性引物对或探针。其中，所述芯片包括：固相载体；以及有序固定在所述固相载体上的寡核苷酸探针，所述寡核苷酸探针特异性地对应于上面所述的lncRNA的部分或全部序列。固相载体包括(但不限于)玻璃片、硅片、聚丙烯膜、硝酸纤维素膜、尼龙膜或聚苯乙烯膜。进一步，所述特异性引物对的序列如SEQIDNo.2和SEQIDNo.3所示。进一步，所述特异性引物对用于SYBRGreen、Taqman探针、分子信标、双杂交探针、复合探针的检测。本专利技术提供了上面所述的产品在制备诊断早期结肠腺癌的工具中的应用。本专利技术的优点和有益效果：本专利技术首次发现了与早期结肠腺癌发生发展相关的lncRNA，通过检测该lncRNA的表达水平即可对早期结肠腺癌进行检测，从而对早期结肠腺癌患者进行治疗，提高患者的生存质量。本专利技术提供了一种诊断早期结肠腺癌的产品，有利于结肠腺癌的早发现，进而实现早治疗，提供患者的生活质量，降低治疗成本。附图说明图1是利用高通量测序检测结肠腺癌患者中的基因LOC105377352差异表达图；图2是利用QPCR检测LOC105377352在结肠腺癌患者中的表达情况图。具体的实施方式本专利技术经过广泛而深入的研究，通过高通量方法，采用目前覆盖数据库最广的芯片，检测基因在早期结肠腺癌患者中的表达情况，发现其中具有明显表达差异的lncRNA片段，探讨其与结肠腺癌的发生发展之间的关系，从而为结肠腺癌的早期检测寻找更好的途径和方法。通过筛选，本专利技术首次发现了结肠腺癌中的LOC105377352表达显著性上调，通过QPCR进行大样本的验证，进一步证实，该基因为早期结肠腺癌的特异性基因。分子标志物“分子标志物”是其在组织或细胞中的表达水平与正常或健康细胞或组织的表达水平相比发生改变的任何基因。本领域技术人员将认识到，本专利技术的实用性并不局限于对本专利技术的标志物基因的任何特定变体的基因表达进行定量。作为非限制性的实例，标志物基因可具有SEQIDNO.1指定的核苷酸序列。在一些实施方案中，其具有与所列的序列至少85％相同或相似的cDNA序列诸如上述所列的序列至少90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％或至少99％相同或相似的cDNA序列。本专利技术可以利用本领域内已知的任何方法测定基因表达。本领域技术人员应当理解，测定基因表达的手段不是本专利技术的重要方面。可以在转录水平上检测生物标志物的表达水平。LOC105377352基因本专利技术中，LOC105377352指基因或从该基因转录的mRNA，在人类中，位于4号染色体长臂2区4带。该基因具有7个注释转录本(或剪接变体)。在具体的实施方案中，LOC105377352本文档来自技高网...

【技术保护点】
长链非编码RNA LOC105377352在制备诊断早期结肠腺癌的产品中的应用。

【技术特征摘要】
1.长链非编码RNALOC105377352在制备诊断早期结肠腺癌的产品中的应用。2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述LOC105377352的序列如SEQIDNO.1所示。3.根据权利要求1或2所述的应用，其特征在于，所述LOC105377352在结肠腺癌患者中表达上调。4.根据权利要求1或2所述的应用，其特征在于，所述产品包括：通过测序技术、核酸杂交技术、核酸扩增技术或免疫测定的方法检测LOC105377352基因的表达水平。5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，所述核酸扩增技术选自聚合酶链式反应、逆转录聚合酶链式反应、转录介导的扩增、连接酶链式反应、链置换扩增和基于核酸序列的...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘继喜，刘芳，谭煌英，
申请(专利权)人：中日友好医院，
类型：发明
国别省市：北京,11